مروری برکاربرد روش های شبیه سازی دینامیک مولکولی در مطالعه بین ACE۲ انسان و گیرنده گلیکوپروتئین SARS-COV-۲

ویروس کورونا (SARS-COV-۲) در ژانویه ۲۰۲۰ به عنوان عامل بیماری زای بیماری حاد تنفسی شناسایی شده است و شیوع این بیماری در اواخر سال ۲۰۱۹ در ووهان چین آغاز شد. SARS-COV-۲ از لحاظ تحلیل ژنومی به SARS-COV بسیار نزدیک است. پروتئین آنزیم آنژیوتانسین (ACE۲) ۲ توسط SARS-COV-۲ به عنوان یک عامل گیرنده توسط اتصال گلیکوپروتئین اسپایک شناخته شده است. انجام مطالعات آزمایشگاهی علاوه بر لزوم صرف زمان زیاد، با هزینه های بالا و خطاهایی همراه است. روش های شبیه سازی راهکارهای جایگزین منا سبی برای این منظور ه ستند. با ا ستفاده از شبیه سازی دینامیک مولکولی می توان بر مبنای نظری و با صرفه جویی در زمان و هزینه، رفتار ویروس SARS-COV-۲ بر پروتئین انسانی ACE۲ را مورد مطالعه قرار داد و اطلاعات مفید بیشتری به دست آورد. در این مقاله، ابتدا اصول شبیه سازی دینامیک مولکولی مورد بررسی قرار گرفته است و سپس مروری بر تحقیقات انجام شده در زمینه عملکرد و تاثیر جهش SARS-COV-۲ با گیرنده ACE۲ سلول میزبان صورت گرفته و انواع نرم افزارهای موجود برای شبیه سازی دینامیک مولکولی این خواص، معرفی شده است.

کلیدواژه ها:

SARS-COV-۲ ، گلیکوپروتئین اسپایک ، ACE۲ ، دینامیک مولکولی