تجزیه ارتباطی صفات کمی در به نژادی مولکولی غلات (مقاله مروری)

هادی علی پور; رضا درویش زاده

تجزیه ارتباطی صفات کمی در به نژادی مولکولی غلات (مقاله مروری)

محل انتشار: فصلنامه تحقیقات غلات، دوره: 9، شماره: 3

سال انتشار: 1398

نوع سند: مقاله ژورنالی

زبان: فارسی

مشاهده: 260

فایل این مقاله در 28 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

دریافت فایل کامل مقاله

صدور گواهی نمایه سازی
من نویسنده این مقاله هستم

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

https://civilica.com/doc/1296233

شناسه ملی سند علمی:

JR_CRGU-9-3_007

تاریخ نمایه سازی: 3 آبان 1400

چکیده مقاله:

زمینه مطالعاتی نقشه یابی ارتباطی اخیرا توجه زیادی را برای مطالعه ژنتیکی صفات کمی در بسیاری از گیاهان مهم به خود جلب کرده است. دسترسی به فناوریهای نسل جدید توالی یابی، حجم بالای داده های فنوتیپی و تنوع زیاد ابزارهای آماری موجب شده است که مطالعات نقشه یابی ارتباطی در گیاهان بتواند موفقیت های فراوانی را در شناسایی مکان های ژنی کنترل کننده صفات کمی بههمراه داشته باشد. با توجه به اهمیت این روش در مطالعات نقشهیابی صفات کمی، مقاله حاضر تهیه شد که هدف از آن، توضیح روش نقشه یابی ارتباطی و استفاده از آن در به نژادی گیاهی بهویژه غلات بود. همچنین، در این مقاله برخی از اطلاعات مربوط به نرم افزارهای آماری مورد استفاده در نقشه یابی ارتباطی ارایه میشود و پس از آن در مورد فرصت ها و چالش های نقشه یابی ارتباطی و مطالعات پسا نقشه یابی در سطح کل ژنوم بحث خواهد شد. در انتها نیز با ارایه مثالی ساده، مقدار عددی نامتعادلی پیوستگی و نقشه یابی ارتباطی بر اساس مدل خطی عمومی (GLM=General Linear Model) و مدل خطی مخلوط (MLM=Mixed Linear Model) برآورد خواهد شد.

کلیدواژه ها:

روابط خویشاوندی ، ساختار جمعیت ، مدل خطی مخلوط ، نقشه یابی در سطح ژنوم

نویسندگان

هادی علی پور

استادیار، گروه تولید و ژنتیک گیاهی، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه ارومیه، ارومیه، ایران

رضا درویش زاده

استاد، گروه تولید و ژنتیک گیاهی، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه ارومیه، ارومیه، ایران

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :

Abdurakhmonov, I. Y. and Abdukarimov, A. ۲۰۰۸. Application of association ...
Abdurakhmonov, I. Y., Kohel, R. J., Yu, J. Z., Pepper, ...
Abe, A., Kosugi, S., Yoshida, K., Natsume, S., Takagi, H., ...
Abedi, S., Darvishzadeh, R., Bernousi, I., Abdollahi Mandoulakani, B., Hatami ...
Ahmadpour, S., Sofalian, O., Darvishzadeh, R. and Abbaspour, N. ۲۰۱۸. ...
Bamshad, M., Wooding, S., Salisbury, B. A. and Stephens, J. ...
Basirnia, A., Hatami Maleki, H., Darvishzadeh, R. and Ghavami F. ۲۰۱۴. Mixed ...
Begum, H., Spindel, J. E., Lalusin, A., Borromeo, T., Gregorio, ...
Bernardo, R. and Yu, J. ۲۰۰۷. Prospects for genomewide selection ...
Beyer, S., Daba, S., Tyagi, P., Bockelman, H., Brown-Guedira, G. ...
Bradbury, P. J., Zhang, Z., Kroon, D. E., Casstevens, T. ...
Brenchley, R., Spannagl, M., Pfeifer, M., Barker, G. L., D’Amore, ...
Camus-Kulandaivelu, L., Veyrieras, J. B., Madur, D., Combes, V., Fourmann, ...
Chen, W., Gao, Y., Xie, W., Gong, L., Lu, K., ...
Cui, Y., Zhang, F. and Zhou, Y. ۲۰۱۸. The application ...
Dadras, A. R., Sabouri, H., Nejad, G. M., Sabouri, A. ...
Darvishzadeh, R. ۲۰۱۶a. Population structure, linkage disequilibrium and association mapping ...
Darvishzadeh, R. ۲۰۱۶b. Detection of ISSR markers linked to seed ...
Darvishzadeh, R. ۲۰۱۶c. Genetic variability, structure analysis, and association mapping of ...
Darvishzadeh, R., Basirnia A., Hatami Maleki H. and Jafari M. ...
Darvishzadeh, R., Heidari, A. and Hatami Maleki, H. ۲۰۱۶. Identification ...
Darvishzadeh, R., Poormohammad Kiani, S., Huguet, T. and Sarrafi, A. ...
Davar, R., Darvishzadeh, R., Rezaee Danesh, Y., Kholghi, M., Azizi, M ...
Devlin, B., Bacanu, S. A. and Roeder, K. ۲۰۰۴. Genomic ...
Devlin, B. and Risch, N. ۱۹۹۵. A comparison of linkage ...
Devlin, B. and Roeder, K. ۱۹۹۹. Genomic control for association ...
Devlin, B., Roeder, K. and Wasserman, L. ۲۰۰۱. Genomic control, ...
Dingkuhn, M., Pasco, R., Pasuquin, J. M., Damo, J., Soulié, ...
El Mannai, Y., Shehzad, T. and Okuno, K. ۲۰۱۱. Variation ...
Elshire, R. J., Glaubitz, J. C., Sun, Q., Poland, J. ...
Fusari, C. M., Di Rienzo, J. A., Troglia, C., Nishinakamasu, ...
Gabriel, S. B., Schaffner, S. F., Nguyen, H., Moore, J. ...
Ghaffari Azar A., Darvishzadeh, R., Hatami Maleki, H., Kahrizi, D., ...
Goodarzi, F., Hassani, A., Darvishzadeh, R. and Hatami Maleki, H. ...
Gupta, P. K., Kulwal, P. L. and Jaiswal, V. ۲۰۱۹. ...
Gupta, P. K., Rustgi, S. and Kulwal, P. L. ۲۰۰۵. ...
Hao, D., Xue, L., Zhang, Z., Cheng, Y., Chen, G., ...
Hayes, B. and Goddard, M. ۲۰۰۱. Prediction of total genetic ...
Hedrick, P. W. ۱۹۸۷. Gametic disequilibrium measures: Proceed with caution. ...
Hill, W. and Robertson, A. ۱۹۶۸. Linkage disequilibrium in finite ...
Hill, W. and Weir, B. ۱۹۹۴. Maximum-likelihood estimation of gene ...
Hindu, V., Palacios-Rojas, N., Babu, R., Suwarno, W. B., Rashid, ...
Holland, J. B. ۲۰۰۷. Genetic architecture of complex traits in ...
Hu, X., Zuo, J., Wang, J., Liu, L., Sun, G., ...
Huang, X., Feng, Q., Qian, Q., Zhao, Q., Wang, L., ...
Huang, X., Yang, S., Gong, J., Zhao, Y., Feng, Q., ...
Jabbari, M., Fakheri, B. A., Aghnoum, R., Mahdi Nezhad, N. ...
Jain, S. M., Brar, D. S. ۲۰۱۰. Molecular techniques in ...
Jia, Z., Liu, Y., Gruber, B. D., Neumann, K., Kilian, ...
Kordrostami, M., Rabiei, B. and Hassani Kumleh, H. ۲۰۱۶. Association ...
Kumar, J., Saripalli, G., Gahlaut, V., Goel, N., Meher, P. ...
Kumar, V., Singh, A., Mithra, S. A., Krishnamurthy, S., Parida, ...
Lekklar, C., Pongpanich, M., Suriya-Arunroj, D., Chinpongpanich, A., Tsai, H., ...
Levin, M. L. and Bertell, S. R. ۱۹۷۸. RE:simple estimation ...
Lewontin, R. ۱۹۶۴. The interaction of selection and linkage. I. ...
Li, G., Xu, X., Tan, C., Carver, B. F., Bai, ...
Li, H., Peng, Z., Yang, X., Wang, W., Fu, J., ...
Li, J., Huang, X., Heinrichs, F., Ganal, M. and Röder, ...
Li, T., Qu, J., Wang, Y., Chang, L., He, K., ...
Lipka, A. E., Tian, F., Wang, Q., Peiffer, J., Li, ...
Liu, E., Liu, X., Zeng, S., Zhao, K., Zhu, C., ...
Liu, E., Liu, Y., Wu, G., Zeng, S., Thi, T., ...
Liu, K. and Muse, S. V. ۲۰۰۵. PowerMarker: integrated analysis ...
Long, A. D. and Langley, C. H. ۱۹۹۹. The power ...
Lu, Q., Niu, X., Zhang, M., Wang, C., Xu, Q., ...
Lu, Y., Liu, Y., Niu, X., Yang, Q., Hu, X., ...
Luo, X., Wang, B., Gao, S., Zhang, F., Terzaghi, W. ...
Ma, F., Xu, Y., Ma, Z., Li, L. and An, ...
Ma, X., Feng, F., Wei, H., Mei, H., Xu, K., ...
Matsuda, F., Nakabayashi, R., Yang, Z., Okazaki, Y., Yonemaru, J. ...
Mayer, K. F., Waugh, R., Brown, J. W., Schulman, A., ...
Melchinger, A. E. and Gumber, R. K. ۱۹۹۸. Overview of ...
Moose, S. P. and Mumm, R. H. ۲۰۰۸. Molecular plant ...
Myles, S., Peiffer, J., Brown, P. J., Ersoz, E. S., ...
Najafzadeh, R., Darvishzadeh, R., Musa-Khalifani, Kh., Abrinbana, M. and Alipour, ...
Ng, S. B., Turner, E. H., Robertson, P. D., Flygare, ...
Novakazi, F., Afanasenko, O., Anisimova, A., Platz, G. J., Snowdon, ...
Oraguzie, N. C., Wilcox, P. L., Rikkerink, E. H. and ...
Oyiga, B. C., Sharma, R. C., Baum, M., Ogbonnaya, F. ...
Pham, A. T., Maurer, A., Pillen, K., Brien, C., Dowling, ...
Pritchard, J. K. ۲۰۰۱. Deconstructing maize population structure. Nature Genetics ...
Pritchard, J. K., Stephens, M. and Donnelly, P. ۲۰۰۰a. Inference ...
Pritchard, J. K., Stephens, M., Rosenberg, N. A. and Donnelly, ...
Razi, M., Darvishzadeh R., Amiri, M. E., Doulati-Baneh, H. and ...
Reich, D. E., Cargill, M., Bolk, S., Ireland, J., Sabeti, ...
Roy, J. K., Smith, K. P., Muehlbauer, G. J., Chao, ...
Sabeti, P. C., Reich, D. E., Higgins, J. M., Levine, ...
Saeed A. and Darvishzadeh R. ۲۰۱۷. Association analysis of biotic ...
Saeed, A., Darvishzadeh, R. and Basirnia, A. ۲۰۱۳. Simple sequence ...
Sameri, M., Takeda, K. and Komatsuda, T. ۲۰۰۶. Quantitative trait ...
Schneeberger, K., Ossowski, S., Lanz, C., Juul, T., Petersen, A. ...
Schulze, T. G. and McMahon, F. J. ۲۰۰۲. Genetic association ...
Shehzad, T., Iwata, H. and Okuno, K. ۲۰۰۹. Genome-wide association ...
Sheoran, S., Jaiswal, S., Kumar, D., Raghav, N., Sharma, R., ...
Singh, D., Ziems, L.A., Dracatos, P. M., Pourkheirandish, M., Tshewang, ...
Soleimani Gezeljeh, A., Darvishzadeh, R., Ebrahimi, A. and Bihamta, M. ...
Springer, N. M., Ying, K., Fu, Y., Ji, T., Yeh, ...
Stich, B., Maurer, H. P., Melchinger, A. E., Frisch, M., ...
Stich, B., Melchinger, A. E., Frisch, M., Maurer, H. P., ...
Stich, B., Melchinger, A. E., Piepho, H. P., Hamrit, S., ...
Tabkhkar, N., Rabiei, B., Samizadeh Lahiji, H. and Hosseini Chaleshtori, ...
Tessmann, E. and Van Sanford, D. ۲۰۱۸. GWAS for fusarium ...
Thornsberry, J. M., Goodman, M. M., Doebley, J., Kresovich, S., ...
Ueda, Y., Frimpong, F., Qi, Y., Matthus, E., Wu, L., ...
Varshney, R., Paulo, M., Grando, S., Van Eeuwijk, F., Keizer, ...
Wang, Y. and Rannala, B. ۲۰۰۵. In silico analysis of ...
Wang, Z., Gerstein, M. and Snyder, M. ۲۰۰۹. RNA-Seq: a ...
Wright, S. I. and Gaut, B. S. ۲۰۰۴. Molecular population ...
Wu, L., Zhang, Y., He, Y., Jiang, P., Zhang, X. ...
Xu, X., Sharma, R., Tondelli, A., Russell, J., Comadran, J., ...
Xu, Y., Li, P., Yang, Z. and Xu, C. ۲۰۱۷. ...
Yano, K., Yamamoto, E., Aya, K., Takeuchi, H., Lo, P. ...
Yu, J. and Buckler, E. S. ۲۰۰۶. Genetic association mapping ...
Yu, J., Pressoir, G., Briggs, W. H., Bi, I. V., ...
Zarbafi, S. S., Rabiei, B., Ebadi, A. A. and Ham, ...
Zhang, M., Lu, Q., Wu, W., Niu, X., Wang, C., ...
Zhang, Y., Liu, P., Zhang, X., Zheng, Q., Chen, M., ...
Zhang, Z., Buckler, E. S., Casstevens, T. M. and Bradbury, ...
Zhao, Y., Li, Z., Liu, G., Jiang, Y., Maurer, H.P., ...
Zhu, C., Gore, M., Buckler, E. S. and Yu, J. ...
Zhu, X., Shao, X., Pei, Y., Guo, X., Li, J., ...

نمایش کامل مراجع