ورود
مقالات فارسیISIکنفرانسهاژورنالها

شناسایی و ردیابی Phytophthora erythroseptica و دورگ های آن با استفاده از آغازگرهای اختصاصی

محل انتشار: فصلنامه بیماریهای گیاهی، دوره: 55، شماره: 3
سال انتشار: 1398
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 166

فایل این مقاله در 17 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:
https://civilica.com/doc/1405082

شناسه ملی سند علمی:

JR_IJPP-55-3_006

تاریخ نمایه سازی: 2 اسفند 1400

چکیده مقاله:

گونه­یPhytophthora erythroseptica ، عامل پوسیدگی صورتی سیب­زمینی، یکی از اامیست­های بیماری­زای گیاهی است که خسارت اقتصادی قابل توجهی را در مزرعه و انبار وارد می­کند. به منظور شناسایی و ردیابی دقیق و حساس P. erythroseptica ، شش توالی هسته­ای و میتوکندریایی برای طراحی آغازگرهای اختصاصی مورد بررسی قرار گرفت. به دلیل شباهت زیاد توالی­های P. erythroseptica به خویشاوندان نزدیکش، تنها یک توالی هسته­ای (TigA) برای طراحی آغازگرهای اختصاصی مناسب تشخیص داده شد. با استفاده از آغازگرهای اختصاصی طراحی شده، شیوه­ای از واکنش زنجیره­ای ساده و تودرتو برای شناسایی و ردیابی P. erythroseptica ابداع شد. اختصاصیت آغازگرهای طراحی شده با استفاده از مجموعه­ای از گونه­های فیتوفتورا متعلق به تبارهای فیلوژنتیکی مختلف و نیز خویشاوندان نزدیک P. erythroseptica ارزیابی شد. ردیابی P. erythroseptica در دی­ان­ای خالص بیمارگر و دی­ان­ای استخراج شده از بافت­های گیاهی آلوده شامل سیب­زمینی، گوجه­فرنگی و اسفناج با استفاده از آغازگرها با موفقیت انجام شد. آغازگرهای اختصاصی۱۰ پیکوگرم از دی­ان­ای خالص P. erythroseptica را در واکنش زنجیره­ای پلیمراز ساده ردیابی کردند، با این حال واکنش زنجیره­ای پلیمراز تودرتو، حساسیت آغازگرها را حداقل صد برابر افزایش داد. همچنین، آغازگرهای اختصاصی قادر به ردیابی P. erythroseptica به عنوان والد پدری یا مادری در جدایه­های دورگ بودند؛ این ویژگی به شناسایی یکی از والدین در دورگ­های P. erythroseptica کمک شایانی می­کند

کلیدواژه ها:

: اامیکوتا ، پوسیدگی صورتی سیب زمینی ، واکنش زنجیره ای پلیمراز

نویسندگان

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Andjic V., Cortinas M.N., Hardy G.E.St. J., Wingfield M.J. and ...
  • Bertier L., Leus L., D’hondt L., de Cock A.W. and ...
  • Blair J.E., Coffey M.D., Park S.Y., Geiser D.M. and Kang, ...
  • Bonants P.J.M., Hagenaar-de Weerdt M., Man in't Veld W.A. and ...
  • Brasier C.M. ۱۹۷۱. Induction of sexual reproduction in single A۲ ...
  • Brasier C.M. ۲۰۰۸. The biosecurity threat to the UK and ...
  • Brasier C.M., Kirk S.A., Delcan J., Cooke D.E.L., Jung T. ...
  • Burgess T.I. ۲۰۱۵. Molecular characterization of natural hybrids formed between ...
  • Cooke D.E., Schena L. and Cacciola S.O. ۲۰۰۷. Tools to ...
  • Cooke D.E.L., Drenth A., Duncan J.M., Wagel, G. and Brasier ...
  • Cullen D.W., Toth I.K., Boonham N., Walsh K., Barker I. ...
  • Delshad D., Mostowfizadeh-Ghalamfarsa R, Safaiefarahani B. ۲۰۱۹. Potential host range ...
  • Drenth A., Wagels G., Smith B., Sendall B., O’Dwyer C., ...
  • Drummond A.J., Ashton B., Buxton S., Cheung M., Cooper A., ...
  • Durán A., Slippers B., Gryzenhout M., Ahumada R., Drenth A., ...
  • Erwin D.C. and Ribeiro O.K. ۱۹۹۶. Phytophthora Diseases Worldwide. APS ...
  • Fry W.E. ۲۰۱۲. Principles of Plant Disease Management. Academic Press., USA. ...
  • Fyfe A.M. and Shaw D.S. ۱۹۹۲. An analysis of self-fertility ...
  • Gillings M.R. and Letham D.B. ۱۹۸۸. Phytophthora erythroseptica causing wilting ...
  • Goss E.M, Cardenas M.E., Myers K, Forbes G.A., Fry W.E, ...
  • Grisham M.P., Taber R.A. and Barnes L.W. ۱۹۸۳. Phytophthora rot ...
  • Groves C.T. and Ristaino J.B. ۲۰۰۰. Commercial fungicide formulations induce ...
  • Hurtado-Gonzales O.P., Aragon-Caballero L.M., Flores-Torres J.G., Man in’t Veld W. ...
  • Husson C., Aguayo J., Revellin C., Frey P., Ioos R. ...
  • Ioos R., Andrieux A., Marc ais B. and Frey P., ...
  • Judelson H.S., Ah-Fong A.M.V. and Fabritius A. ۲۰۱۰. An RNA ...
  • Kibbe W. A. ۲۰۰۷. OligoCalc: an online oligonucleotide properties calculator’. ...
  • Kroon L.P.N.M., Bakker F.T., Van Den Bosch G.B.M., Bonants P.J.M. ...
  • Lambert D.H. and and Salas B. ۲۰۰۱. Pink rot. Pp. ...
  • Li B., Liu P., Xie S., Yin R., Weng Q. ...
  • Man in’t Veld W.A., de Cock A.W.A.M. and Summerbell R.C. ...
  • Man in’t Veld W.A., Rosendahl K.C.H.M. and Hong C. ۲۰۱۲. ...
  • Martin F.N., Blair J.E. and Coffey M.D. ۲۰۱۴. A combined ...
  • Martin F.N., Tooley P.W. and Blomquist C. ۲۰۰۴. Molecular detection of ...
  • Mortimer A.M. and Shaw D.S. and Sansome. A. ۱۹۷۷. Genetical ...
  • Mostowfizadeh-Ghalamfarsa R. ۲۰۱۲. Species-specific detection of Phytophthora inundata by simple ...
  • Mostowfizadeh-Ghalamfarsa R. and Banihashemi Z. ۲۰۱۵. Species-specific PCR identification and ...
  • Mostowfizadeh-Ghalamfarsa R. and Mirsoleimani Z. ۲۰۱۳. Species-specific identification and detection of ...
  • Nagel J.H., Gryzenhout M., Slippers B., Wingfield M.J., Hardy G.S.J., ...
  • Oh, E., Gryzenhout, M., Wingfield, B.D., Wingfield, M.J. and Burgess, ...
  • Peters, R.D., Clark, R.J., Coffin, A.D., Sturz, A.V., Lambert, D.H. ...
  • Reeves R.J. and Jackson R.M. ۱۹۷۴. Stimulation of sexual reproduction ...
  • Royle D.J. and Hickman C.J. ۱۹۶۴. Observations on Phytophthora cinnamomi. ...
  • Safaiefarahani B. and Mostowfizadeh-Ghalamfarsa R. ۲۰۱۸. Phylogeny, morphological and physiological ...
  • Safaiefarahani B., Mostowfizadeh-Ghalamfarsa R. and Cooke D.E., ۲۰۱۳. Characterisation of ...
  • Safaiefarahani B., Mostowfizadeh-Ghalamfarsa R., Hardy G.E. and Burgess T.I. ۲۰۱۶. ...
  • Safaiefarahani B., Mostowfizadeh-Ghalamfarsa R., Hardy G.S.J. and Burgess T.I. ۲۰۱۵. ...
  • Sakalidis M.L., Hardy G.E.S. and Burgess T.I. ۲۰۱۱. Endophytes as ...
  • Schardl C.L. and Craven K.D. ۲۰۰۳. Interspecific hybridization in plant‐associated fungi ...
  • Secor G.A. and Gudmestad N.C. ۱۹۹۹. Managing fungal diseases of ...
  • Silvar C., Duncan J.M., Cooke D.E., Williams N.A., Díaz J. ...
  • Soltis P.S. and Soltis D.E. ۲۰۰۹. The role of hybridization in ...
  • Stamler, R.A., Sanogo, S., Goldberg, N.P. and Randall, J.J., ۲۰۱۶. ...
  • Stamps D.J., Waterhouse G.M., Newhook F.T. and Hall G.S. ۱۹۹۰. ...
  • Stukenbrock E.H. ۲۰۱۳. Evolution, selection and isolation: a genomic view ...
  • Taylor R.J., Salas B., and Gudmestad N.C. ۲۰۰۴. Differences in ...
  • Tooley P.W., Bunyard B.A., Carras M.M. and Hatziloukas E., ۱۹۹۷. ...
  • Tsao P.H., Vgale R., Hobbs H. and Farih A. ۱۹۸۰. ...
  • Tucker, C.M. ۱۹۳۱. Taxonomy of the genus Phytophthora de Bary. ...
  • Vargas L.A. and Nielsen L.W., ۱۹۷۲. Phytophthora erythroseptica in Peru: ...
  • Wanger A., Chavez V., Huang R., Wahed A., Dasgupta A. ...
  • Ward E., Foster S.J., Fraaije B.A. and Mccartney H.A. ۲۰۰۴. ...
  • Waterhouse G.M. ۱۹۶۳. Key to the Species of Phytophthora de ...
  • Yang X., Richardson P.A. and Hong C. ۲۰۱۴. Phytophthora× stagnum ...
  • Yang X., Tyler B.M. and Hong C. ۲۰۱۷. An expanded phylogeny ...
  • Ye J., Coulouris G., Zaretskaya I., Cutcutach, I., Rozen, S. ...
  • Yellareddygari S.K., Pasche J.S., Taylor R.J., Hua S. and Gudmestad ...
  • Zentmyer G.A., Klure L.J. and Pond E.C. ۱۹۷۹. The influence ...
  • Zolanvari S.M, Mostowfizadeh-Ghalamfarsa R. and Dadkhodaie A. ۲۰۱۷. Molecular identification ...
    • نمایش کامل مراجع