ثبات نسبی ژنتیکی جدایه های ویروس برگ قاشقی باقلا بر اساس بخشی از ژن پروتئین پوششی از میزبان ها و مناطق جغرافیایی مختلف ایران

سال انتشار: 1397
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 187

فایل این مقاله در 12 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

JR_IJPP-54-1_003

تاریخ نمایه سازی: 3 اسفند 1400

چکیده مقاله:

یکی از عوامل زردی، کوتولگی و پیچیدگی در حبوبات که باعث کاهش محصول می شود ویروس برگ قاشقی باقلا (Bean leaf roll virus, BLRV) می­باشد. به منظور بررسی تنوع جدایه­های ایرانی این ویروس از مزارع حبوبات در استان های مرکزی، فارس، خوزستان، کهگیلویه و بویر احمد، گلستان، زنجان و قزوین بازدید و از گیاهان یونجه، عدس، نخود، لوبیا، شبدر، باقلا، نخودفرنگی و شنبلیله نمونه برداری انجام شد. درمورد نمونه­های انتخابی مراحل استخراج آر­ان­ای ویروس، تکثیر بخشی از ژن کد­کننده­ی پروتئین پوششی (از نوکلئوتید ۳۲۵۰ تا نوکلئوتید ۳۶۳۸) با آغازگر­های اختصاصی، همسانه سازی و تعیین ترادف به عمل آمد. به این ترتیب، BLRV در گیاهان یونجه، عدس، نخود، لوبیا و شبدر عمدتا  با علائم زردی و در گیاه باقلا با علائم قاشقی شدن برگ­ها و زرد شدن برگ­های جوان تشخیص داده شد. همردیف­سازی چندگانه ترادف بخشی از ژن پروتئین پوششی ۱۵ جدایه­ی ایرانی با ترادف ناحیه مشابه سایر جدایه­های BLRV موجود در بانک ژن نشان داد که میزان شباهت نوکلئوتیدی و ترجمه آمینواسیدی این ناحیه از ژن  پروتئین پوششی به ترتیب ۹۸–۹۴% و ۱۰۰–۹۶% می­باشد. مطالعات تبارزایی نشان داد که تمام جدایه­های BLRV از ایران در یک گروه مجزا از جدایه­های غیرایرانی قرار می­گیرند. میزان شباهت­ ژن در این بخش از ژنوم می­تواند نشان دهنده­ی پایستگی و ثبات نسبی ژنتیکی ژن پروتئین پوششی ویروس مورد بررسی باشد.

کلیدواژه ها:

استخراج آر ان ا ، پروتئین پوششی ، تنوع ژنتیکی ، ویروس برگ قاشقی باقلا ، ویروس های حبوبات

نویسندگان

امید بهرامی ترابی

دانشجوی کارشناسی ارشد بیماری شناسی گیاهی گروه آموزشی گیاهپزشکی دانشگاه شیراز.

الهام علوی نژاد

دانشیار بیماری شناسی گیاهی گروه آموزشی گیاهپزشکی دانشگاه شیراز

سیدعلی اکبر بهجت نیا

استاد بیماری شناسی گیاهی گروه آموزشی گیاهپزشکی دانشگاه شیراز.

کرامت اله ایزدپناه

استاد بیماری شناسی گیاهی گروه آموزشی گیاهپزشکی دانشگاه شیراز.

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Abraham A. D., Varrelmann M., and Vetten H. J. (۲۰۰۸). ...
  • Alavinejad E., Behjatnia S. A. A., Izadpanah K. and M. ...
  • Ashby J. W. (۱۹۸۴). Bean leaf roll virus. CMI/AAB Descriptions ...
  • Behjatnia S. A. A. and Izadpanah K. ۱۹۹۳. Purification, serology ...
  • Domier L. L., McCoppin N. K., Larsen R. C. and ...
  • Edwardson J. R. and Christie R. G. (۱۹۹۱). CRC Handbook ...
  • Hampton R. O. (۱۹۸۳). Pea leaf roll in Northwestern U.S. ...
  • Holmes D. S. and Quigley M. (۱۹۸۱). A rapid boiling ...
  • Kaiser W. J. (۱۹۷۲). Diseases of food legumes caused by ...
  • Kaiser W. J., Danesh D., Okhovvat M., and Mossahebi G. ...
  • Kumar S., Stecher G., and Tamura K. (۲۰۱۶). MEGA۷: Molecular ...
  • Lotfipour M, Izadpanah K. and Behjatnia S. A. A. (۲۰۱۶). Identification and ...
  • Makkouk K. M., Bashir M., and Jones R. (۱۹۹۸). First ...
  • Tinsley T. W. (۱۹۵۹). Pea leaf roll, a new virus ...
  • نمایش کامل مراجع