بررسی خاصیت آنتی باکتل پیپرین فلفل سیاه

مقدمه: آنتی باکتل یا ضد میکروب و باکتری به موادی می گویند که میکرو ارگانسیم ها را از بین میبرند یا سرعت رشد آن ها را کاهش می دهند. در مطالعات زیادی گیاهان دارویی دارای خواص ضد میکروبی مورد توجه قرار گرفته اند. هدف از این پژوهش بررسی خواص آنتی باکتل ترکیب پپرین موجود در فلفل سیاه به روش بیوانفورماتیکی است.روش ها: در این پژوهش، در ابتدا ساختار ترکیب شیمیایی پپرین در نرم افزار هایپرکم ترسیم گردید و بهینه سازی انرژی با همان نرم افزار انجام گرفت با مراجعه به سایت https://www.rcsb.org ساختار کریستالوگرافی آنزیم dnaجیراز دانلود شد، به منظور مطالعات داکینگ و مشاهده جزئیات اتصال و تجزیه و تحلیل نهایی، به ترتیب از نرم افزارهای Discovery Studio و AutoDockTools استفاده شد .یافته ها: ترکیب مورد مطالعه با سطح انرژی اتصال -۹۹.۴ کیلو کالری بر مول در جایگاه فعال آنزیم dna قرار گرفت و پیوند هیدروژنی با اسید آمینه های ARG۱۳۶ وASP۷۳ برقرار کرد. در بررسی مولکول کوکریستال برهم کنش اسید آمینه های ARG۱۳۶و AS۷۳و ASN۴۶ در جایگاه فعال مشاهده میشود .نتیجه گیری: با توجه به عوارض جانبی کمتر ترکیبات گیاهی و این که ترکیب پپرین در بررسی داکینگ، با اسید آمینه ای مشابه با کوکریستال ARG۱۳۶) و(ASP۷۳ در جایگاه فغال برهم کنش دارد، میتواند ایده ی خوبی برای بررسی های بیشتر باشد.

کلیدواژه ها:

پیپرین ، آنزیم DNA جیراز ، مهارکننده ، داکینگ مولکولی ، بررسی بیوانفورماتیکی