تعیین برخی از مشخصات بیولوژیکی و مولکولی جدایه های ایرانی ویروس بی بذری گوجه فرنگی

سال انتشار: 1391
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 255

فایل این مقاله در 17 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

JR_JOAGK-4-1_005

تاریخ نمایه سازی: 12 مهر 1400

چکیده مقاله:

      ویروس بی­بذری گوجه­فرنگی (Tomato aspermy virus, TAV) دارای دامنه میزبانی وسیعی می­باشد و اغلب در گیاهان زینتی ایجاد آلودگی می­نماید. به منظور شناسایی و بررسی خصو صیات ملکولی و بیولوژیکی این ویروس، تعداد ۴۳۶ نمونه گیاهی ار استان­های مختلف ایران جمع آوری گردید. از بین نمونه­های مورد بررسی آلودگی به TAV در سه نمونه از گیاهان زینتی با استفاده از آزمون الایزا به روش ساندویچ دو طرفه مورد تایید قرار گرفت. قطعه ۶۸۷ جفت بازی مربوط به ژن پروتئین پوششی با استفاده از آزمون RT-PCR و یک جفت آغازگر اختصاصی، تکثیر، سپس همسانه سازی و تعیین ترادف گردیدند. ترادف جدایه­های ایرانی با دیگر جدایه­های TAV، ، موجود در بانک ژن مورد مقایسه قرار گرفت. نتایج حاصل از تجزیه فیلوژنتیکی بیانگر آن است که جدایه­های مورد بررسی در دو گروه اصلی I و II قرار می­گیرند، که گروه II نیز به دو زیر گروه IIA و IIB تقسیم می­گردد. هر سه جدایه ایرانی در زیر گروه IIA واقع می­گردند. همچنین جدایه­های ایرانی دارای مشابهت بالای ترادف نوکلئوتیدی و اسیدهای­آمینه مربوط به ژن پروتئین پوششی به میزان بیش از %۹۹ با یکدیگر می­باشند. نتایج حاصل از تعیین دامنه میزبانی سه جدایه ایرانی TAV نشان­دهنده آن است که جدایه­های ایرانی از دامنه میزبانی گسترده­ای بر روی گیاهان آزمون برخوردار می­باشند. این بررسی اولین گزارش از وقوع ویروس بی­بذری گوجه­فرنگی در ایران و معرفی گیاه اطلسی به عنوان میزبان جدید این ویروس در دنیا می­باشد

کلیدواژه ها:

ویروس بی بذری گوجه فرنگی ، جایگاه تکاملی ، آزمون RT-PCR

نویسندگان

محمد مداحیان

دانشجوی سابق کارشناسی ارشد، بخش گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید باهنر کرمان

حسین معصومی

دانشیار بخش گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید باهنر کرمان

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Blencowe JW, Caldwell J (۱۹۴۹). Aspermy-A new virus disease of ...
  • Brierley P, Smith FF, Doolittle SP (۱۹۵۵). Some hosts and ...
  • Canady MA, Leja CA, Day J, McPherson A (۱۹۹۵). Preliminary ...
  • Choi SK, Choi JK, Ryn KH, Park WM (۲۰۰۱). Generation ...
  • Clark MF, Adams AN (۱۹۷۷). Characteristics of microplates method of ...
  • Habili N, Francki IB (۱۹۷۴). Comparative studies on tomato aspermy ...
  • Hollings M, Stone OM (۱۹۷۱). Tomato aspermy virus. CMI/AAB descriptions ...
  • Lin MJ, Chang CA, Chen CC, Cheng YH (۲۰۰۴). Molecular ...
  • Palukaitis P, Garcia-Arenal F (۲۰۰۳). Cucumoviruses. Advances in Virus Research ...
  • Raj SK, Kumar S, Choudhari S, Verma DK (۲۰۰۹). Biological ...
  • Raj SK, Kumar S, Verma DK, Snehi SK (۲۰۱۱). First ...
  • Shi BJ, Ding SW, Symons RH (۱۹۹۷). In vivo expression ...
  • Taliansky ME, Garcia-Arenal F (۱۹۹۵). Role of cucumovirus capsid protein ...
  • Wilson PA, Symons RH (۱۹۸۱). The RNAs of cucumoviruses: ۳΄-terminal ...
  • نمایش کامل مراجع