Terpenoid Biosynthetic Pathway in Ferula persica Using Transcriptome Analysis and Metabolome Data
محل انتشار: مجله علوم و فناوری کشاورزی، دوره: 26، شماره: 1
سال انتشار: 1402
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: انگلیسی
مشاهده: 127
فایل این مقاله در 16 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد
- صدور گواهی نمایه سازی
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
JR_JASTMO-26-1_014
تاریخ نمایه سازی: 8 بهمن 1402
چکیده مقاله:
An effort was made to analyze metabolome and transcriptome profiles of Ferula persica via GC-MS and RNA-seq data. The analysis of the essential oils extracted from both flower and root tissues demonstrated the prominence of monoterpene constituents, while sesquiterpene compounds were present in the lower magnitudes. Considering transcriptome analysis, ۲۱۲۷ differentially expressed genes were found between root and flower: ۳۹۶ transcripts were up-regulated in root, while ۱۷۳۱ exhibited an up-regulation pattern in flower. Out of ۲۱۲۷ transcripts, ۸۶ were annotated as Terpene Synthases (TPSs), of which ۸۳ TPSs were classified subsequently into five individual sub-families of TPS-a (۳۳), TPS-b (۴۲), TPS-c (۲), TPSe-f (۳), and TPS-g (۳). Several transcription factor families were recognized among the differentially expressed genes, suggesting their direct or indirect regulatory roles for the biosynthesis of terpenoids in F. persica. Finally, according to our phylogenetic results, both F. assa-foetida and F. gummosa were placed in the same clade, while F. persica was lonely settled in one monophyletic clade, with the estimated divergence time of ۲.۹۹ Million Years Ago (MYA) between F. gummosa and F. assa-foetida, and ۳.۸۷ MYA between F. persica and two other Ferula species.
کلیدواژه ها:
نویسندگان
J. Nasiri
Nuclear Agriculture Research School, Nuclear Science and Technology Research Institute, AEOI, P. O. Box: ۳۱۴۸۵-۴۹۸, Karaj, Islamic Republic of Iran.
M. R. Naghavi
Department of Agronomy and Plant Breeding, Agricultural and Natural Resources College, University of Tehran, Karaj, Islamic Republic of Iran.
A. Soorni
Department of Biotechnology, College of Agriculture, Isfahan University of Technology, Isfahan ۸۴۱۵۶-۸۳۱۱۱, Islamic Republic of Iran.
D. J. van Dijk
Plant Sciences Group, Wageningen University, Wageningen, The Netherlands.
مراجع و منابع این مقاله:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :