تنوع ژنتیکی و آنالیز فیلوژنتیکی ناحیه D-loop ژنوم میتوکندری گوسفند نژاد بلوچی

سال انتشار: 1397
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 228

فایل این مقاله در 9 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

JR_JASR-10-1_013

تاریخ نمایه سازی: 25 اسفند 1400

چکیده مقاله:

توالی یابی ژنوم میتوکندری یکی از رایج ترین روش های طبقه بندی تکاملی حیوانات می باشد. به منظور بررسی تاریخچه تکاملی گوسفند نژاد بلوچی واقع در منطقه شرق کشور ایران، از ۳۰ نمونه گوسفندان واقع در مرکز اصلاح نژاد شمال شرق کشور به صورت تصادفی خونگیری شد. بعد از استخراج DNA توسط کیت DIAtom DNA Prep و تکثیر ناحیه D-loop میتوکندری ژنوم به کمک پرایمر های اختصاصی، تولی یابی انجام پذیرفت. بررسی کیفیت توالی ها، ساختار نوکلئوتیدی و جهش های مربوطه با استفاده از نرم افزارهای مختلف انجام شد. هشت زیر گروه هاپلوتایپی هر یک با فراوانی ۴/۷، ۴/۷، ۸۱/۱۴، ۱۱/۱۱، ۵۱/۱۸، ۸۱/۱۴، ۱۱/۱۱ و ۸۱/۱۴ مشاهده و تنوع ژنتیکی موجود در بین ۲۷ نمونه ۰۰۵/۰± ۰۱۳۱/۰ محاسبه شد که این مقدار در محدوده ی متوسط تنوع نوکلئوتیدی در یوکاریوت ها قرار داشت. آنالیز فیلوژنتیکی این نمونه ها نشان داد که گوسفند نژاد بلوچی در گروه هاپلوتایپی A واقع شده است. از آنجا که خاستگاه اصلی هاپلوتایپ A مربوط به آسیا و خاور میانه می باشد و با توجه به نتایج مطالعات قبلی بر روی گوسفندهای بومی ایران که حاکی از قرار گرفتن این گوسفندان در هاپلوتایپ مذکور می باشد، قرار گرفتن گوسفند بلوچی نیز در این هاپلوتایپ قابل توجیه است.

نویسندگان

فاطمه بحری بیناباج

دانشگاه گنبد کاووس

گلناز بی همتا

دانشگاه فردوسی مشهد

زانا پیرخضرانیان

دانشگاه فردوسی مشهد

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Anderson, S. A.T., G. Bankier, M. Barrell, A. de Bruijn, ...
  • Avise, J. C., and R. C. Vrijenhock. ۱۹۸۷. Mode of ...
  • Bruford, M., D. Bradley, and G. Luikart. ۲۰۰۳. DNA markers ...
  • Chen, S. Y., Z. Y. Duan, T. Sha, J. Xiangyu, ...
  • Chessa, B., F. Pereira, F. Arnaud, A. Amorim, and F. ...
  • Excoffier, L., L. Guillaume, and S. Schneider. ۲۰۰۵. Arlequin: An ...
  • Frankhan, R. ۱۹۹۴. Conservation of genetic diversity for animal improvement. ...
  • Guo, J., L. X. Du, Y. H. Ma, W. J. ...
  • Hall, T. A. ۱۹۹۹. BioEdit: a user-friendly biological sequence alignment ...
  • Hallerman, E. M. ۲۰۰۳. Population genetics: principles and applications for ...
  • Hiendleder, S., K. Mainz, Y. Plante, and H. Lewalski. ۱۹۹۸. ...
  • Hiendleder, S., B. Kaupe, R. Wassmuth, and A. Janke. ۲۰۰۲. ...
  • Jazin, E., H. Soodyall, P. Jalonen, E. Lindholm, M. Stoneking, ...
  • Knudsen, B., T. Knudsen, M. Flensborg, H. Sandmann, M. Heltzen, ...
  • Lalitha, S. ۲۰۰۰. Primer premier ۵. Biotech Software & Internet ...
  • Mirhosseini, S. Z. ۱۹۹۸. Study the genetic diversity of Iranian ...
  • Miyazono, F., P. M. Schneider, R. Metzger, U. Warnecke-Eberz, S. ...
  • Mohammadhashemi, A. ۲۰۱۰. Sequencing the HVR-۱ region of mithochondrial genome ...
  • Mohammadhashemi, A., M. Tahmoorespour, N. Pirany, and M. Nosrati. ۲۰۱۱. ...
  • Naderi, S., H. R. Rezaei, P. Taberlet, S. Zundel, S. ...
  • Nei M, ۱۹۸۷. Molecular evolutionary genetics. Columbia University Press ...
  • Oner, Y., and J. H. Calvo. ۲۰۱۳. Investigation of the ...
  • Parvari R, A. Avivi, F. Lentner, E. Ziv, S. Telor, ...
  • Pedrosa, S., M. Uzun, J. J. Arranz, B. Gutierrezz-Gil, F. ...
  • Pirkhezranian, Z., M. Tahmoorespur, A. Mohammadhashemi, N. Pirani, and M. ...
  • Shafagh Motlagh, A. ۲۰۰۸. A preliminary study on the sequence ...
  • Tahmoorespur, M., and M. Sheikhloo. ۲۰۱۱. Pedigree analysis of the ...
  • Tamura,K., D. Peterson, N. Peterson, G. Stecher,M. Nei, and S. ...
  • Tapio, M., N. Marzanov, M. Ozerov, M. Ćinkulov, G. Gonzarenko, ...
  • Technelysium P. L. ۲۰۰۷. Chromas lite version ۲.۰۱ ...
  • Upholt, W. B., and I. B. Dawid. ۱۹۷۷. Mapping of ...
  • Villalta, M., P. Fernandez-Silva, B. Beltran, L. Enguita, M. J. ...
  • Wolf, C., J. Rentsch, and P. Hubner. ۱۹۹۹. PCR-RFLP analysis ...
  • Wood, N., and S. Phua. ۱۹۹۶. Variation in the control ...
  • Zeuner, F. E. ۱۹۶۳. A history of domesticated animals. Hutchinson, ...
  • نمایش کامل مراجع