Transcript analysis of some pathogenicity-related elements in an Iranian A* isolate of Xanthomonas citri subsp. citri

سال انتشار: 1391
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: انگلیسی
مشاهده: 57

فایل این مقاله در 11 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

JR_JCP-1-4_009

تاریخ نمایه سازی: 13 آبان 1402

چکیده مقاله:

Asiatic citrus canker is a devastating disease resulting in drastic economic losses in citriculture worldwide. Amongst three different types of the disease, i.e. A, A* and Aw, the A* type is genetically less known. In order to comprehend the behavior of the Asiatic citrus canker A*-type strain (Xanthomonas citri subsp. citri) in the vicinity of the host cells, a targeted semi-quantitative transcript analysis approach via RT-PCR was carried out. A subset of sixteen genes, as representative of different steps involved in phytopathogencity, was analyzed on the culture medium (as uninduced) and compared with the subset isolated from the infected Mexican lime (Citrus auarntifolia L.) plants (as induced). The results showed that certain genes were up-regulated in induced condition, suggesting a putative role in bacteria-host interaction. Furthermore, the transcripts in induced condition could be classified into constitutive, early- and late-responsive genes, demonstrating their functional relevance during the host-pathogen interaction.

کلیدواژه ها:

نویسندگان

Raana Roohani

Department of Plant Biotechnology, National Institute for Genetic Engineering and Biotechnology (NIGEB), P. O. Box: ۱۴۱۵۵-۶۳۴۳, Tehran, Iran

Masood Soltani Najafabadi

Oil Seeds Research Department, Seed and Plant Improvement Institute (SPII), Karaj, Iran

Seyed Mehdi Alavi

Dept. of Plant Biotechnology, National Institute for Genetic Engineering and Biotechnology (NIGEB)

Naser Farrokhi

Department of Agronomy and Plant Breeding, Faculty of Agricultural Engineering, Shahrood University of Technology, P. O. Box: ۳۶۱۹۹۹۵۱۶, Shahrood, Iran

Masoud Shams-Bakhsh

Plant Pathology Dept., Faculty of Agriculture, Tarbiat Modares University (T. M. U.), Tehran-Iran

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Alfano, J. R. and Collmer, A. ۱۹۹۷. The type III ...
  • Al-Saadi, A., Reddy, D., Duan, Y. P., Brunings, A. M., ...
  • Astua-Monge, G., Freitas-Astua, J., Bacocina, G., Roncoletta, J., Carvalho, S. ...
  • Barber, C. E., Tang, J. L., Feng, J. X., Pan, ...
  • Bock, C. H., Graham, J. H., Gottwald, T. R., Cook, ...
  • Brunings, A. M. and Gabriel, D. W. ۲۰۰۳. Xanthomonas citri: ...
  • Bui Thi Ngoc, L., Verniere, C., Jouen, E., Ah-You, N., ...
  • Buttner, D. and Bonas, U. ۲۰۰۲. Getting across-bacterial type III ...
  • Cornelis, G. R. ۲۰۰۶. The type III secretion injectisome. Nature ...
  • Cubero, J. and Graham, J. H. ۲۰۰۲. Genetic relationship among ...
  • da Silva, A. C., Ferro, J. A., Reinach, F. C., ...
  • Deng, W. L. and Huang, H. C. ۱۹۹۹. Cellular locations ...
  • Diggle, S. P., Gardner, A., West, S. A. and Griffin, ...
  • Fones, H. and Preston, G. M. ۲۰۱۱. Reactive oxygen and ...
  • Gonzalez, J. M. and Robb, F. T. ۲۰۰۷. Counterselection of ...
  • Guo, Y., Figueiredo, F., Jones, J. and Wang, N. ۲۰۱۱. ...
  • He, Y. W., Ng, A. Y., Xu, M., Lin, K., ...
  • Iwamoto, M. and Oku, T. ۲۰۰۰. Cloning and molecular characterization ...
  • Kanamori, H. and Tsuyumu, S. ۱۹۹۸. Comparison of nucleotide sequence ...
  • Kay, S. and Bonas, U. ۲۰۰۹. How Xanthomonas type III ...
  • Kim, Y. C., Miller, C. D. and Anderson, A. ۱۹۹۹. ...
  • Laia, M. L., Moreira, L. M., Dezajacomo, J., Brigati, J. ...
  • Leduc, L. and Roberts, G. P. ۲۰۰۹. Cyclic di-GMP allosterically ...
  • Lin, Y. C., Hsu, S. T. and Huang, H. C. ...
  • Malamud, F. Torres, P. S., Roeschlin, R., Rigano, L. A., ...
  • Mehta, A. and Rosato, Y. B. ۲۰۰۳. A simple method ...
  • Miller, M. B. and Bassler, B. L. ۲۰۰۱. Quorum sensing ...
  • Neiditch, M. B. and Hughson, F. M. ۲۰۰۷. The regulation ...
  • Pandey, A. and Sonti, R. V. ۲۰۱۰. Role of the ...
  • Qian, W., Han, Z. J., Tao, J. and He, C. ...
  • Qian, W., Jia, Y., Ren, S. X., He, Y. Q., ...
  • Rezaei, M. K., Shams-Bakhsh, M. and Alizadeh, A. ۲۰۱۲. Genetic ...
  • Rossier, O., Van den Ackerveken, G. and Bonas, U. ۲۰۰۰. ...
  • Rozen, S. and Skaletsky, H. J. ۲۰۰۰. Primer۳ on the ...
  • Ryan, R. P., Vorholter, F. J., Potnis, N., Jones, J. ...
  • Schaad, N. W., Postikova, E., Lacy, H., Sechler, A., Agarkova, ...
  • Schulz, S. and Buttner, D. ۲۰۱۱. Functional characterization of the ...
  • Shiotania, H., Uematsub, H., Tsukamotob, T., Shimizub, Y., Uedab, K., ...
  • Soltaninejad, H., Parchami, N., Alavi, S. M. and Ghasemi, A. ...
  • Swarup, S., Yang, Y., Kingsley, M. T. and Gabriel, D. ...
  • Traoré, Y. N., Ngoc, L. B. T., Vernière, C. and ...
  • Verniere, C., Hartung, J. S., Pruvost, O., Civerolo, E. L., ...
  • Vojnov, A. A., do Amaral, A. M., Dow, J. M., ...
  • Weber, E. and Koebnik, R. ۲۰۰۵. Domain structure of HrpE, ...
  • Yamazaki, A., Hirata, H. and Tsuyumu, S. ۲۰۰۸. Type III ...
  • Yang, B., Sugio, A. and White, F. F. ۲۰۰۵. Avoidance ...
  • Alfano, J. R. and Collmer, A. ۱۹۹۷. The type III ...
  • Al-Saadi, A., Reddy, D., Duan, Y. P., Brunings, A. M., ...
  • Astua-Monge, G., Freitas-Astua, J., Bacocina, G., Roncoletta, J., Carvalho, S. ...
  • Barber, C. E., Tang, J. L., Feng, J. X., Pan, ...
  • Bock, C. H., Graham, J. H., Gottwald, T. R., Cook, ...
  • Brunings, A. M. and Gabriel, D. W. ۲۰۰۳. Xanthomonas citri: ...
  • Bui Thi Ngoc, L., Verniere, C., Jouen, E., Ah-You, N., ...
  • Buttner, D. and Bonas, U. ۲۰۰۲. Getting across-bacterial type III ...
  • Cornelis, G. R. ۲۰۰۶. The type III secretion injectisome. Nature ...
  • Cubero, J. and Graham, J. H. ۲۰۰۲. Genetic relationship among ...
  • da Silva, A. C., Ferro, J. A., Reinach, F. C., ...
  • Deng, W. L. and Huang, H. C. ۱۹۹۹. Cellular locations ...
  • Diggle, S. P., Gardner, A., West, S. A. and Griffin, ...
  • Fones, H. and Preston, G. M. ۲۰۱۱. Reactive oxygen and ...
  • Gonzalez, J. M. and Robb, F. T. ۲۰۰۷. Counterselection of ...
  • Guo, Y., Figueiredo, F., Jones, J. and Wang, N. ۲۰۱۱. ...
  • He, Y. W., Ng, A. Y., Xu, M., Lin, K., ...
  • Iwamoto, M. and Oku, T. ۲۰۰۰. Cloning and molecular characterization ...
  • Kanamori, H. and Tsuyumu, S. ۱۹۹۸. Comparison of nucleotide sequence ...
  • Kay, S. and Bonas, U. ۲۰۰۹. How Xanthomonas type III ...
  • Kim, Y. C., Miller, C. D. and Anderson, A. ۱۹۹۹. ...
  • Laia, M. L., Moreira, L. M., Dezajacomo, J., Brigati, J. ...
  • Leduc, L. and Roberts, G. P. ۲۰۰۹. Cyclic di-GMP allosterically ...
  • Lin, Y. C., Hsu, S. T. and Huang, H. C. ...
  • Malamud, F. Torres, P. S., Roeschlin, R., Rigano, L. A., ...
  • Mehta, A. and Rosato, Y. B. ۲۰۰۳. A simple method ...
  • Miller, M. B. and Bassler, B. L. ۲۰۰۱. Quorum sensing ...
  • Neiditch, M. B. and Hughson, F. M. ۲۰۰۷. The regulation ...
  • Pandey, A. and Sonti, R. V. ۲۰۱۰. Role of the ...
  • Qian, W., Han, Z. J., Tao, J. and He, C. ...
  • Qian, W., Jia, Y., Ren, S. X., He, Y. Q., ...
  • Rezaei, M. K., Shams-Bakhsh, M. and Alizadeh, A. ۲۰۱۲. Genetic ...
  • Rossier, O., Van den Ackerveken, G. and Bonas, U. ۲۰۰۰. ...
  • Rozen, S. and Skaletsky, H. J. ۲۰۰۰. Primer۳ on the ...
  • Ryan, R. P., Vorholter, F. J., Potnis, N., Jones, J. ...
  • Schaad, N. W., Postikova, E., Lacy, H., Sechler, A., Agarkova, ...
  • Schulz, S. and Buttner, D. ۲۰۱۱. Functional characterization of the ...
  • Shiotania, H., Uematsub, H., Tsukamotob, T., Shimizub, Y., Uedab, K., ...
  • Soltaninejad, H., Parchami, N., Alavi, S. M. and Ghasemi, A. ...
  • Swarup, S., Yang, Y., Kingsley, M. T. and Gabriel, D. ...
  • Traoré, Y. N., Ngoc, L. B. T., Vernière, C. and ...
  • Verniere, C., Hartung, J. S., Pruvost, O., Civerolo, E. L., ...
  • Vojnov, A. A., do Amaral, A. M., Dow, J. M., ...
  • Weber, E. and Koebnik, R. ۲۰۰۵. Domain structure of HrpE, ...
  • Yamazaki, A., Hirata, H. and Tsuyumu, S. ۲۰۰۸. Type III ...
  • Yang, B., Sugio, A. and White, F. F. ۲۰۰۵. Avoidance ...
  • نمایش کامل مراجع