بررسی تنوع ژنتیکی جمعیت های بومی جو وحشی H. Spontaneum با استفاده از نشانگر مولکولی EST-SSR

هومن شیروانی; علی اشرف مهرابی; محسن فرشادفر; هوشمند صفری; علی آرمینیان; فواد فاتحی

بررسی تنوع ژنتیکی جمعیت های بومی جو وحشی H. Spontaneum با استفاده از نشانگر مولکولی EST-SSR

محل انتشار: پژوهشنامه اصلاح گیاهان زراعی، دوره: 15، شماره: 45

سال انتشار: 1402

نوع سند: مقاله ژورنالی

زبان: فارسی

مشاهده: 182

فایل این مقاله در 13 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

دریافت فایل کامل مقاله

صدور گواهی نمایه سازی
من نویسنده این مقاله هستم

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

https://civilica.com/doc/1687169

شناسه ملی سند علمی:

JR_JCB-15-45_004

تاریخ نمایه سازی: 13 تیر 1402

چکیده مقاله:

چکیده مبسوط مقدمه و هدف: تنوع ژنتیکی گونه های وحشی مرتبط با خزانه ژنی اولیه جو برای بهره برداری در برنامه های اصلاحی بسیار حائز اهمیت است. جو زراعی (H. vulgar) و جد زراعی آن (H. spontaneum) سیستم مدل عالی و اقتصادی برای بررسی، اکتشاف و بهره برداری ژنتیکی می باشند. در تحقیق پیشرو تنوع ژنتیکی ۱۱۴ توده بومی جو وحشی جمع آوری شده از غرب کشور، توسط نشانگر مولکولی EST-SSR مورد بررسی قرار گرفته است که هدف بررسی میزان تنوع ژنتیکی این ژنوتیپ های بومی و ارزیابی کارایی این نشانگر در تعیین میزان تنوع ژنتیکی موجود در ژنوتیپ ها می باشد. مواد و روش ها: ابتدا به منظور استخراج DNA بذور در گلدان کشت گردید، استخراج DNA به روش CTAB تغییر یافته برای هر ژنوتیپ انجام شد. واکنش زنجیرهای پلیمراز (PCR) در حجم ۲۰ میکرولیتر انجام گرفت. محصول PCR جهت نمایان شده قطعات تکثیری در ژل آگارز ۴ درصد با بافر واکنش TBE یک درصد و رنگ Safe View تزریق گردید. به منظور انجام تجزیه و تحلیلهای آماری، داده های حاصل در قالب ماتریسی آماده شد و پارامترهای مرتبط با آغازگرها و جمعیت ها ارزیابی گردید. یافته ها: تعداد الل های تکثیر شده از ۲ تا ۴ الل برای نشانگرها متفاوت بود و آغازگرهای مورد بررسی در مجموع ۴۰ الل در ژنوتیپ های مورد بررسی با میانگین ۲/۸۵ به ازای هر نشانگر تکثیر کردند. متوسط درصد چند شکلی برای آغازگرهای مورد مطالعه برابر با ۹۶/۴۲ درصد بود. محتوی اطلاعات چند شکلی (PIC) از ۰/۳۹۷ تا ۰/۱۸۹ متغیر بود. نتایج نشان داد که بیشترین سطح تنوع در جمعیت های استان لرستان و کمترین تنوع در جمعیت های استان کردستان وجود دارد. دندروگرام حاصل از تجزیه خوشه ای ژنوتیپ ها را در ۱۴ گروه قرار داد که بر اساس گروه بندی تنوع ژنتیکی تا حدودی با پراکنش جغرافیایی تطبیق داشت. همچنین نتایج تجزیه به مختصات اصلی تا حدودی با تجزیه خوش های مطابقت داشت. نتیجه گیری: نتایج نشان داد تنوع خوبی در میان جمعیت های مورد بررسی وجود دارد. همچنین چند شکلی مناسبی نیز در بین آغازگرها مشاهده گردید. آغازگرهای GBM۱۲۲۱ با ۳ الل، GBM۱۴۶۱ با ۳ الل و SCSSR۰۴۱۶۳ با ۴ الل که بهترین چند شکلی را داشتند، به عنوان آغازگرهای برتر به منظور استفاده در تحقیقات بعدی جو معرفی میگردند. وجود تنوع ژنتیکی بالا در جمعیت های طبیعی جو وحشی H. spontaneum نشان می دهد که ژرم پلاسم این گیاه را می توان در رویشگاههای طبیعی حفاظت نمود. همچنین این تنوع منبع ارزشمندی برای شناسایی نشانگرهای مولکولی آگاهی بخش برای صفات مختلف فنوتیپی است.

کلیدواژه ها:

Diversity ، Genetic structure ، Molecular markers ، Wild Barleyre ، تنوع ، جو وحشی ، ساختار ژنتیکی ، نشانگر مولکولی

نویسندگان

هومن شیروانی

Department of Agronomy and Plant Breeding, Faculty of Agriculture, Ilam University, Iran

علی اشرف مهرابی

Ilam University and , Agricultural Research, Education and Extension Organization, Tehran, Iran

محسن فرشادفر

Department of Agriculture, Payame Noor University, Tehran, Iran

هوشمند صفری

of Forests and Rangelands Research Department, Agricultural Research and Training Center and Kermanshah Province, Agricultural Research, Education and Extension Organization, Kermanshah, Iran

علی آرمینیان

Department of Agronomy and Plant Breeding, Faculty of Agriculture, Ilam University, Iran

فواد فاتحی

Department of Agriculture, Payame Noor University, Tehran, Iran

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :

Altıntas, S., F. Toklu, S. Kafkas, B. Kilian, A. Brandolini ...
Anonymous. ۲۰۰۵. Barley Cultivation in Iran. Ministry of Jihade-e-Agriculture Publications. ...
Arya, L., M. Verma, S.K. Singh and R.P.S. Verma. ۲۰۱۹. ...
Babaian Jolodar, N.A., N. Mori and C. Nakamora. ۲۰۰۵. Transferability ...
Botstein, D., R.L. White, M. Skolnick and R.W. Davis. ۱۹۸۰. ...
Boyle, T. ۲۰۰۰. Criteria and indicators for the conservation of ...
Chai, L., M. K. Biswas, H. Yi, W. Guo and ...
Ebrahimi, A., M. Naqvi, M. Sabokdast and M, Mardi. ۲۰۱۰. ...
Feizi, M., M. Solouki, B. Sadeghzadeh, B. Fakheri and SA. ...
Ganjkhanlu, A., M. Moghadam, S.A. Mohammadi, M. Shiba, K. Ghasemi ...
Gong, X., S. Westcott, C. Li, G. Yan, R. Lance ...
Grime, J. ۲۰۰۲. Benefits of plant diversity to ecosystems: immediate, ...
Haj Mansour, Sh., M. Bi Hemmat, A.S. Nabipour, M. Abdullah, ...
Hasan, M., N. Odat, I. Qrunfleh, Y. Shakhatreh and S. ...
Hayes, P.M., A. Castro, L. Marquez-Cedillo, A. Corey, C. Henson, ...
Hou, Y., Z. Yan and Y. Wei. ۲۰۰۵. Genetic diversity ...
Ithadpour., M, M. Fattahi Moghaddam and Z. Zamani. ۲۰۱۲. Investigation ...
Jugran, A.K., I.D. Bhatt, R.S. Rawal, S.K. Nandia and V. ...
Karamzadeh, F. ۲۰۱۹. Genetic Diversity of Reversible Crossbreeding Families from ...
Kumar, A., P. Mishra, S.C. Singh and V. Sundaresan. ۲۰۱۳. ...
Kumar, M., G.P. Mishra, R. Singh, J. Kumar, P.K. Naik ...
Low, A., S. Harris and P. Ashton. ۲۰۰۴. Ecological genetics: ...
Manifesto, M.M., A.S. Schlatter, H.E. Hopp, E.Y. Suarez and J. ...
Matus, I.A. and P.M. Hayes. ۲۰۰۲. Genetic diversity in three ...
Mohammadi, S.A. and B.M. Prasanna. ۲۰۰۳. Analysis of genetic diversity ...
Morrel, P.L. ۲۰۱۱. Hordeum. pp. ۳۰۹-۳۲۰, In: C. Kole (Ed.), ...
Nandakumar, N., A.K. Singh, R.K. Sharma, T. Mohapatra, K.V. Prabhu ...
Nevo, E. and G. Chen. ۲۰۱۱. Drought and salt tolerances ...
Ozkan, H., S. Kafkas, M.S. Ozer and A. Brandolini. ۲۰۰۵. ...
Pazouki, L., M. Mardi, P. Salehi Shanjani, M. Hagidimitriou, S.M. ...
Poczai, P., I. Varga, M. Laos, A. Cseh, N. Bell, ...
Powell, W., M. Morgante, C. Ander, M. Hanafey, J. Vogel, ...
Raggi, L., E. Bitocchi, L. Russi, G. Marconi, T.F. Sharbel, ...
Roder, M.S., V. Korzun, K. Wendehake, J. Plaschke, M.H. Tixier, ...
Salehi Shanjani, P., M. Mardi, L. Pazouki, M. Hagidimitriou, D. ...
Salem, K.F.M., R.K. Varshney, M.S. Roder and A. Borner. ۲۰۱۰. ...
Satya, P., M. Karan, S. Jana, S. Mitra, A. Sharma, ...
Shakhatreh, Y., N. Haddad, M. Alrababah, S. Grando and S. ...
Shamsifar. S., R. Mirfakhraie and K. Haghpanah. ۲۰۲۱. Study on ...
Torres, AM., N.F. Weeden and A. Martin. ۱۹۹۳. Linkage among ...
Trindade, H., I. Sena, S. Goncalves and A. Romano. ۲۰۱۲. ...
Varshney, R.K., P. Langridge and A. Graner. ۲۰۰۷. Application of ...
Wang, H.Y., Y.M. Wei, Z.H. Yan and Y.L. Zheng. ۲۰۰۷. ...
Wang, P., L. Yang, E. Zhang, Z. Qin, H. Wang, ...
Weir, S. ۱۹۹۰. Genetic data analysis: Methods for Discrete Population ...
White, T.L., W.T. Adams and D.B. Neale, Forest Genetics, CABI ...
Xu, Y., ۲۰۱۰. Molecular Plant Breeding. Cabi Publishing. Wallingford, Oxford ...
Zhang, M., W. Mao, G. Zhang and F. Wu. ۲۰۱۴. ...
Altıntas, S., F. Toklu, S. Kafkas, B. Kilian, A. Brandolini ...
Anonymous. ۲۰۰۵. Barley Cultivation in Iran. Ministry of Jihade-e-Agriculture Publications. ...
Arya, L., M. Verma, S.K. Singh and R.P.S. Verma. ۲۰۱۹. ...
Babaian Jolodar, N.A., N. Mori and C. Nakamora. ۲۰۰۵. Transferability ...
Botstein, D., R.L. White, M. Skolnick and R.W. Davis. ۱۹۸۰. ...
Boyle, T. ۲۰۰۰. Criteria and indicators for the conservation of ...
Chai, L., M. K. Biswas, H. Yi, W. Guo and ...
Ebrahimi, A., M. Naqvi, M. Sabokdast and M, Mardi. ۲۰۱۰. ...
Feizi, M., M. Solouki, B. Sadeghzadeh, B. Fakheri and SA. ...
Ganjkhanlu, A., M. Moghadam, S.A. Mohammadi, M. Shiba, K. Ghasemi ...
Gong, X., S. Westcott, C. Li, G. Yan, R. Lance ...
Grime, J. ۲۰۰۲. Benefits of plant diversity to ecosystems: immediate, ...
Haj Mansour, Sh., M. Bi Hemmat, A.S. Nabipour, M. Abdullah, ...
Hasan, M., N. Odat, I. Qrunfleh, Y. Shakhatreh and S. ...
Hayes, P.M., A. Castro, L. Marquez-Cedillo, A. Corey, C. Henson, ...
Hou, Y., Z. Yan and Y. Wei. ۲۰۰۵. Genetic diversity ...
Ithadpour., M, M. Fattahi Moghaddam and Z. Zamani. ۲۰۱۲. Investigation ...
Jugran, A.K., I.D. Bhatt, R.S. Rawal, S.K. Nandia and V. ...
Karamzadeh, F. ۲۰۱۹. Genetic Diversity of Reversible Crossbreeding Families from ...
Kumar, A., P. Mishra, S.C. Singh and V. Sundaresan. ۲۰۱۳. ...
Kumar, M., G.P. Mishra, R. Singh, J. Kumar, P.K. Naik ...
Low, A., S. Harris and P. Ashton. ۲۰۰۴. Ecological genetics: ...
Manifesto, M.M., A.S. Schlatter, H.E. Hopp, E.Y. Suarez and J. ...
Matus, I.A. and P.M. Hayes. ۲۰۰۲. Genetic diversity in three ...
Mohammadi, S.A. and B.M. Prasanna. ۲۰۰۳. Analysis of genetic diversity ...
Morrel, P.L. ۲۰۱۱. Hordeum. pp. ۳۰۹-۳۲۰, In: C. Kole (Ed.), ...
Nandakumar, N., A.K. Singh, R.K. Sharma, T. Mohapatra, K.V. Prabhu ...
Nevo, E. and G. Chen. ۲۰۱۱. Drought and salt tolerances ...
Ozkan, H., S. Kafkas, M.S. Ozer and A. Brandolini. ۲۰۰۵. ...
Pazouki, L., M. Mardi, P. Salehi Shanjani, M. Hagidimitriou, S.M. ...
Poczai, P., I. Varga, M. Laos, A. Cseh, N. Bell, ...
Powell, W., M. Morgante, C. Ander, M. Hanafey, J. Vogel, ...
Raggi, L., E. Bitocchi, L. Russi, G. Marconi, T.F. Sharbel, ...
Roder, M.S., V. Korzun, K. Wendehake, J. Plaschke, M.H. Tixier, ...
Salehi Shanjani, P., M. Mardi, L. Pazouki, M. Hagidimitriou, D. ...
Salem, K.F.M., R.K. Varshney, M.S. Roder and A. Borner. ۲۰۱۰. ...
Satya, P., M. Karan, S. Jana, S. Mitra, A. Sharma, ...
Shakhatreh, Y., N. Haddad, M. Alrababah, S. Grando and S. ...
Shamsifar. S., R. Mirfakhraie and K. Haghpanah. ۲۰۲۱. Study on ...
Torres, AM., N.F. Weeden and A. Martin. ۱۹۹۳. Linkage among ...
Trindade, H., I. Sena, S. Goncalves and A. Romano. ۲۰۱۲. ...
Varshney, R.K., P. Langridge and A. Graner. ۲۰۰۷. Application of ...
Wang, H.Y., Y.M. Wei, Z.H. Yan and Y.L. Zheng. ۲۰۰۷. ...
Wang, P., L. Yang, E. Zhang, Z. Qin, H. Wang, ...
Weir, S. ۱۹۹۰. Genetic data analysis: Methods for Discrete Population ...
White, T.L., W.T. Adams and D.B. Neale, Forest Genetics, CABI ...
Xu, Y., ۲۰۱۰. Molecular Plant Breeding. Cabi Publishing. Wallingford, Oxford ...
Zhang, M., W. Mao, G. Zhang and F. Wu. ۲۰۱۴. ...

نمایش کامل مراجع