شناسایی و مطالعه فیلوژنتیکی اعضای خانواده ژنی CAMTA در ژنوم گیاه نخود (Cicer arietinum)

تنش ها زیستی و غیرزیستی از مهمترین عوامل محدودکننده عملکرد گیاهان زراعی مانند نخود میباشد. عوامل رونویسی درتنظیم ژن های پاسخ دهنده به این تنش ها دخالت دارند که خانواده ژنی CAMTA نیز جزوه این گروه می باشد. در پژوهشحاضر اعضای خانواده ژنی CAMTA در ژنوم گیاه نخود مورد بررسی و مطالعه قرار گرفت. برای این منظور، از توالیپروتئینی یونجه یکساله به عنوان توالی مرجع برای شناسایی پروتئین فعال کننده رونویسی متصل شونده بهکالمودلین (CAMTAs) در ژنوم گیاه نخوداستفاده شد. تجزیه و تحلیل دامنه های پروتئینی حفاظت شده و ساختار ژنیCaCAMTA از طریق نرم افزار موجود در سایت Pfam و با استفاده از برنامه (Multiple Em for Motif Elicitation (MEME انجام شد. در این تحقیق ۴ ژن CMATA نخود با ۱۷ واریانت رونویسی با استفاده از روش آنالیز کل ژنوم موردشناسایی قرار گرفت. همردیفی توالی اسیدآمینه ای پروتئین های CAMTA با استفاده ClustalW انجام شد و درختفیلوژنتیکی در نرم افزار MegaX رسم گردید. تجزیه و تحلیل فیلوژنتیکی نشان داد که ژن های CAMTA نخود در سه گروهمختلف قرار می گیرند.پروتئین های گروه اول می توان به پروتئین ۱ و ۲ نخود به همراه ایزوفرم های CAMTA۲ اشاره نمود که باپروتئین CAMTA۲ و CAMTA۱ یونجه یکساله در یک گروه قرار گرفتند. در گروه دوم CAMTA۴ نخود به همراه ایزوفرم-هایش با CAMTA۴ یونجه یکساله قرار گرفت. در گروه سوم CAMTA۵ نخود با CAMTA۵ یونجه یکساله در یک گروهقرار گرفتند.

کلیدواژه ها:

عوامل رونویسی ، فعال کننده های رونویسی متصل شونده به کالمودولین ، فیلوژنتیکی ، نخود