مکانیسم مهاری پروتئین AKR۱C۳ و طراحی نوین مهارکننده ها در بیماری های سرطان و التهابی
سال انتشار: 1402
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 118
فایل این مقاله در 12 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد
- صدور گواهی نمایه سازی
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
JR_NCMBJ-13-52_003
تاریخ نمایه سازی: 10 بهمن 1402
چکیده مقاله:
سابقه و هدف: پروتئین AKR۱C۳ نقش کلیدی در بیماری های مختلف، به خصوص سرطان، ایفا می کند. در سرطان های وابسته به هورمون و بیماری های التهابی، این پروتئین مهم است. فعالیت افزایش یافته AKR۱C۳ ممکن است به افزایش هورمون های آلدهسترون و تستوسترون و همچنین تولید مواد التهابی منجر شود. به عنوان یک هدف در توسعه داروهای جدید در درمان سرطان و بیماری های التهابی، تحقیقات برروی مهار AKR۱C۳ و طراحی داروهای نوین در حال انجام است. بنابراین هدف از تحقیق حاضر بررسی مکانیسم مهاری پروتئین AKR۱C۳ و طراحی مهارکنندههای جدید میباشد.
مواد و روش ها: در پژوهش حاضر با استفاده از سیستمهای مولکولی ساختار سه بعدی AKR۱C۳ از بانک اطلاعات ساختار سه بعدی پروتئین گرفته شد. سپس ساختار به دست آمده با استفاده از تکنیک دینامیک مولکولی بهینهسازی شد و در ادامه برهمکنش های پروتئین با مهار کننده های موجود با استفاده از تکنیک داکینگ و نرم افزار Autodock۴ مورد بررسی قرار گرفتند. در ادامه به منظور انجام دینامیک مولکولی از نرم افزار AMBER نسخه ۱۸ استفاده شد. در نهایت ۴ ترکیب مهار کننده جدید با نرم افزار Data Warrior به عنوان مهارکنندههای جدید طراحی شده و برای مهار AKR۱C۳ معرفی شد.
یافتهها: اسید آمینههای تیروزین ۵۵ و هیستیدین ۱۱۷ در تشکیل پیوندهای هیدروژنی قوی با مهارکنندههای طراحی شده نقش دارند و همچنین اسکن آلانین نشان داد که برهمکنشهای مشابهی بین اسید آمینههای پروتئین با ترکیبات مهار کننده طراحی شده نسبت به ترکیبات شناخته شده دارند و اسیدآمینههای تیروزین ۵۵، هیستیدین ۱۱۷ و فنیل آلانین ۳۱۱ نقشی مهم در برهمکنش پروتئین با مهار کنندههای طراحی شده دارند. بررسی انرژی اتصال این ترکیبات به پروتئین نشان داد که مقادیر انرژی اتصال این ترکیبات با پروتئین AKR۱C۳ در محدوده ۸/۱۷- تا ۱/۲۹- کیلوکالری بر مول میباشد که میتوانند به خوبی قابل رقابت با مهار کننده های شناخته شده پروتئین باشند. همچنین ساختار طراحی شده D۱ با انرژی اتصال ۹/۳۲-کیلوکالری بر مول توانست بیشتر میزان تمایل به پروتئین در میان ترکیبات مهار کننده شناخته شده و طراحی شده در این مطالعه را نشان دهد که میتواند آن را به عنوان یک ترکیب با پتانسیل بالا برای مهار پروتئین AKR۱C۳ در مطالعات آزمایشگاهی و بالینی معرفی نماید.
نتیجه گیری: نتایج حاصل از بررسی های داکینگ و دینامیک مولکولی نشان دادند ترکیبات جدید که بر پایه مفنامیک اسید ایجاد شده اند، می توانند ترکیبات بالقوه ای برای مهار پروتئین AKR۱C۳ باشند و با ایجاد تغییرات مناسب در آن ها می توان از این ترکیبات هدف بعنوان ترکیبات موثری برای مهار و مبارزه با بیماری از جمله بیماری التهابی استفاده نمود .
کلیدواژه ها:
نویسندگان
فرزاد عطریان افیانی
Department of Animal Science, Science and Research Branch, Islamic Azad University, Tehran, Iran
مراجع و منابع این مقاله:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :