Molecular phylogenetic study of toxic cyanobacterium Anabaena sp. strain B۳ isolated from Lavasan Lake, Tehran (Iran)

سال انتشار: 1400
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: انگلیسی
مشاهده: 144

فایل این مقاله در 14 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

JR_ROST-22-1_010

تاریخ نمایه سازی: 23 مهر 1401

چکیده مقاله:

Lavasan Lake situated in the north-east of Tehran (Iran) is a complex ecosystem of cyanobacterial strains with an ability to produce a wide range of toxic natural compounds that may lead to many problems or even death of humans and animals. Based on the report of toxic cyanobacterial strains present in the Lavasan Lake, the morphological and phylogenetic study of the toxic strain purified from Lavasan Lake water, was performed using ۱۶S rRNA and ITS gene markers. According to the results, the phylogenetic tree was drawn based on ۱۶S rRNA gene, non-toxic strains with the toxic strain Anabaena sp. strain B۳ (CCC B۳) were not clustered within a cloud. In addition, the ability to produce toxins appears to be lost over time. The results of ITS gene analysis using Mfold showed that, the most important difference between the toxic strain Anabaena sp. B۳ with other non-toxic strains of Anabaena sp. has the number of nucleotides at terminal bilateral bulge and the number of loops at bilateral bulge in the D۱-D۱ helix. However, Box B helix structure was not different in any of the strains. This is the first report of molecular phylogeny of a toxin-producing cyanobacterium isolated from the Lavasan Lake.  

کلیدواژه ها:

Cluster ، Ecosystem ، Internal transcribed spacer (ITS) ، Structural genes ، ۱۶S rRNA

نویسندگان

مریم ریوندی

Master student of Genetic, Department of Genetics, Faculty of Advanced Science and Technology, Tehran Medical Sciences, Islamic Azad University, Tehran, Iran.

بهاره نوروزی

Assistant Prof., Department of Biotechnology, Science and Research Branch, Islamic Azad University, Tehran, Iran

حسین فهمیی

Assistant Prof., Department of Genetics, Faculty of Advanced Science and Technology, Tehran Medical Sciences, Islamic Azad University, Tehran, Iran

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Abbaspour, S., Nowruzi, B. & Hamdi, S.M. ۲۰۲۰. Optimizing the ...
  • Anand, N., Thajuddin, N. & Dadheech, P.K. ۲۰۱۹. Cyanobacterial Taxonomy: ...
  • Aráoz, R., Nghiêm, H.O., Rippka, R., Palibroda, N., de Marsac, ...
  • Berrendero Gómez, E., Johansen, J.R., Kaštovský, J., Bohunická, M. & ...
  • Bohunická, M., Pietrasiak, N., Johansen, J.R., Gómez, E.B., Hauer, T., ...
  • Boyer, S.L., Johansen, J.R., Flechtner, V.R. & Howard, G.L. ۲۰۰۲. ...
  • Brito, A., Ramos, V., Mota, R., Lima, S., Santos, A., ...
  • Cadel-Six, S., Peyraud-Thomas, C., Brient, L., De Marsac, N.T., Rippka, ...
  • Cai, F., Yang, Y., Wen, Q. & Li, R. ۲۰۱۸. ...
  • Furey, A., Crowley, J., Shuilleabhain, A.N., Skulberg, O.M. & James, ...
  • Galhano, V., De Figueiredo, D.R., Alves, A., Correia, A., Pereira, ...
  • González‐Resendiz, L., Johansen, J.R., Escobar‐Sánchez, V., Segal‐Kischinevzky, C., Jiménez‐García, L.F. ...
  • Gupta, S.K., Padmanabhan, B.R., Diene, S.M., Lopez-Rojas, R., Kempf, M., ...
  • Hentschke, G.S., Johansen, J.R., Pietrasiak, N., Fiore, M.D.F., Rigonato, J., ...
  • Hosseini, N., Akhavan, A. & Nowruzi, B. ۲۰۱۹. Detection and ...
  • Iteman, I., Rippka, R., de Marsac, N.T. & Herdman, M. ...
  • Jahodářová, E., Dvořák, P., Hašler, P., Holušová, K. & Poulíčková, ...
  • Jenke-Kodama, H., Börner, T. & Dittmann, E. ۲۰۰۶. Natural biocombinatorics ...
  • Johansen, J.R., Strunecký, O., Bohunická, M., Čapková, K.Č., Raabová, L., ...
  • Jafari Porzani, S., Konur, O. & Nowruzi, B. ۲۰۲۱. Cyanobacterial ...
  • Komárek, J. ۲۰۲۰. Quo vadis, taxonomy of cyanobacteria. Fottea ۲۰(۱): ...
  • Komárek, J. & Anagnostidis, K. ۱۹۸۹. Modern approach to the ...
  • Krienitz, L., Dadheech, P.K. & Kotut, K. ۲۰۱۳. Mass developments ...
  • Liu, L., Jokela, J., Wahlsten, M., Nowruzi, B., Permi, P., ...
  • León-Tejera, H.P., Gonzalez-Resendiz, L., Johansen, J.R., Segal-Kischinevsky, C.L.A.U.D.I.A., Escobar, V. ...
  • Mahansaria, A.P., Jaisankar, P. & Mukherjee, J. ۲۰۱۸. Oxynemaaestuarii sp. ...
  • Martins, M.D., Rigonato, J., Taboga, S.R. & Branco, L.H.Z. ۲۰۱۶. ...
  • Méjean, A., Peyraud-Thomas, C., Kerbrat, A.S., Golubic, S., Pauillac, S., ...
  • Mikalsen, B., Boison, G., Skulberg, O.M., Fastner, J., Davies, W., ...
  • Moustafa, A., Loram, J.E., Hackett, J.D., Anderson, D.M., Plumley, F.G. ...
  • Nowruzi, B. & Soares, F. ۲۰۲۱. Alborzia kermanshahica gen. nov., ...
  • Nowruzi, B. & Porzani, S.J. ۲۰۲۱. Toxic compounds produced by ...
  • Nowruzi, B. & Lorenzi, A.S. ۲۰۲۱a. Production of the neurotoxin ...
  • Nowruzi, B. & Lorenzi, A.S. ۲۰۲۱b. Characterization of a potentially ...
  • Nowruzi, B. & Shalygin, S. ۲۰۲۱. Multiple phylogenies reveal a ...
  • Nowruzi, B., Sarvari, G. & Blanco, S. ۲۰۲۰a. The cosmetic ...
  • Nowruzi, B., Sarvari, G. & Blanco, S. ۲۰۲۰b. Applications of ...
  • Nowruzi, B. ۲۰۲۰. Culturing of aquatic and terrestrial cyanobacteria. Research ...
  • Nowruzi, B. & Blanco, S. ۲۰۱۹. In silico identification and ...
  • Nowruzi, B., Wahlsten, M. & Jokela, J. ۲۰۱۹a. A report ...
  • Nowruzi, B., Akhavan Sepahi, A. & Soltani Savoji, G.S. ۲۰۱۹b. ...
  • Nowruzi, B., Haghighat, S., Fahimi, H. & Mohammadi, E. ۲۰۱۸a. ...
  • Nowruzi, B., Fahimi, H. & Ordodari, N. ۲۰۱۸b. Molecular phylogenetic ...
  • Nowruzi, B., Blanco, S. & Nejadsattari, T. ۲۰۱۸c. Chemical and ...
  • Nowruzi, B., Fahimi, H., Ordodari, N. & Assareh, R. ۲۰۱۷a. ...
  • Nowruzi, B., Khavari-Nejad, R.A., Nejadsattari, T., Sivonen, K. & Fewer, ...
  • Nowruzi, B., Khavari-Nejad, R.A., Sivonen, K., Kazemi, B., Najafi, F. ...
  • Nowruzi, B., Khavari-Nejad, R.A., Sivonen, K., Kazemi, B., Najafi, F. ...
  • Osorio-Santos, K., Pietrasiak, N., Bohunická, M., Miscoe, L.H., Kováčik, L., ...
  • Prabha, R. & Singh, D.P. ۲۰۱۹. Cyanobacterial phylogenetic analysis based ...
  • Price, G.D., Badger, M.R., Woodger, F.J. & Long, B.M. ۲۰۰۸. ...
  • Rajabpour, N., Nowruzi, B. & Ghobeh, M. ۲۰۱۹. Investigation of ...
  • Rantala-Ylinen, A., Känä, S., Wang, H., Rouhiainen, L., Wahlsten, M., ...
  • Řeháková, K., Johansen, J.R., Casamatta, D.A., Xuesong, L. & Vincent, ...
  • Shalygin, S., Pietrasiak, N., Gomez, F., Mlewski, C., Gerard, E. ...
  • Sihvonen, L.M., Lyra, C., Fewer, D.P., Rajaniemi-Wacklin, P., Lehtimäki, J.M., ...
  • Szöllősi, G.J., Boussau, B., Abby, S.S., Tannier, E. & Daubin, ...
  • Taton, A., Grubisic, S., Brambilla, E., De Wit, R. & ...
  • Tillett, D., Parker, D.L. & Neilan, B.A. ۲۰۰۱. Detection of ...
  • Vaz, M.G.M.V., Genuario, D.B., Andreote, A.P.D., Malone, C.F.S., Sant’Anna, C.L., ...
  • Villanueva, C.D., Garvey, A.D., Hašler, P.E.T.R., Dvořák, P.E.T.R., Poulíčková, A.L.O.I.S.I.E., ...
  • Werner, V.R., Laughinghouse IV, H.D., Fiore, M.F., Sant'Anna, C.L., Hoff, ...
  • Wood, S.A., Selwood, A.I., Rueckert, A., Holland, P.T., Milne, J.R., ...
  • Zapomělová, E., Řeháková, K., Jezberová, J. & Komárková, J. ۲۰۱۰. ...
  • Zhaxybayeva, O., Gogarten, J.P., Charlebois, R.L., Doolittle, W.F. & Papke, ...
  • Zuker, M. ۲۰۰۳. Mfold web server for nucleic acid folding ...
  • نمایش کامل مراجع