تنوع ژنتیکی سنجاب زمینی زرد Spermophilus fulvus (Lichtenstein, ۱۸۲۳) در ایران

سال انتشار: 1399
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 305

فایل این مقاله در 11 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

JR_AEJO-12-4_020

تاریخ نمایه سازی: 12 آبان 1400

چکیده مقاله:

هدف از این مطالعه بررسی تنوع، تغییرات و ساختار ژنتیکی جمعیت های سنجاب زمینی زرد (Spermophilus fulvus) در ایران است. بدین منظور ۷۹ نمونه بافت این گونه از هفت استان (خراسان رضوی، خراسان شمالی، زنجان، قزوین، البرز، همدان و کردستان) جمع آوری شد. پس از استخراج DNA و واکنش زنجیره ­ای پلی­مراز، تنوع ژنتیکی  با استفاده از توالی کامل ژن سیتوکروم b (۱۱۴۰ جفت باز) مورد بررسی قرار گرفت. نتایج درخت بایزین و حداکثر درست­ نمایی بر پایه این ژن  برای ۷۹ فرد نشان داد که سنجاب زمینی زرد (S. fulvus) با توزیع جغرافیایی وسیع از شرق تا غرب ایران شامل سه تبار فیلوژنتیکی است. تبار اول مربوط به شرقی ­ترین جمعیت­ های این گونه در نوار مرزی ایران و افغانستان بوده و تبار دوم و سوم شامل سایر جمعیت ­های این گونه از استان های شمال ­شرقی تا غرب ایران شامل خراسان رضوی، خراسان شمالی، زنجان و کردستان و نیز قزوین، البرز و همدان است. بررسی ها  وقوع گسترش ناگهانی در جمعیت­ های این گونه را تصدیق نمود. ۲۶ هاپلوتایپ منحصر به فرد و ۳۵ جایگاه متغیر از نتایج بررسی تنوع ژنتیکی جمعیت های ایرانی سنجاب زمینی زرد بوده و  این گونه در ایران تنوع هاپلوتایپی و ژنتیکی بالایی را براساس ژن میتوکندریایی مذکور نشان داده است. تجزیه واریانس مولکولی و شاخص FST ساختار ژنتیکی متفاوت و معنی ­داری را در بین جمعیت ها مشخص ساخته است. درنهایت درنظر گرفتن یک واحد تکاملی معنی­ دار برای هر تبار مجزای این گونه برای اهداف مدیریت حفاظت سنجاب زمینی زرد در ایران و نیز برای تداوم بقای آن پیشنهاد می­ گردد.

نویسندگان

افسانه اصغرزاده

گروه محیط زیست، دانشکده منابع طبیعی و محیط زیست، واحد علوم و تحقیقات، دانشگاه آزاد اسلامی، تهران، ایران

محمد کابلی

گروه محیط زیست، دانشکده منابع طبیعی، دانشگاه تهران، کرج، ایران

حسن رجبی مهام

گروه علوم و زیست فناوری جانوری، دانشکده علوم و فناوری زیستی، دانشگاه شهید بهشتی، تهران، ایران

مرتضی نادری

گروه علوم محیط زیست، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه اراک، اراک، ایران

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • کرمی، م.؛ فیض ­الهی، ک. و قدیریان، ط.، ۱۳۹۵. اطلس ...
  • Asgharzadeh, A.; Kaboli, M.; Rajabi-Maham, H. and Naderi, M., ۲۰۱۹. ...
  • Ashton, K.G. and de Queiroz, A., ۲۰۰۱. Molecular systematics of ...
  • Avise, J.C., ۲۰۰۰. Phylogeography: the history and formation of species: ...
  • Bataillon, T.M.; David, J.L. and Schoen, D.J., ۱۹۹۶. Neutral genetic ...
  • Colombo, F.; Marchisio, E.; Pizzini, A. and Cantoni, C., ۲۰۰۲. Identification ...
  • Davison, J.; Ho, S.Y.; Bray, S.C.; Korsten, M.; Tammeleht, E.; ...
  • Faerman, M.; Bar-Gal, G.K.; Boaretto, E.; Boeskorov, G.G.; Dokuchaev, N.E.; ...
  • Fraser, D.J. and Bernatchez, L., ۲۰۰۱. Adaptive evolutionary conservation: towards ...
  • Frankham, R.; Briscoe, D.A. and Ballou, J.D., ۲۰۰۲. Introduction to ...
  • Fu, Y.X., ۱۹۹۷. Statistical tests of neutrality of mutations against ...
  • Gündüz, İ.; Jaarola, M.; Tez, C.; Yeniyurt, C.; Polly, P.D. ...
  • Harrison, R.G.; Bogdanowicz, S.M.; Hoffmann, R.S.; Yensen, E. and Sherman, ...
  • Helgen, K.M.; Cole, F.R.; Helgen, L.E. and Wilson, D.E., ۲۰۰۹. Generic ...
  • Herkert, J.R., ۱۹۹۴. The effects of habitat fragmentation on midwestern ...
  • Herron, M.D.; Castoe, T.A. and Parkinson, C.L., ۲۰۰۴. Sciurid phylogeny ...
  • Hrbek, T.; Farias, I.P.; Crossa, M.; Sampaio, I.; Porto, J.I. ...
  • IUCN. ۲۰۱۹. The IUCN Red List of threatened species. Version ...
  • Kapustina, S.Y.; Brandler, O.V. and Adiya, Y., ۲۰۱۵. Phylogeny of ...
  • Khalilipour, O.; Rezaei, H.R.; Alizadeh Shabani, A.; Kaboli, M. and ...
  • Kryštufek, B.; Bryja, J. and Bužan, E.V., ۲۰۰۹. Mitochondrial phylogeography ...
  • Kryštufek, B. and Vohralík, V., ۲۰۱۲. Taxonomic revision of the ...
  • Lanfear, R.; Calcott, B.; Ho, S.Y.W. and Guindon, S., ۲۰۱۲. PartitionFinder: ...
  • Leigh, J.W. and Bryant, D., ۲۰۱۵. POPART: full-feature software for ...
  • Librado, P. and Rozas, J., ۲۰۰۹. DnaSP v۵: a software ...
  • McNeely, J.A.; Miller, K.R.; Reid, W.V.; Mittermeier,R.A. and Werner, T.B., ...
  • Milá, B.; McCormack, J.E.; Castañeda, G.; Wayne, R.K. and Smith, ...
  • Nguyen, L.T.; Schmidt, H.A.; von Haeseler, A. and Minh, B.Q., ...
  • Rambaut, A. and Drummond, A.J., ۲۰۰۷. Tracer. v. ۱.۵ Available: ...
  • Rambaut, A. and Drummond, A.J., ۲۰۱۲. Fig Tree: Tree Figure ...
  • Ronquist, F. and Huelsenbeck, J.P., ۲۰۰۳. MrBayes ۳: Bayesian phylogenetic ...
  • Sambrook, J.; Fritsch, E.F. and Maniatis, T., ۱۹۸۹. Molecular Cloning: ...
  • Slatkin, M. and Hudson, R.R., ۱۹۹۱. Pairwise comparisons of mitochondrial ...
  • Stümpel, N.; Rajabizadeh, M.; Avcı, A.; Wüster, W. and Joger, ...
  • Tajima, F., ۱۹۸۹. Statistical method for testing the neutral mutation ...
  • Tamura, K.; Stecher, G.; Peterson, D.; Filipski, A. and Kumar, ...
  • Thorington, R.W.J.; Koprowski, J.L.; Steele, M.A. and Whatton, J.F., ۲۰۱۲. ...
  • Wang, L.Y.; Ikeda, H.; Liu, T.L.; Wang, Y.J. and Liu, ...
  • Wink, M. and Heidrich, P., ۲۰۰۰. Molecular systematics of owls ...
  • Xia, X. and Lemey, P., ۲۰۰۹. Assessing substitution saturation with ...
  • Xia, X. and Xie, Z., ۲۰۰۱. DAMBE: software package for ...
  • نمایش کامل مراجع