بررسی بیوانفورماتیکی miRNA های موثر بر ژن های وابسته به بیماری (PR) موجود در کلزا (.Brassica napus L)

کلزا به دلیل دارا بودن ۴۰ تا ۴۵ درصد روغن در هر دانه، سومین منبع بزرگ روغن نباتی در جهان است. گیاهان به طور دائمدر معرض تهدید چندین عامل بیماری زا مانند باکتری ها، ویروس ها، قارچ ها، نماتدها و سایر تهدیدات هستند. با این حالفعل و انفعالات گیاهی در برابر بیماری زاها بسیار پیچیده است و باعث می شود اکثر گیاهان در برابر این عوامل نفوذ ناپذیرشوند. به علاوه این فعل و انفعالات شامل پاسخ های خاصی هستند که فقط به چند عامل بیماری زا اجازه گسترش بیماری رامی دهد. پروتئین های وابسته به بیماری زایی از عوامل اصلی مقاومت سیستمیک اکتسابی هستند. پاسخ ایمنی القایی از آلودگیبیشتر قسمت های آلوده نشده میزبان جلوگیری می کند. microRNA ها از عوامل مهم تنظیمی در یوکاریوت ها هستند که بیانژن پس از رونویسی را تنظیم می کنند. در این بررسی پنج ژن PR۱۰ ،PR۹ ،PR۵ ،PR۲ و PR۱۲ در کلزا مورد بررسی قرارگرفت براساس نتایج بدست آمده، به طور کلی ۳عدد microRNA در کلزا برای ۲ عدد از ژن های مورد بررسی شناساییشد. بدین ترتیب که برای ژن PR۲ یک bna-miR۶۰۳۴ و برای ژن PR۱۰ دو miRNA از خانواده bna-miR۳۹۷ درکلزا مشاهده شد.

کلیدواژه ها:

بیوانفورماتیک ، ژن های هدف ، psRNATarget