مطالعه ارتباطی در سطح ژنوم صفات گیاهچه ای در ارقام گندم نان تحت شرایط نرمال و تنش شوری

راضیه قربانی; راحله قاسم زاده; هادی علی پور

مطالعه ارتباطی در سطح ژنوم صفات گیاهچه ای در ارقام گندم نان تحت شرایط نرمال و تنش شوری

محل انتشار: مجله پژوهش های ژنتیک گیاهی، دوره: 9، شماره: 1

سال انتشار: 1401

نوع سند: مقاله ژورنالی

زبان: فارسی

مشاهده: 311

فایل این مقاله در 14 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

دریافت فایل کامل مقاله

صدور گواهی نمایه سازی
من نویسنده این مقاله هستم

این مقاله در بخشهای موضوعی زیر دسته بندی شده است:

کشاورزی > تنش شوری

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

https://civilica.com/doc/1635320

شناسه ملی سند علمی:

JR_PGRLU-9-1_002

تاریخ نمایه سازی: 29 فروردین 1402

چکیده مقاله:

به منظور شناسایی مکان های ژنی کنترل کننده صفات مورفو-فیزیولوژیک گیاهچه در ۸۸ رقم گندم نان، آزمایشی در شرایط نرمال و تنش شوری ۱۲۰ میلی مولار (معادل ۱۲ دسی زیمنس بر متر)، در قالب طرح آلفا لاتیس ساده در گلخانه دانشکده کشاورزی دانشگاه ارومیه در سال زراعی ۱۴۰۰-۱۳۹۹ انجام شد. صفات میزان کلروفیل a، b و کل، کا روتنوئید، پرولین، وزن تر و خشک گیاهچه، طول گیاهچه، محتوای نسبی آب برگ (RWC) و غلظت یون ها (سدیم، پتاسیم و نسبت پتاسیم به سدیم) اندازه گیری شدند. پس از ژنوتیپ سنجی به وسیله توالی یابی با فناوری Ion Torrent و حذف SNPهایی با بیش از ۲۰ درصد داده گمشده و فراوانی آلل جزئی کمتر از ۵ درصد، تعداد ۵۸۶۹ SNP شناسایی شد. بر اساس نقشه یابی ارتباطی با روش مدل خطی مخلوط (MLM) برای شرایط نرمال در مجموع ۲۵ ارتباط نشانگر-صفت (MTA) شناسایی شد. ژنوم A بیشترین و ژنوم D کمترین تعداد MTA را به خود اختصاص دادند. در بین صفات مورد بررسی در شرایط نرمال، کلروفیل a بیشترین تعداد MTA را روی کروموزوم های ۱A، ۳B، ۳D، ۵B و ۷A نشان داد و برای شرایط تنش شوری ۲۱ MTA شناسایی شد که ژنوم B بیشترین تعداد MTA و ژنوم D کمترین تعداد MTA را به خود اختصاص دادند. برای وزن تر گیاهچه پنج MTA شناسایی شد که روی کروموزوم های ۴A و ۶B قرار داشتند. نتایج پژوهش حاضر، اطلاعات ارزشمندی در ارتباط با مکان های ژنی مرتبط با صفات مورد مطالعه ارائه میدهد که می توان پس از تایید در جمعیت های دو والدی و آزمایش های تکمیلی، در برنامه های بهنژادی گندم در گزینش به کمک نشانگر از این یافته ها استفاده نمود.

کلیدواژه ها:

Bread wheat cultivars ، GWAS ، Salt stress ، SNP markers ، ارقام گندم نان ، تنش شوری ، نشانگرهای SNP ، نقشه یابی ارتباطی

نویسندگان

راضیه قربانی

Department of Plant Production and Genetics, Faculty of Agriculture, Urmia University, Urmia, Iran

راحله قاسم زاده

Department of Plant Production and Genetics, Faculty of Agriculture, Urmia University, Urmia, Iran

هادی علی پور

Department of Plant Production and Genetics, Faculty of Agriculture, Urmia University, Urmia, Iran

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :

Akbari Ghogdi, E., Izadi-Darbandi, A., Borzouei, A. and Majdabadi, A. ...
Akbarpour, O. and Dehghani, H. (۲۰۱۷). Genetic dissection of grain ...
Akhunov, E.D., Akhunova, A.R., Anderson, O.D., Anderson, J.A., Blake, N., ...
Alipour, H., (۲۰۱۶). Association mapping of important agronomic traits in ...
Barajehfard, M., Siahpoosh, M.R., and Modarresi, M. (۲۰۱۷). QTLs associated ...
Bates, L.S., Waldren, R.P. and Teare, I.D. (۱۹۷۳). Rapid determination ...
Bradbury, P.J., Zhang, Z., Kroon, D.E., Casstevens, T.M., Ramdoss, Y. ...
Chao, S., Dubcovsky, J., Dvorak, J., Luo, M.C., Baenziger, S.P., ...
Chartzoulakis, K. and Klapaki, G. (۲۰۰۰). Response of two greenhouse ...
Chaurasia, S., Singh, A.K., Songachan, L.S., Sharma, A.D., Bhardwaj, R. ...
Chen, X., Min, D., Yasir, T.A. and Hu, Y.G. (۲۰۱۲). ...
Edae, E.A., Byrne, P.F., Haley, S.D., Lopes, M.S. and Reynolds, ...
Edae, E.A., Bowden, R.L. and Poland, J. (۲۰۱۵). Application of ...
Ersoz, E.S., Yu, J. and Buckler, E.S. (۲۰۰۹). Applications of ...
Flint‐Garcia, S.A., Thuillet, A.C., Yu, J., Pressoir, G., Romero, S.M., ...
Flowers, T.J. (۲۰۰۴). Improving crop salt tolerance. Journal of Experimental ...
Gunes, A., Inal, A., Alpuslan, M., Fraslan, F., Guneri, E. ...
Hao, C., Wang, L., Ge, H., Dong, Y. and Zhang, ...
Hu, P., Zheng, Q., Luo, Q., Teng, W., Li, H., ...
Jighly, A., Oyiga, B.C., Makdis, F., Nazari, K., Youssef, O., ...
Long, N.V., Dolstra, O., Malosetti, M., Kilian, B., Graner, A., ...
Lu, F., Lipka, A.E., Glaubitz, J., Elshire, R., Cherney, J.H., ...
Ma, Y., Qiu, C.W., Fan, Y., Huang, X., Khan, W., ...
Marcussen, T., Sandve, S.R., Heier, L., Spannagl, M., Pfeifer, M., ...
Munns, R., Rebetzke, G.J., Husain, S., James, R.A. and Hare, ...
Naz, A.A., Dadshani, S., Ballvora, A., Pillen, K. and Léon, ...
Nielsen, N.H., Backes, G., Stougaard, J., Andersen, S.U. and Jahoor, ...
Poland, J.A., Brown, P.J., Sorrells, M.E. and Jannink, J.L. (۲۰۱۲). ...
Quan, X., Liu, J., Zhang, N., Xie, C., Li, H., ...
Rahnama Ghahfarokhi, A., Poostini, R., Tavakol Afshar, A., Ahmadi, V. ...
Salami, R., Mohammadi, S.A., Ghafarian, S., and Moghaddam, M. (۲۰۱۶). ...
Shahinnia, F., and Sayed Tabatabaei, B.E. (۲۰۱۳). EST-based marker discovery ...
Shavrukov, Y., Suchecki, R., Eliby, S., Abugalieva, A., Kenebayev, S. ...
Sun, C., Dong, Z., Zhao, L., Ren, Y., Zhang, N., ...
Turki, N., Shehzad, T., Harrabi, M and Okuno, K. (۲۰۱۵). ...
Wang, S., Wong, D., Forrest, K., Allen, A., Chao, S., ...
Warburton, M.L., Crossa, J., Franco, J., Kazi, M., Trethowan, R., ...
Würschum, T., Langer, S.M., Longin, C.F.H., Korzun, V., Akhunov, E., ...
Zeeshan, M., Lu, M., Sehar, S., Holford, P. and Wu, ...
Zegeye, H., Rasheed, A., Makdis, F., Badebo, A. and Ogbonnaya, ...
Zhang, L., Liu, D., Guo, X., Yang, W., Sun, J., ...
Akbari Ghogdi, E., Izadi-Darbandi, A., Borzouei, A. and Majdabadi, A. ...
Akbarpour, O. and Dehghani, H. (۲۰۱۷). Genetic dissection of grain ...
Akhunov, E.D., Akhunova, A.R., Anderson, O.D., Anderson, J.A., Blake, N., ...
Alipour, H., (۲۰۱۶). Association mapping of important agronomic traits in ...
Barajehfard, M., Siahpoosh, M.R., and Modarresi, M. (۲۰۱۷). QTLs associated ...
Bates, L.S., Waldren, R.P. and Teare, I.D. (۱۹۷۳). Rapid determination ...
Bradbury, P.J., Zhang, Z., Kroon, D.E., Casstevens, T.M., Ramdoss, Y. ...
Chao, S., Dubcovsky, J., Dvorak, J., Luo, M.C., Baenziger, S.P., ...
Chartzoulakis, K. and Klapaki, G. (۲۰۰۰). Response of two greenhouse ...
Chaurasia, S., Singh, A.K., Songachan, L.S., Sharma, A.D., Bhardwaj, R. ...
Chen, X., Min, D., Yasir, T.A. and Hu, Y.G. (۲۰۱۲). ...
Edae, E.A., Byrne, P.F., Haley, S.D., Lopes, M.S. and Reynolds, ...
Edae, E.A., Bowden, R.L. and Poland, J. (۲۰۱۵). Application of ...
Ersoz, E.S., Yu, J. and Buckler, E.S. (۲۰۰۹). Applications of ...
Flint‐Garcia, S.A., Thuillet, A.C., Yu, J., Pressoir, G., Romero, S.M., ...
Flowers, T.J. (۲۰۰۴). Improving crop salt tolerance. Journal of Experimental ...
Gunes, A., Inal, A., Alpuslan, M., Fraslan, F., Guneri, E. ...
Hao, C., Wang, L., Ge, H., Dong, Y. and Zhang, ...
Hu, P., Zheng, Q., Luo, Q., Teng, W., Li, H., ...
Jighly, A., Oyiga, B.C., Makdis, F., Nazari, K., Youssef, O., ...
Long, N.V., Dolstra, O., Malosetti, M., Kilian, B., Graner, A., ...
Lu, F., Lipka, A.E., Glaubitz, J., Elshire, R., Cherney, J.H., ...
Ma, Y., Qiu, C.W., Fan, Y., Huang, X., Khan, W., ...
Marcussen, T., Sandve, S.R., Heier, L., Spannagl, M., Pfeifer, M., ...
Munns, R., Rebetzke, G.J., Husain, S., James, R.A. and Hare, ...
Naz, A.A., Dadshani, S., Ballvora, A., Pillen, K. and Léon, ...
Nielsen, N.H., Backes, G., Stougaard, J., Andersen, S.U. and Jahoor, ...
Poland, J.A., Brown, P.J., Sorrells, M.E. and Jannink, J.L. (۲۰۱۲). ...
Quan, X., Liu, J., Zhang, N., Xie, C., Li, H., ...
Rahnama Ghahfarokhi, A., Poostini, R., Tavakol Afshar, A., Ahmadi, V. ...
Salami, R., Mohammadi, S.A., Ghafarian, S., and Moghaddam, M. (۲۰۱۶). ...
Shahinnia, F., and Sayed Tabatabaei, B.E. (۲۰۱۳). EST-based marker discovery ...
Shavrukov, Y., Suchecki, R., Eliby, S., Abugalieva, A., Kenebayev, S. ...
Sun, C., Dong, Z., Zhao, L., Ren, Y., Zhang, N., ...
Turki, N., Shehzad, T., Harrabi, M and Okuno, K. (۲۰۱۵). ...
Wang, S., Wong, D., Forrest, K., Allen, A., Chao, S., ...
Warburton, M.L., Crossa, J., Franco, J., Kazi, M., Trethowan, R., ...
Würschum, T., Langer, S.M., Longin, C.F.H., Korzun, V., Akhunov, E., ...
Zeeshan, M., Lu, M., Sehar, S., Holford, P. and Wu, ...
Zegeye, H., Rasheed, A., Makdis, F., Badebo, A. and Ogbonnaya, ...
Zhang, L., Liu, D., Guo, X., Yang, W., Sun, J., ...

نمایش کامل مراجع