آنالیز بیوانفورماتیکی برای پیش بینی میکرو RNA های بالقوه مهارکننده فرایندهای رگزایی در سرطان

زمینه و هدف : با افزایش اندازه تومور، محیط سلولهای توموری هیپوکسیک و اسیدیک شده و سلول ها شروع به افزایش تولید چندین نوع عامل رشد میکنند که در نتیجه آن تشکیل رگهای خونی موضعی آغاز میشود. به دنبال آن متاستاز سلول های سرطانی از طریق عروق خونی اتفاق می افتد، لذا مهار رگزایی می تواند روش جدیدی برای درمان سرطان باشد. این مطالعه به منظور آنالیز بیوانفورماتیکی برای پیش بینی میکرو RNA های بالقوه مهارکننده فرایندهای رگزایی در سرطان انجام گردید. روش بررسی : در این مطالعه توصیفی میکرو RNA هایی با قابلیت اتصال به ژن های MMP دخیل در رگزایی تومور (MMP۱-۲-۳-۸-۹-۱۰-۱۱-۱۳) با استفاده از پایگاه داده mirwalk شناسایی گردید. انتخاب micro RNA های موثر براساس تعداد جایگاه اتصال آنها به ۳'UTR ژن ها انجام شد. برای تعیین توالی مکمل ژن نمونه با micro RNA های منتخب از پایگاه داده Microrna استفاده گردید. یافته ها : بیشترین تعداد جایگاه اتصال به ژن های دخیل در رگزایی تومور mir-۱۳۰۲ ، mir-۵۱۶a ، mir-۵۱۲ ، mir-۵۱۱ ، mir-۵۱۶b و mir-۵۴۸ تعیین شد. نتیجه گیری : micro RNA ها گزینه های مناسبی برای کشت سلولی و بررسی آزمایشگاهی به منظور یافتن راه های جدید پیشگیری از پیشرفت سرطان از طریق مهار رگزایی هستند.

کلیدواژه ها:

Bioinformatics ، Angiogenesis ، MMPs ، MicroRNA ، بیوانفورماتیک ، رگزایی ، ماتریکس متالوپروتئیناز ، micro RNA