تخمین ساختار تنوع، تنگنای ژنتیکی سه جمعیت گوسفند بومی کشور عراق با استفاده از نشانگرهای میکروساتلایت
محل انتشار: فصلنامه محیط زیست جانوری، دوره: 13، شماره: 3
سال انتشار: 1400
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 529
فایل این مقاله در 13 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد
- صدور گواهی نمایه سازی
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
JR_AEJO-13-3_001
تاریخ نمایه سازی: 21 اسفند 1400
چکیده مقاله:
هدف از پژوهش حاضر، تخمین شاخص های مولکولی، ساختار ژنتیکی، تنوع و تنگنای ژنتیکی در سه جمعیت گوسفند بومی عراق (عواسی، نعیمی و عرابی ) می باشد. بدین منظور، از تعداد ۱۲ جایگاه میکروساتلایت با توزیع استقرارکروموزمی (۱، ۲، ۵، ۹ و ۱۴ ) وطبق توصیه فائو و انجمن ژنتیک جهانی استفاده شد. تعداد ۶۰ نمونه خون کامل حیوان (نر و ماده ) به صورت تصادفی از جمعیت های مربوطه در استان های کربلا، نجف و بابل تهیه شد. استخراج DNA، تعیین کمیت و کیفیت، واکنش زنجیره پلی مراز و الکتروفورز و عکس برداری با روش های متداول رایج انجام شد. از روش Allele Binning نیز برای تصحیح ژنوتیپ ها و به حد اقل رساندن خطای قرائت ژنوتیپ استفاده شد. تعداد بیش از ۹ نوع شاخص آماری مولکولی (فروانی اللی، تعداد آلل های مشاهده شده و مورد انتظار، هتروزایگوستی مشاهده شده و مورد انتظار، محتوای چند شکلی، ضریب رایت، شاخص شانون، شاخص های آماره F و فاصله ژنتیکی و وضعیت باتلنگ ) بررسی شد. نتایج در دو بخش بررسی مطلوبیت جایگاه میکروساتلایت و ارزیابی تنوع ژنتیکی درون و بین جمعیتی ارائه شد. نتایج بخش اول نشان داد که بیش ترین پلی مورفیسم در نشانگرهای OarFCB۲۲۶ و TGLA۱۳ و بقیه کم ترین پلی مورفیسم را ایجاد می کند. نتایج بخش دوم نشان داد که به ترتیب نژاد عواسی و عرابی بیش ترین و کم ترین تنوع را دارد. بیش ترین فاصله ژنتیکی بین دو نژاد عرابی و نعیمی و کم ترین بین نعیمی وعواسی بود. منحنی L-Shape باتلنک نشان داد که جمعیت های مورد مطالعه در تنگنای ژنتیکی قرار دارند.
کلیدواژه ها:
نویسندگان
حیدر رحیم النجم
گروه فن آورهای پرورش دام، دانشکده فنی المسیب، دانشگاه فنی الفرات الاوسط، بابل، عراق
صادق علیجانی
گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تبریز، تبریز، ایران
آرش جوانمرد
گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تبریز، تبریز، ایران
سیدعباس رافت
گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تبریز، تبریز، ایران
کریم حسنپور
گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تبریز، تبریز، ایران
مراجع و منابع این مقاله:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :