تکنیک RT-PCR در تعیین کمی بیان ژنها و کاربرد نرم افزار LinRegPCR در آنالیز داده های RT-PCR

کمی سازی بیان ژنها با استفاده از روش ریل تایم (RT-PCR) PCR انجام میشود. در محاسبه نتایج حاصل از واکنش RT-PCR برای محاسبه کارایی پرایمر و کارآیی PCR می توان از رسم منحنی استاندارد و نرم افزار LineRegPCR استفاده کرد. در رسم منحنی استاندارد غلظت RNA استاندارد تعیین می شود. در مرحله بعد از این نمونه استاندارد RNA چند سری رقت متوالی تهیه شده و برای این نمونه ها ریل تایم گذاشته می شود که این امر مستلزم صرف هزینه مواد میباشد. نرم افزار LineRegPCR داده های ریل تایم را بررسی نموده و به وسیله رگرسیون خطی و تخمین شیب (slope) خط رگرسیون برای هر نمونه، میزان کارایی پرایمرها و میزان کارآیی PCR را محاسبه میکند. با توجه به اینکه هر دو روش نتایج تقریبا یکسانی بدست میآید. بنابراین، به جای روش پرهزینه رسم منحنی استاندارد میتوان از نرم افزار LineRegPCR در محاسبه نتایج حاصل از واکنش RT-PCR استفاده کرد.

کلیدواژه ها:

کارآیی PCR ، کارایی پرایمر ، RT-PCR ، نرم افزار .LineRegPCR