تغییرات نوکلئوتیدی توالی ژن کدکننده پروتئین چند عملکردی X در فرد مبتلا به ویروس هپاتیت B

زمینه و هدف : عفونت مزمن با ویروس هپاتیت B (HBV) یکی از عوامل اصلی در ایجاد سیروز و سرطان سلول کبدی است. بیماری زایی ویروس به وسیله پروتئین چندعملکردی x (HBx) صورت می گیرد. تغییر در توالی ژن کدکننده این پروتئین باعث تنظیم فاکتورهای نسخه برداری و بیماری زایی می شود. این مطالعه به منظور آنالیز ژنتیک تکاملی ژن کدکننده HBx در فرد مبتلا به HBV مزمن انجام شد. روش بررسی : در این مطالعه توصیفی آزمایشگاهی ابتدا از فرد آلوده به عفونت مزمن با ویروس هپاتیت B توالی کامل کدکننده HBx تکثیر و کلون شد. سپس با توالی های مرجع ژنوتیپ ها، سروتیپ ها و زیرسروتیپ های مختلف ویروس موجود در پایگاه GenBank، همردیفی توسط نرم افزار CLC Sequence Viewer انجام شد. از نتیجه هم ردیفی برای رسم درخت فیلوژنیک توسط سرور T-rex و آنالیز ژنتیک جمعیت توسط نرم افزار DnaSP استفاده شد. انتخاب طبیعی در سطح نوکلئوتید و پروتئین توسط تست Tajima’s D انجام گردید. یافته ها : جهش شناخته شده ای در سطح پروتئین در توالی کدکننده HBx فرد آلوده مزمن یافت نشد. نتایج انتخاب طبیعی نشان دهنده جهش های خنثی در ژن HBx بود. نتایج فیلوژنی نشان داد توالی کدکننده HBx در فرد آلوده مزمن قرابت ژنتیکی به ژنوتیپ D و زیرسروتیپ ayw۲ داشت. نتیجه گیری : چندریختی انتخاب طبیعی در ژن کدکننده HBx رخ می دهد. همچنین نتیجه فیلوژنی مطالعه حاضر با یافته های پیشین استان گلستان و ایران که فراوانی ژنوتیپ D و زیرسروتیپ ayw۲ را گزارش داده اند؛ مطابقت دارد.

کلیدواژه ها:

Hepatitis B virus ، HBx ، Population genetics ، DnaSP ، Genotype D ، Serotype ayw۲ ، ویروس هپاتیت B پروتئین چندعملکردی x ، ژنتیک جمعیت ، DnaSP ، ژنوتیپ D ، سروتیپ ayw۲