برر سی بیوانفورماتیکی microRNA های موثر بر برخی از ژن های مسیر بیوسنتز کاروتئویئدها و چرخه انتقال لکترون طی تنش خشکی در گیاه کلزا (.Brassica napus. L)

کلزا (Brassica napus) حا وی مهم ترین دانه ی روغنی در اروپا و دومین دانه ی روغنی مهم در دنیا پس از سویا است. از محصول اینگونه درابتدا فقط برای غذای دام و علوفه استفاده می شد ولی اخیرا به عنوان محصولی زیستی توجه ها را به خود جلب کرده است. خشکی عامل اصلیمحدود کننده ی کشت کلزا است و مشاهده شد که مقدار آب عاملی کلیدی در رشد و بازدهی این گیاه است. در پاسخ به کم آبی گیاه دچارتغییراتی فیزیولوژیکی ازجمله کاهش فشار تورگور سلول، کاهش سطح برگ، بستن روزنه ها و د رنهایت کاهش تنفس و فتوسنتز می شود در اینمطالعه microRNA های موثر بر سه ژن از مسیر بیوسنتز کاروتنوئیدها و یک ژن از جریان خطی انتقال الکترون حول فتوسیستم ۱ در گیاهکلزا مورد بررسی قرار گرفتند. درمجموع ۱۳۰ microRNA شناسایی شد که ۴۹ مورد مربوط به لیکوپن بتا سیکلاز(LCY) است و ۲۶ موردمربوط به زآزانتین اپوکسیداز (ZE) است و برای ژن های ویولازانتین دی اپوکسیداز (VDE) و فردوکسین NADP ردوکتاز (FNR) به ترتیب ۲۶و ۲۴ microRNA شناسایی شد. دیده شد که بر ای LCY بیشترین فراوانی microRNA مربوط به خانواده miR۱۶۵/۱۶۶ است. بیشترینفراوانی microRNA برای ژن VDE مربوط به miR۳۹۸ است. همچنین فراوانترین microRNA های پیدا شده بر ای ZE miR۱۷۰ وmiR۱۷۱ هستند و بر ای ژن FNR miR۱۵۸ است .

کلیدواژه ها:

خشکی ، کلزا ، مسیر بیوسنتز کاروتنوئیدها ، psRNATarget