Human protamine ۱ gene structure and function affected by rs۳۵۵۷۶۹۲۸ mutation: a bioinformatics analysis

سال انتشار: 1400
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: انگلیسی
مشاهده: 171

فایل این مقاله در 9 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

این مقاله در بخشهای موضوعی زیر دسته بندی شده است:

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

JR_CAJMPSI-1-5_002

تاریخ نمایه سازی: 11 دی 1400

چکیده مقاله:

Human sperm contain most type ۱ and type ۲ protamines (PRM۱) and (PRM۲), protamines, which have about equal proportions in normal sperm. Protamines can infertile if they change structure or function. Nucleotide polymorphisms are one cause of changes in protamine structure and function. For protamine ۱ the genetic variation rs۳۵۵۷۶۹۲۸ is known. In. this study bioinformatics approach was used to investigate the effects of the rs۳۵۵۷۶۹۲۸ mutation on protamine ۱ structure and function. matics tools including RNAsnp, NetGene۲, in this study several bioinformatics tools were used to investigate how the polymorphism affects RNA structure and splicing. The tools used included RNAsnp, NetGene۲, and ASAP. To evaluate the effects of rs۳۵۵۷۶۹۲۸ on proteins, other tools such as SNAP and ExPASy were also used. The analyzes have also shown that this polymorphism has the primary, secondary and The results of this study have also shown that this polymorphism has primary, secondary, and the results of this study have also shown that this polymorphism has primary, secondary, and results of this study have also shown that protamine ۱ has the following functions: general functions. Infertile males may be affected by rs۳۵۵۷۶۹۲۸ as it has destructive effects on protamine RNA and protein structure.

نویسندگان

Ramchandra Suthar

Department of Biotechnology, Pramukh Swami Science & H. D. Patel Arts College, Kadi, Gujarat ۳۸۲۵۱۷, India

Elham Kazemi

Fertility and Infertility Research Center, Kermanshah University of Medical Sciences, Kermanshah, Iran

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Balhorn R. The protamine family of sperm nuclear proteins. Gen ...
  • https://doi.org/۱۰.۱۱۸۶/gb-۲۰۰۷-۸-۹-۲۲۷CrossRef Google Scholar full-text PDF Mendeley PubMed PubMed Central۲. Oliva ...
  • https://doi.org/۱۰.۱۰۹۳/humupd/dml۰۰۹CrossRef Google Scholar full-text PDF Mendeley PubMe ...
  • Eirín-López JM, Frehlick LJ, Ausió J. Protamines, in the footsteps ...
  • https://doi.org/۱۰.۱۰۷۴/jbc.R۵۰۰۰۱۸۲۰۰CrossRef Google Scholar full-text PDF Mendeley PubMe ...
  • Lewis JD, Song Y, de Jong ME, Bagha SM, Ausió ...
  • https://doi.org/۱۰.۱۰۰۷/s۰۰۴۱۲-۰۰۲-۰۲۲۶-۰CrossRef Google Scholar full-text PDF Mendeley PubMe ...
  • Wyckoff GJ, Wang W, Wu CI. Rapid evolution of male ...
  • https://doi.org/۱۰.۱۰۳۸/۳۵۰۰۲۰۷۰CrossRef Google Scholar full-text PDF Mendele ...
  • Amor H, Zeyad A, Hammadeh ME. Tobacco smoking and its ...
  • https://doi.org/۱۰.۱۱۱۱/and.۱۳۹۶۴CrossRef Google Scholar full-text PDF Mendeley PubMe ...
  • Choudhary SK, Wykes SM, Kramer JA, Mohamed AN, Koppitch F, ...
  • https://doi.org/۱۰.۱۰۷۴/jbc.۲۷۰.۱۵.۸۷۵۵CrossRef Google Scholar full-text PDF Mendeley PubMe ...
  • Schlüter G, Engel W. The rat Prm۳ gene is an ...
  • https://doi.org/۱۰.۱۱۵۹/۰۰۰۱۳۴۱۳۸CrossRef Google Scholar full-text PDF Mendeley PubMe ...
  • Kramer JA, Krawetz SA. Genesis of a novel human sequence ...
  • https://doi.org/۱۰.۱۰۱۶/S۰۷۴۲-۸۴۱۳(۹۸)۱۰۰۶۲-۲CrossRef Google Scholar full-text PDF Mendeley PubMe ...
  • Sarasa J, Enciso M, García L, Leza A, Steger K, ...
  • https://doi.org/۱۰.۴۱۰۳/aja.aja_۱۴۶_۱۹CrossRef Google Scholar full-text PDF Mendeley PubMed PubMed Central۱۱. Wu ...
  • https://doi.org/۱۰.۱۹۱۹۳/۰۳۹۳-۶۳۸۴_۲۰۲۱_۲_۱۲۴CrossRef Google Scholar full-text PDF Mendele ...
  • Arauz-Garofalo G, Jodar M, Vilanova M, de la Iglesia Rodriguez ...
  • https://doi.org/۱۰.۳۳۹۰/proteomes۹۰۲۰۰۲۱CrossRef Google Scholar full-text PDF Mendeley PubMed PubMed Central۱۳. Aoki ...
  • CrossRef Google Scholar full-text PDF Mendeley PubMe ...
  • Tanaka H, Miyagawa Y, Tsujimura A, Matsumiya K, Okuyama A, ...
  • https://doi.org/۱۰.۱۰۹۳/molehr/gag۰۱۰CrossRef Google Scholar full-text PDF Mendeley۱۵. He XJ, Ruan J, ...
  • https://doi.org/۱۰.۱۰۱۶/j.rbmo.۲۰۱۲.۰۹.۰۰۵CrossRef Google Scholar full-text PDF Mendeley PubMed۱۶. Lin P, Zhang ...
  • https://doi.org/۱۰.۱۹۱۹۳/۰۳۹۳-۶۳۸۴_۲۰۲۱_۳_۲۳۷CrossRef Google Scholar full-text PDF Mendele ...
  • Ferlin A, Arredi B, Speltra E, Cazzadore C, Selice R, ...
  • https://doi.org/۱۰.۱۲۱۰/jc.۲۰۰۶-۱۹۸۱CrossRef Google Scholar full-text PDF Mendeley PubMe ...
  • Yang M, Abdalrahman H, Sonia U, Mohammed AI, Vestine U, ...
  • https://doi.org/۱۰.۱۴۷۱۵/cmb/۲۰۲۰.۶۶.۲.۳CrossRef Google Scholar full-text PDF Mendeley PubMed۱۹. Zhoucun A, Zhang ...
  • https://doi.org/۱۰.۱۰۱۶/j.ejogrb.۲۰۰۵.۰۹.۰۰۱CrossRef Google Scholar full-text PDF Mendeley PubMe ...
  • Romanienko PJ, Camerini-Otero RD. Cloning, characterization, and localization of mouse ...
  • https://doi.org/۱۰.۱۰۰۶/geno.۱۹۹۹.۵۹۵۵CrossRef Google Scholar full-text PDF Mendeley PubMed۲۱. Wu D, Yin ...
  • https://doi.org/۱۰.۱۹۱۹۳/۰۳۹۳-۶۳۸۴_۲۰۲۱_۲_۱۴۱CrossRef Google Scholar full-text PDF Mendele ...
  • Rovio AT, Marchington DR, Donat S, Schuppe HC, Abel J, ...
  • https://doi.org/۱۰.۱۰۳۸/ng۷۵۹CrossRef Google Scholar full-text PDF Mendeley PubMe ...
  • Gromoll J, Simoni M. Genetic complexity of FSH receptor function. ...
  • https://doi.org/۱۰.۱۰۱۶/j.tem.۲۰۰۵.۰۵.۰۱۱CrossRef Google Scholar full-text PDF Mendeley PubMe ...
  • Abdallah WI, Hussein TM, Elsayed ET, Bahgat RS. The c.-۱۹۰ ...
  • https://doi.org/۱۰.۱۱۱۱/and.۱۳۳۶۷CrossRef Google Scholar full-text PDF Mendeley PubMe ...
  • Patankar A, Parte P. Sperm chromatin compaction and male infertility. ...
  • https://doi.org/۱۰.۱۰۰۷/۹۷۸-۹۸۱-۱۰-۴۰۱۷-۷_۱۷CrossRef Google Scholar full-text PDF Mendele ...
  • Jodar M, Oriola J, Mestre G, Castillo J, Giwercman A, ...
  • https://doi.org/۱۰.۱۱۱۱/j.۱۳۶۵-۲۶۰۵.۲۰۱۰.۰۱۱۱۵.xCrossRef Google Scholar full-text PDF Mendeley PubMe ...
  • Iguchi N, Yang S, Lamb DJ, Hecht NB. An SNP ...
  • http://dx.doi.org/۱۰.۱۱۳۶/jmg.۲۰۰۵.۰۳۷۱۶۸CrossRef Google Scholar full-text PDF Mendeley PubMed PubMed Central۲۸. Ravel ...
  • https://doi.org/۱۰.۱۰۹۳/molehr/gam۰۳۱CrossRef Google Scholar full-text PDF Mendeley PubMe ...
  • Wen L, Zhang Y, Yang B, Han F, Ebadi AG, ...
  • https://doi.org/۱۰.۱۴۷۱۵/cmb/۲۰۲۰.۶۶.۵.۲۱CrossRef Google Scholar full-text PDF Mendeley PubMe ...
  • Grassetti D, Paoli D, Gallo M, D’Ambrosio A, Lombardo F, ...
  • https://doi.org/۱۰.۳۲۷۵/۸۱۱۱CrossRef Google Scholar full-text PDF Mendeley PubMed۳۱. Qu W, Huang ...
  • https://doi.org/۱۰.۱۹۱۹۳/۰۳۹۳-۶۳۸۴_۲۰۲۱_۱_۹۷CrossRef Google Scholar full-text PDF Mendele ...
  • Cho C, Jung-Ha H, Willis WD, Goulding EH, Stein P, ...
  • https://doi.org/۱۰.۱۰۹۵/biolreprod.۱۰۲.۰۱۵۱۱۵CrossRef Google Scholar full-text PDF Mendeley PubMe ...
  • Cho C, Willis WD, Goulding EH, Jung-Ha H, Choi YC, ...
  • https://doi.org/۱۰.۱۰۳۸/ng۰۵۰۱-۸۲CrossRef Google Scholar full-text PDF Mendeley PubMe ...
  • Carrell DT, Liu L. Altered protamine ۲ expression is uncommon ...
  • https://doi.org/۱۰.۱۰۰۲/j.۱۹۳۹-۴۶۴۰.۲۰۰۱.tb۰۲۲۲۰.xCrossRef Google Scholar full-text PDF Mendeley PubMe ...
  • نمایش کامل مراجع