تکنیک RT-PCR در تعیین کمی بیان ژن ها و کاربرد نرم افزار LinRegPCR در آنالیز داده های RT-PCR

کمی سازی بیان ژن ها با استفاده از روش ریل تایم (RT-PCR) PCR انجام می شود. در محاسبه نتایج حاصل از واکنش RT-PCR برای محاسبه کارایی پرایمر و کارآیی PCR می توان از رسم منحنی استاندارد و نرم افزار LineRegPCR استفاده کرد. در رسم منحنی استاندارد غلظت RNA استاندارد تعیین می شود. در مرحله بعد از این نمونه استاندارد RNA چندسری رقت متوالی تهیه شده و برای این نمونه ها ریل تایم گذاشته می شود که این امر مستلزم صرف هزینه مواد می باشد. نرم افزار LineRegPCR داده های ریل تایم را بررسی نموده و به وسیله رگرسیون خطی و تخمین شیب (slope) خط رگرسیون برای هر نمونه ، میزان کارایی پرایمرها و میزان کارآیی PCR را محاسبه می کند. با توجه به این که هر دو روشنتایج تقریبا یکسانی بدست می آید. بنابراین ، به جای روش پرهزینه رسم منحنی استاندارد می توان از نرم افزار LineRegPCR در محاسبه نتایج حاصل از واکنش RT-PCR استفاده کرد

کلیدواژه ها:

کارآیی PCR ، کارایی پرایمر ، RT-PCR ، نرم افزار .LineRegPCR