شناسایی و مقایسه توالی ‍‍ژن VP۲۸ ویروس لکه سفید میگو، جداشده از میگوی وانامی در چابهار (ایران)

سابقه و هدف:عفونت ویروس سندروم لکه سفید (WSSV)، باعث خسارات زیادی در تولید و اقتصاد فرهنگ میگو در سطح جهان است. برای اولین بار بیماری لکه سفید (WSD) در سال ۲۰۰۴ در بوشهر و در سال ۲۰۰۸ در سیستان و بلوچستان گزارش شده است. ویروس لکه سفید میگو در بین ویروس های آلوده کننده میگو های پنائیده بسیار بیماری زا است. مواد و روش ها: نمونه های DNA ویروس لکه سفید میگو از میگو های بیمار به دست آمد. از آغازگر اختصاصی PCR برای تکثیر ژن VP۲۸ در WSSV مورد استفاده قرار گرفت. ژن VP۲۸ از DNA جداشده از WSSV توسط PCR تکثیر شد و محصول PCR تعیین توالی شد. یافته ها: محصول توالی یابی شده به شماره ثبت (KF۷۲۳۵۵۸) در بانک جهانی ژن ثبت شد. توالی نوکلئوتیدی (KF۷۲۳۵۵۸) با توالی های ژن VP۲۸ در پایگاه داده NCBI مقایسه شد. نتیجه گیری:۳۶ توالی هم ترازی قابل توجهی با ۹۹٪ شباهت که شامل توالی هایی از کره، ژاپن، ایالات متحده، اندونزی، چین، ویتنام، تایوان، هلند و تایلند نشان داد. با این حال همسانی ۱۰۰٪ در توالی ها مشاهده نگردید. 

کلیدواژه ها:

White Spot Syndrome Virus ، Polymerase Chain Reaction ، shrimp ، GenBank database ، ویروس سندروم لکه سفید میگو ، واکنش زنجیره ای پلیمراز ، میگو ، بانک جهانی ژن