مقاله پژوهشی: بررسی تاثیر دمای محیط بر پدیده رونویسی ژن: نمای لیاپانوف

سال انتشار: 1403
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 202

فایل این مقاله در 24 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

JR_JAPAZ-14-1_003

تاریخ نمایه سازی: 14 بهمن 1402

چکیده مقاله:

بیان ژن به عنوان پدیده­ای شناخته می­شود که زندگی انسان را شکل می­دهد. این پدیده بسیار پیچیده، از دو مرحله رونویسی و ترجمه شکل گرفته است. با توجه به اینکه دما ساعت زمانی سیستم­های زیست­شناختی است، در مطالعه حاضر، تاثیر دمای محیط از راه ترموستات نوز- هوور در الگو سازی ریاضی بیان ژن انجام شده است. در کار حاضر از رویکرد نمای لیاپانوف برای بررسی اثر کمیت­های کنترل بر بیان ژن، از جمله سرعت تخریب mRNA و پروتئین ها، یافتن نقاط بحرانی (محدودیت های مرزی پدیده)، مقادیر مرزی سطح mRNA و پروتئین استفاده شده است. سرعت تخریب در فرآیند سنتز پروتئین با کمک رویکرد نمای لیاپانوف بررسی شده است. این مطالعه نشان داد که دمای ۳۰۶ کلوین دارای بیشینه سطح رونویسی mRNA برای باکتری اشریشیا کلی است. همچنین از راه رویکرد آشوب تایید شد که افزایش نرخ تخریب mRNA منجر به افزایش رونویسی و در نتیجه افزایش آشوبناکی سیستم می شود.

نویسندگان

فاطمه نعمتی

دانشجوی دکتری، گروه فیزیک، دانشگاه صنعتی ارومیه، ارومیه، ایران

سهراب بهنیا

استاد، گروه فیزیک، دانشگاه صنعتی ارومیه، ارومیه، ایران

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Dadpasand, , "Genes related to heat stress and the effect ...
  • Duong, L., Anastasopoulos, A., Chiang, D., Bird, S., & Cohn, ...
  • Krebs, J. E., Goldstein, E. S., & Kilpatrick, S. T., ...
  • Glass, D. S., Jin, X., & Riedel-Kruse, I. H., "Nonlinear ...
  • Voolstra, C. R., Schnetzer, J., Peshkin, L., Randall, C. J., ...
  • Lo, M., Bulach, D. M., Powell, D. R., Haake, D. ...
  • Chen, J., Nolte, V., & Schlötterer, C., "Temperature-related reaction norms ...
  • Politis, S. N., Mazurais, D., Servili, A., Zambonino-Infante, J. L., ...
  • Gadgil, M., Kapur, V., & Hu, W. S., "Transcriptional response ...
  • Wimalasiri-Yapa, B. R., Barrero, R. A., Stassen, L., Hafner, L. ...
  • Smoot, L. M., Smoot, J. C., Graham, M. R., Somerville, ...
  • Wang, X., Han, J. N., Zhang, X., Ma, Y. Y., ...
  • Park, K., & Kwak, I. S., "The effect of temperature ...
  • Franke, K., Karl, I., Centeno, T. P., Feldmeyer, B., Lassek, ...
  • Malek, R. L., Sajadi, H., Abraham, J., Grundy, M. A., ...
  • Scheffer, H., Coate, J. E., Ho, E. K., & Schaack, ...
  • Ko, M. S., "A stochastic model for gene induction", Journal ...
  • Akutsu, T., Miyano, S., & Kuhara, S., "Identification of genetic ...
  • Peccoud, J., & Ycart, B., "Markovian modeling of gene-product synthesis, ...
  • Chen, H. L. He, G. M. Church, “Modeling gene expression ...
  • Murphy, K., & Mian, S., "Modelling gene expression data using ...
  • Kim, P. M., & Tidor, B., "Limitations of quantitative gene ...
  • Monk, N. A., "Oscillatory expression of Hes۱, p۵۳, and NF-B ...
  • Miller, E., pham, Hunt, J., Laplace, L., "A continuous model ...
  • Shen, J., Liu, Z., Zheng, W., Xu, F., & Chen, ...
  • Peng, Y., Zhang, T., In Abstract and Applied Analysis. ۲۰۱۴ ...
  • Huang, C., Cao, J., & Xiao, M., "Hybrid control on ...
  • Munakata, T., "Mechanical and Langevin thermostats: Gulton staircase problem", Physical ...
  • Lemak, A. S., & Balabaev, N. K., "On the Berendsen ...
  • Behnia, S., Nemati, F., & Fathizadeh, S., "Modulation of spin ...
  • Charny, C. K., "Mathematical models of bioheat transfer", Advances in ...
  • Chato, J. C., "Fundamentals of bioheat transfer", In Thermal dosimetry ...
  • Pennes, H. H., "Analysis of tissue and arterial blood temperatures ...
  • Wulff, W., "The energy conservation equation for living tissue", IEEE ...
  • Chen, M. M., & Holmes, K. R., "Microvascular contributions in ...
  • Weinbaum, S., & Jiji, L. M., "A new simplified bioheat ...
  • Damor, R. S., Kumar, S., & Shukla, A. K., "Solution ...
  • Ferrás, L. L., Ford, N. J., Morgado, M. L., Nóbrega, ...
  • Goodwin, B. C., "Oscillatory behavior in enzymatic control processes", Advances ...
  • Ratkowsky, D. A., Lowry, R. K., McMeekin, T. A., Stokes, ...
  • Ross, T., "A philosophy for the development of kinetic models ...
  • Blanchard, G. F., Guarini, J. M., Richard, P., Ph, G., ...
  • Norberg, "Biodiversity and ecosystem functioning: a complex adaptive systems approach", ...
  • Ratkowsky, D. A., Olley, J., McMeekin, T. A., & Ball, ...
  • Charlebois, D. A., Hauser, K., Marshall, S., & Balázsi, G., ...
  • Ke, Q., Gong, X., Liao, S., Duan, C., & Li, ...
  • Braga, C., & Travis, K. P., "A configurational temperature nos´e-hoover ...
  • Patra, P. K., & Bhattacharya, B., "Nonergodicity of the nose-hoover ...
  • Strogatz, H., "Nonlinear dynamics and chaos: with applications to physics, ...
  • Hilborn, C., "Chaos and nonlinear dynamics: an introduction for scientists ...
  • Wolf, A., Swift, J. B., Swinney, H. L., & Vastano, ...
  • Lin, J., & Amir, A., "Homeostasis of protein and mRNA ...
  • Buccitelli, C., & Selbach, M., mRNAs, "proteins and the emerging ...
  • Asseng, S., Spänkuch, D., Hernandez-Ochoa, I. M., & Laporta, J., ...
  • Kumar, P., & Libchaber, A., "Pressure and temperature dependence of ...
  • Schiraldi, C., De Rosa, M., "Mesophilic organisms", Encyclopedia of membranes, ...
  • Agarwal, V., & Kelley, D. R., "The genetic and biochemical ...
  • Miller, D., Brandt, N., & Gresham, D., "Systematic identification of ...
  • Yamada, T., Nagahama, M., & Akimitsu, N., "Interplay between transcription ...
  • Haimovich, G., Medina, D. A., Causse, S. Z., Garber, M., ...
  • Shao, W., Guo, T., Toussaint, N. C., Xue, P., Wagner, ...
  • Schoenberg, D. R., & Maquat, L. E., "Regulation of cytoplasmic ...
  • Fabian, M. R., Sonenberg, N., & Filipowicz, W., "Regulation of ...
  • Nouaille, S., Mondeil, S., Finoux, A. L., Moulis, C., Girbal, ...
  • Yang, E., van Nimwegen, E., Zavolan, M., Rajewsky, N., Schroeder, ...
  • Leppek, K., Byeon, G. W., Kladwang, W., Wayment-Steele, H. K., ...
  • نمایش کامل مراجع