شبیه سازی برهمکنش مهارکننده dGTP, dGDP, dGMP, dIMP, Ditp با آنزیم داکسی گوانوزین کیناز
سال انتشار: 1390
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 1,189
فایل این مقاله در 5 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد
- صدور گواهی نمایه سازی
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
CMRCE03_339
تاریخ نمایه سازی: 13 دی 1390
چکیده مقاله:
دراین تحقیق برهمکنش آنزیم داکسی گوانزین کیناز Dgk با مهارکننده های نوکلئوتیدی آن dGTP, dGDP ,dGMP dIMP, dITP بوسیله شبیه سازی دینامیک مولکولی در طول مدت دو نانوثانیه مطالعه گردید. دراین مطالعه نسخه 3.3.2 نرم افزار گرومکس قابل نصب در سیستم عامل لینوکس برای انجام محاسبات دینامیک مولکولی استفاده گردید هدف ازاین تحقیق مطالعه مکانیسم عمل مهارکننده های آنزیم داکسی گوانوزین کیناز و بررسی عوامل ساختمانی در این فرایند مهاری می باشد از آنجایی که آنزیم داکسی گوانزین کیناز اولین آنزیم موثر در مسیر بازیافتی تولید نوکلئوتیدهای پورینی در موجودات زنده است و مهار آن می تواند نتایج بیولوژیکی مهمی بدنبال داشته باشد. نتایج بدست آمده ازاین تحقیق نشان میدهد که بیشترین برهمکنش با داکسی گوانوزین کیناز و قدرت مهاری بیشتر متعلق به مهار کننده ای است که دارای بیشترین انحراف معیار جذر میانگین مربعات اسکلت پروتئین RMSD نسبت به ساختار اولیه در طول شبیه سازی و همچنین دارای بیشترین وزن مولکولی و بیشترین اندیکس انتگرال می باشد و بیشترین تاثیر را برساختار آنزیم اعمال می کند براساس یافته های حاصل دریافتیم که مهارکننده dGTP بعنوان قویترین مهارکننده آنزیم دربایندینگ سایتی ویژه واقع در انتهای کربوکسیل آنزیم آنهم از طریق برقراری برهمکنشهای الکتروستاتیک اتصال می یابد.
کلیدواژه ها:
نویسندگان
سهیلا غلامیان
دانشجوی گروه شیمی فیزیک دانشگاه آزاد اسلامی واحد علوم و تحقیقات خوزستان
محمدرضا دایر
استادیار گروه زیست شناسی دانشگاه شهید چمران اهواز
مراجع و منابع این مقاله:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :