ورود
مقالات فارسیISIکنفرانسهاژورنالها

ردیابی و تعیین خصوصیات ملکولی ویروئید فرورفتگی میوه سیب(Apple Dimple Viroid) در منطقه مراغه

محل انتشار: پژوهش های کاربردی در گیاه پزشکی، دوره: 7، شماره: 2
سال انتشار: 1397
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 147

فایل این مقاله در 13 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:
https://civilica.com/doc/1616182

شناسه ملی سند علمی:

JR_ARPP-7-2_009

تاریخ نمایه سازی: 15 اسفند 1401

چکیده مقاله:

چکیده در تابستان سال­های ۱۳۹۵ و ۱۳۹۶ تعداد ۷۳ نمونه با علائم مشابه با ویروئید فرورفتگی میوه سیب از ارقام گالا و رد دلیشیز منطقه­ی مراغه جمع­آوری شد. RNA کل از پوست ساقه و برگ نمونه­های جمع­آوری شده حاوی علایم لکه­های فرورفته و خال­های زرد با حاشیه نامنظم روی پوست میوه، استخراج گردید و با استفاده از آغازگرهای اختصاصی ژنوم کامل ویروئید به طول ۳۰۷-۳۰۶ جفت باز با آزمون RT-PCR تکثیر و ترادف ۱۰ نمونه تعیین گردید. جستجوی ترادف ها با BLASTn و هم­ردیف­سازی آنها با ترادف­های مربوطه در بانک ژن نشان داد که جدایه­های مورد مطالعه دارای بیشترین و کمترین یکسانی ترادف به میزان ۱۰۰ و ۴/۷۴ درصد بترتیب با رس شمارهای EF۰۸۸۶۶۲ (ایتالیا) و KF۷۸۸۲۹۱ (ایتالیا) می­باشند. بیشترین تفاوت نوکلئوتیدی در بین نواحی  CCRو TR قرار داشتند. آنالیز فیلوژنتیک با روش حداکثر احتمال نشان داد که جدایه های ایرانی به همراه جدایه­ها و واریانت­های گزارش شده از ایتالیا در یک گروه قرار می گیرند.

کلیدواژه ها:

نویسندگان

وحید رومی

استادیار گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه مراغه.

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • احمدی ک، قلیزاده ح، عبادزاده ح­ر، حاتمی ف، حسینپور ر، ...
  • Barba M, Hosakawa M, Wang QC, Taglienti A and Zhang ...
  • Chiumenti M, Torchetti EM, Di Serio F and Minafra A, ...
  • Choueiri E, El Zammar S, Jreijiri F, Hobeika C, Myrta ...
  • Dalakouras A, Dadami E, Wassenegger M, Krczal G and Wassenegger ...
  • Di Serio F, Aparicio F, Alioto D, Ragozzino A, and ...
  • Di Serio F, Flores R, Verhoeven J Th J, Li ...
  • Di Serio F, Malfitano M, Alioto D, Ragozzino A and ...
  • Diener TO ۱۹۷۱. Potato spindle tuber ‘‘virus’’ IV. A replicating ...
  • Ding B, ۲۰۰۹. The biology of viroid-host interactions. Annual Review ...
  • Felsenstein J, ۱۹۸۵. Confidence limits on phylogenies: An approach using ...
  • Flores R and Owens RA, ۲۰۰۸. Viroids. In: Mahy BWJ, ...
  • Flores R, Hernandez C, Martınez de Alba AE, Daro`s JA ...
  • Flores R, Randles JW, Bar-Joseph M and Diener TO, ۱۹۹۸. ...
  • Giguere T, Adkar-Purushothama CR and Perreault JP, ۲۰۱۴. Comprehensive Secondary ...
  • Giguere T and Perreault JP, ۲۰۱۷. Classification of the Pospiviroidae ...
  • Hadidi A, Flores R, Randles JW and Palukaitis P, ۲۰۱۷. ...
  • Hall TA, ۱۹۹۹. BioEdit: a user-friendly biological sequence alignment editor ...
  • Hao L, Xie J, Chen S, Wang S, Gong Z, ...
  • He YH, Isono S, Kawaguchi-Ito Y, Taneda A, Kondo K, ...
  • Ito T, Ieki H and Ozaki K. ۲۰۰۰. A population ...
  • Keese P and Symons RH, ۱۹۸۵. Domains in viroids: evidence ...
  • Kimura M, ۱۹۸۰. A simple method for estimating evolutionary rate ...
  • Kumar S, Stecher G, and Tamura K, ۲۰۱۶. MEGA۷: Molecular ...
  • Ling KS, ۲۰۱۷. Decontamination Measures to Prevent Mechanical Transmission of ...
  • Malfitano M, Alioto D, Ragozzino A, Di Serio F, and ...
  • Owens RA, Flores R, Di Serio F, Li S-F, Palla´s ...
  • Roumi V, Gazel M, and Caglayan K, ۲۰۱۷.First report of ...
  • Takeda R and Ding B. ۲۰۰۹. Viroid intercellular trafficking: RNA ...
  • Thompson JD, Higgins DG, and Gibson TJ, ۱۹۹۴. CLUSTAL W: ...
  • Vamenani R, Rahimian H, Alavi SM and Borhani B, ۲۰۱۵. ...
  • Ye T, Chen SY, Wang R, Hao L, Chen H, ...
    • نمایش کامل مراجع