روش های طبقه بندی فایتوپلاسماها

سال انتشار: 1400
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 222

فایل این مقاله در 19 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

JR_TBJ-13-49_002

تاریخ نمایه سازی: 20 اردیبهشت 1401

چکیده مقاله:

فایتوپلاسماها پروکاریوت های تخصص یافته و انگل اجباری بافت آبکش گیاه و حشرات ناقل هستند. از آنجایی که این موجودات در شرایط آزمایشگاهی کشت نمی شوند، امکان استفاده از بسیاری از آزمون های مرسوم فنوتیپی که برای تاکسونومی مالیکوت های کشت پذیر به کار می رود، برای فایتوپلاسماها وجود ندارد. این امر اهمیت ویژگی های مولکولی و فیلوژنتیکی را نسبت به خصوصیات فنوتیپی در تعیین موقعیت تاکسونومیک فایتوپلاسماها نشان می دهد. در دهه گذشته روش هایی برپایه بیولوژی و ژنتیک مولکولی، مانند مقایسه توالی نوکلئوتیدی بخشی از RNA ریبوزومی، این امکان را فراهم کرده است که روابط تکاملی و فیلوژنی بین جدایه های مختلف فایتوپلاسماها با یکدیگر و با سایر پروکاریوت ها دقیق تر مشخص شود. مقایسه توالی نوکلئوتیدی بخشی از ژن S rRNA۱۶ یا ناحیه بین ژنی S۱۶- S۲۳ و tRNA-Ile هنوز برای آنالیز تعداد زیادی از فایتوپلاسماهای ناشناخته (در مقیاس وسیع) استفاده می شود. گروه بندی زیرخوشه با استفاده از مناطق کمتر محافظت شده، مانند ژن کدکننده پروتئین ریبوزومی و ناحیه بین ژن های S۱۶ و S۲۳، ژن هدف عمومیcpn۶۰، ژن کدکننده پروتئین SecA، ژن secY، ژن پروتئین ریبوزومی (rp) و ژن tuf انجام می شود.

نویسندگان

مریم غایب زمهریر

دانشیار بخش تحقیقات بیماری شناسی گیاهان، موسسه تحقیقات گیاه پزشکی کشور، تهران، ایران

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • منابعAndersen, M. T., Newcomb, R. D., Liefting, L. W., & ...
  • Bai, X., Zhang, J., Ewing, A., Miller, S. A., Radek, ...
  • Bagheri, B., Yousefi, M., & Mirjalili, S. A. (۲۰۲۱). Life ...
  • Bertaccini, A., Duduk, B., Paltrinieri, S., & Contaldo, N. (۲۰۱۴). ...
  • Bove, J. M., Danet, J. L., Bananej, K., Haasanzadeh, N., ...
  • Contaldo, N., Satta, E., Zambon, Y., Paltrnieri, S., Bertaccini, A., ...
  • Davis, R. E., Jomantiene, R., Zhao, Y., & Dally, E. ...
  • Esmailzadeh Hosseini, S. A., Khodakaramian, G., Salehi, M., & Bertaccini, ...
  • Firrao G., Garcia-Chapa, M., & Marzachì, C. (۲۰۰۷). Phytoplasmas: Genetics, ...
  • Ghayeb Zamharir, M. (۲۰۱۴). Molecular study of a new disease ...
  • Ghayeb Zamharir, M. (۲۰۱۶). Association of a 'Candidatus Phytoplasma solani'-related ...
  • Ghayeb Zamharir, M., Hajivand, S., Paltrinieri, S., & Bertaccini, A. ...
  • Ghayeb Zamharir, M., & Eslahi, M. R. (۲۰۱۹). Molecular study ...
  • Griffiths, H. M., Sinclair, W. A., Smartt, C. D., & ...
  • Iriti, M., Quaglino, F., Maffi, D., Casatti, P., Bianco, P. ...
  • IRPCM, Phytoplasma/Spiroplasma Working Team– Phytoplasma Taxonomy Group. (۲۰۰۴). ‘Candidatus Phytoplasma’, ...
  • Jamshidi, E., Jafarpour, B., Rouhani, H., & Salehi, M. (۲۰۱۴). ...
  • Kube, M., Schneider, B., Kuhl, H., Dandekar,T., Heitmann, K., Migdoll, ...
  • Kuske, C. R., & Kirkpatrick, B. C. (۱۹۹۲). Phylogenetic relationships ...
  • Langer, M. and Maixner. M. (۲۰۰۴). Molecular characterization of grapevine ...
  • Lee, I. M., Gundersen, D. E., Davis, R. E. and ...
  • Lee, I. M., Gundersen-Rindal, D. E., Davis, R. E., & ...
  • Lee, I. M., Gundersen-Rindal, D. E., Davis, R. E., Bottner, ...
  • Lim, P. O., & Sears, B. B. (۱۹۸۹). ۱۶S rRNA ...
  • Marcone, C., Lee, I. M., Davis, R. E., Ragozzino, A. ...
  • Marcone, C., & Seemuller, E. (۲۰۰۱). A chromosome map of ...
  • Martini, M., Loi, N., Ermacora, P., Carraro, L., & Pastore, ...
  • Martini, M., Botti, S., Marcone, C., Marzachi, C., Casati, P., ...
  • Mehrnia, M., Asri, Y., & Hosseini, Z. (۲۰۲۱). A floristic ...
  • Murray, R. G. E. and Schleifer, K. H. (۱۹۹۴). Taxonomic ...
  • Oshima, K., Maejima, K., & Namba, S. (۲۰۱۳). Genomic and ...
  • Padovan, A. C., Firrao, G., Schneider, B., & Gibb, K. ...
  • Perez-López, E., Olivier, C. Y., Luna-Rodríguez, M., & Dumonceaux, T. ...
  • Ruggiero, M. A., Gordon, D. P., Orrell, T. M., Bailly, ...
  • Saberamoli, S., Asri, Y., Mozaffarian, V., Balali, G., Afsharzadeh, S., ...
  • Salehi, M., Izadpanah, K., & Heydarnejad, J. (۲۰۰۶). Characterization of ...
  • Salehi, M., Esmailzadeh Hosseini, S. A., Salehi, E., & Bertaccini, ...
  • Salehi, M., Salehi, E., Siampour, M., Quaglino, F., & Bianco, ...
  • Schneider, B., Gibb, K. S., & Seemüller E. (۱۹۹۷). Sequence ...
  • Schweigkofler, W. (۲۰۰۸). Phytoplasma: General information. Research Centre for Agriculture ...
  • Shao, J., Jomantiene, R., Dally, E. L., Zhao, Y., Lee, ...
  • Toth, K. F., Harrison, N., & Sears, B. B. (۱۹۹۴). ...
  • Town, J., Annand, H., Pratt, D., Dumonceaux, T., & Fonstad, ...
  • Tran-Nguyen, L. T. T., Kube, M., Schneider, B., Reinhardt, R., ...
  • Wei, W., Davis, R. E., Lee, I. M., & Zhao, ...
  • Welliver, R. (۱۹۹۹). Diseases caused by phytoplasmas. Journal of Regulatory ...
  • Woese, C. R. (۱۹۸۷). Bacterial evolution. Microbiology Review, ۵۱, ۲۲۱–۲۷۱ ...
  • Woese, C. R., Kandler, O. & Wheels, M. L. (۱۹۹۰). ...
  • Zhao, Y., & Davis, R. E. (۲۰۱۶). Criteria for phytoplasma ...
  • Zhao, Y., Sun, Q., Wei, W., Davis, R. E., Wu, ...
  • Zirak, L., Bahar, M., & Ahoonmanesh, A. (۲۰۱۰). Molecular characterization ...
  • نمایش کامل مراجع