ورود
مقالات فارسیISIکنفرانسهاژورنالها

شناسایی بیوانفورماتیکی و بررسی بیان miRNA های دخیل در نمو دانه ارقام گندم ایرانی با کیفیت نانوایی متفاوت

محل انتشار: فصلنامه تحقیقات غلات، دوره: 10، شماره: 2
سال انتشار: 1399
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 228

فایل این مقاله در 13 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:
https://civilica.com/doc/1296207

شناسه ملی سند علمی:

JR_CRGU-10-2_002

تاریخ نمایه سازی: 3 آبان 1400

چکیده مقاله:

کیفیت نانوایی گندم (Triticum aestivum L.) به­شدت وابسته به حضور و ترکیب پروتئین­های گلوتن در دانه است. در این مطالعه، کیفیت نانوایی چهار رقم گندم ایرانی (مروارید، سرداری، پارسی و سپاهان) بر اساس آنالیزهای فارینوگرافی و شیمیایی آرد و حجم ویژه نان به­ترتیب از بیش­ترین به کم­ترین کیفیت رتبه­بندی شد. به­منظور شناسایی و مقایسه miRNA های دخیل در نمو دانه بین گندم­های ایرانی با کیفیت نانوایی خوب و ضعیف، داده­های RNA-seq هفت رقم گندم (چهار رقم با کیفیت خوب و سه رقم با کیفیت ضعیف) در دو مرحله نموی دانه از پایگاه اطلاعاتی NCBI پیاده­سازی و آنالیز شدند. از miRNA های شناسایی شده، پنج miRNA حفاظت­شده انتخاب و الگوی بیان آن­ها با استفاده از روش Real Time PCR در دو مرحله نموی دانه (۱۰ و ۲۰ روز پس از گرده­افشانی) در چهار رقم گندم  ایرانی بررسی شد. نتایج نشان داد که الگوی بیان miR۱۵۹a، miR۱۶۴a، miR۱۷۲a و miR۸۲۷a طی نمو دانه در همه ارقام مورد بررسی روند افزایشی داشت، در حالی­که الگوی بیان miR۳۹۶c روندی کاهشی نشان داد. miR۱۶۴a و miR۳۹۶c بیش­ترین و کم­ترین بیان نسبی را به­ترتیب در ارقام سپاهان و سرداری (به­ترتیب با کم­ترین و بیش­ترین وزن هزار دانه) نشان دادند که می­تواند در نتیجه نقش تنظیم­کنندگی منفی آن­ها بر اندازه دانه باشد. همچنین، با افزایش کیفیت نانوایی ارقام مورد بررسی، بیان نسبی miR۱۷۲a و miR۱۵۹a که به­ترتیب در سنتز نشاسته و پروتئین­های ذخیره­ای دانه دخیل هستند، کاهش و بیان miR۸۲۷a که در فرایند انتقال مجدد نیتروژن از برگ به دانه دخیل است، افزایش یافت که نشان­دهنده آثار منفی miR۱۷۲a و miR۱۵۹a و مثبت miR۸۲۷a بر کیفیت نانوایی ارقام گندم می­باشد.

کلیدواژه ها:

نویسندگان

رضا صمیمی فرد

دانش آموخته دکتری، گروه بیوتکنولوژی کشاورزی، دانشکده علوم کشاورزی، دانشگاه گیلان، رشت، ایران

بابک ربیعی

استاد، گروه مهندسی تولید و ژنتیک گیاهی، دانشکده علوم کشاورزی، دانشگاه گیلان، رشت، ایران

بهرام ملکی زنجانی

دانشیار، گروه تولید و ژنتیک گیاهی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه زنجان، زنجان، ایران

جلال صبا

استاد، گروه تولید و ژنتیک گیاهی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه زنجان، زنجان، ایران

عباس بهاری

استادیار، پژوهشکده فناوری های نوین زیستی، دانشگاه زنجان، زنجان، ایران

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • AACC, ۲۰۰۰. Approved methods of the American association of cereal ...
  • Aghagholizadeh, R., Kadivar, M., Nazari, M., Mousavi, F., Azizi, M. ...
  • Arunachalam, V. and Bandyopadhyay, A. ۱۹۸۴. Limits to genetic divergence ...
  • Barak, S., Mudgil, D. and Khatkar, B. S. ۲۰۱۳. Relationship ...
  • Barak, S., Mudgil, D. and Khatkar, B. S. ۲۰۱۴. Influence ...
  • Borrill, P., Harrington, S. A. and Uauy, C. ۲۰۱۷. Genome-wide ...
  • Chen, C., Ridzon, D. A., Broomer, A. J., Zhou, Z., ...
  • Chu, Z., Chen, J., Xu, H., Dong, Z., Chen, F. ...
  • Effects of genotype and environment on breadmaking quality in wheat [مقاله ژورنالی]
  • Diaz, I., Vicente-Carbajosa, J., Abraham, Z., Martínez, M., Isabel‐La Moneda, ...
  • Dowell, F. E., Maghirang, E. B., Pierce, R. O., Lookhart, ...
  • Duan, P., Ni, S., Wang, J., Zhang, B., Xu, R., ...
  • Elangovan, M., Rai, R., Dholakia, B. B., Lagu, M. D., ...
  • Fu, F. F. and Xue, H. W. ۲۰۱۰. Coexpression analysis ...
  • Gasparis, S., Yanushevska, Y. and Nadolska-Orczyk, A. ۲۰۱۷. Bioinformatic identification ...
  • Gobaa, S., Brabant, C., Kleijer, G. and Stamp, P. ۲۰۰۸. ...
  • Guo, W., Yang, H., Liu, Y., Gao, Y., Ni, Z., ...
  • Han, R., Jian, C., Lv, J., Yan, Y., Chi, Q., ...
  • Hu, J., Wang, Y., Fang, Y., Zeng, L., Xu, J., ...
  • Jiang, D., Chen, W., Dong, J., Li, J., Yang, F., ...
  • Jin, X., Fu, Z., Lv, P., Peng, Q., Ding, D., ...
  • Kang, G. Z., Xu, W., Liu, G. Q., Peng, X. ...
  • Khatkar, B. S., Bell, A. E. and Schofield, J. D. ...
  • Lee, Y. S., Lee, D. Y., Cho, L. H. and ...
  • Li, D., Liu, Z., Gao, L., Wang, L., Gao, M., ...
  • Li, S., Gao, F., Xie, K., Zeng, X., Cao, Y., ...
  • Li, T., Ma, L., Geng, Y., Hao, C., Chen, X. ...
  • Liu, W., Sun, Q., Wang, K., Du, Q. and Li, ...
  • Livak, K. J. and Schmittgen, T. D. ۲۰۰۱. Analysis of ...
  • Mathew, I. E., Das, S., Mahto, A. and Agarwal, P. ...
  • Meng, F., Liu, H., Wang, K., Liu, L., Wang, S., ...
  • Mutlu, A. C., Boyaci, I. H., Genis, H. E., Ozturk, ...
  • Nadaud, I., Girousse, C., Debiton, C., Chambon, C., Bouzidi, M. ...
  • Nguyen, G. N., Rothstein, S. J., Spangenberg, G. and Kant, ...
  • Pandey, R., Joshi, G., Bhardwaj, A. R., Agarwal, M. and ...
  • Rodriguez, R. E., Mecchia, M. A., Debernardi, J. M., Schommer, ...
  • Ross, A. S. and Bettge, A. D. ۲۰۰۹. Passing the ...
  • Shewry, P. R., Mitchell, R. A. C., Tosi, P., Wan, ...
  • Song, Y. and Zheng, Q. ۲۰۰۷. Dynamic rheological properties of ...
  • Sun, F., Guo, G., Du, J., Guo, W., Peng, H., ...
  • Uauy, C., Distelfeld, A., Fahima, T., Blechl, A. and Dubcovsky, ...
  • Wang, Y., Shi, C., Yang, T., Zhao, L., Chen, J., ...
  • Waters, B. M., Uauy, C., Dubcovsky, J. and Grusak, M. ...
  • Weegels, P. L., Hamer, R. J. and Schofield, J. D. ...
  • Wu, F. Y., Tang, Ch. Y., Guo, Y. M., Yang, ...
  • Zhang, K., Shi, X., Zhao, X., Ding, D., Tang, J. ...
  • Zheng, L., Zhang, X., Zhang, H., Gu, Y., Huang, X., ...
  • Zi, Y., Shen, H., Dai, S., Ma, X., Ju, W., ...
    • نمایش کامل مراجع