جایگاه نسب شناسی جدایه استان لرستان ایران ویروس برگ بادبزنی انگور

پاکباز س، درویش نیا م، نقوی ا (۱۴۰۰) جایگاه نسب­ شناسی جدایه استان لرستان ایران ویروس برگ بادبزنی انگور. دانش بیماری شناسی گیاهی ۱۱(۱):۱۲-۱.             ۱۰.۲۹۸۲/PPS.۱۱.۱.۱ Doi:    مقدمه: ویروس برگ بادبزنی(GFLV) یک ویروس مهم آلوده کننده انگور در جهان است. مواد و روش ها: انگورهای دارای نشانه GFLV از حومه شهر خرم آباد در استان لرستان ایران،  در بهار ۱۳۹۹ نمونه برداری شدند و آزمون RT-PCR جهت تکثیر ژن GFLV-CP آنها انجام و محصول واکنش توالی یابی شد. یافته ها: آغازگرهای اختصاصی توانستند قطعه ای به طول bp ۱۵۱۵ مربوط به ژن CP را تکثیر کنند. بر اساس توالی نوکلئوتیدی این قطعه، GFLV برای نخستین بار در این منطقه شناسایی شد. تشابه ترادف نوکلئوتیدی این جدایه به میزان ۶۴/۹۵ -۱۴/۸۹ درصد با دیگر جدایه های موجود در بانک ژن NCBI تشخیص داده شد. همچنین در درخت نسب­ شناسی  این جدایه ­ها بر اساس ناحیه ژنومی CP، جدایه های GFLV در دو گروه I و II خوشه بندی شدند. جدایه لرستان GFLV همراه با جدایه های GFLV متعلق به ناحیه شمال غربی کشور و جدایه شهر تاکستان در یک زیرشاخه در گروه I قرار گرفتند و جدایه های مربوط به سایر کشورها نیز در این گروه در یک زیرشاخه مجزا قرار گرفتند. همچنین جدایه های شرق کشور و استان های فارس و کهگیلویه و بویراحمد نیز در گروه II و در زیرشاخه های متفاوت قرار گرفتند. نتیجه گیری: یافته­ های این پژوهش بیانگر بومی بودن ویروس، خاستگاه احتمالی آن از ایران و سپس گسترش آن به سایر نقاط دنیا و نیز اثر جدایی جغرافیایی در تکامل GFLV می باشد.

کلیدواژه ها:

GFLV ، RT-PCR ، Sequencing ،  توالی یابی ، GFLV ، RT-PCR