طراحی آنتی ژن حفاظتی پلی توپیک علیه انگل اکینوکوکوس گرانولوزوس برای هر دو میزبان اصلی و واسط

سال انتشار: 1400
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 223

فایل این مقاله در 13 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

JR_ANIMAL-31-2_002

تاریخ نمایه سازی: 3 مهر 1400

چکیده مقاله:

زمینه مطالعاتی: انگل اکینوکوکوس گرانولوزوس عامل بیماری زئونوتیک کیست هیداتیک است که در بسیاری از واحدهای دامپروری و بویژه در مناطق روستایی و حومه شهرها به لحاظ اپیدمیولوژی در وضعیت اندمیک است. میزبان های طبیعی این پاتوژن انگلی به طور عمده سگ (به عنوان میزبان اصلی)، گوسفند و انسان (به عنوان میزبان واسط) هستند. امروزه کنترل و پیشگیری این بیماری عمدتا محدود به اجرای برنامه های آموزشی، نظارتی و مدیریتی در مزارع دامپروری و کشتارگاه ها بوده است. در دهه اخیر توجه جدی به توسعه واکسن پیشگیرانه بوجود آمده است. هدف از این مطالعه معرفی ابزارها و نرم افزارهای بیوانفورماتیک هستند که در طراحی آنتی ژن حفاظتی مفید خواهند بود. روش کار: در این مطالعه از ابزارهای پیشگویی کننده ی اپی توپ مربوط به مربوط به سیستم ایمنی سلولی و هومورال استفاده گردید. همچنین از نرم افزار مدلر برای مدلینگ ساختار سوم هر یک از آنتی ژن های حفاظتی استفاده گردید. داکینگ مولکولی بین مولکول های MHC اختصاصی گونه و نیز پپتیدهای کاندید اپی توپ سلول T مورد استفاده قرار گرفت. برای این کار از نرم افزار Hex ورژن ۸ استفاده شد. نتایج: شاخص های ایمونوژنیک مربوط به هر یک از آنتی ژن ها در قالب یک سازه آنتی ژن حفاظتی مرتب گردید و توسط لینکرهای اختصاصی در کنار هم قرار گرفتند. سپس کدون ها ی این سازه آنتی ژن حفاظتی برای بیان در میزبان پروکاریوتی (Escherichia coli k۱۲) بهینه گردید. نتیجه گیری نهایی: در این مطالعه ی بیوانفورماتیک، اطلاعات کلیدی در خصوص روش شناسی گام به گام طراحی دنوو آنتی ژن حفاظتی علیه بیماری انگلی اکینوکوکوس گرانولوزوس ارائه شده است. که به نظر می رسد قابلیت حفاظت همزمان سگ و گوسفند در برابر این بیماری را داشته باشد.

نویسندگان

غلامعلی مقدم

استاد دانشکده کشاورزی

محمد مصطفی پورسیف

گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تبریز، تبریز، ایران

حسین دقیق کیا

استاد، دانشگاه تبریز

احمد نعمت الهی

استاد گروه پاتوبیولوژی، دانشکده دامپزشکی، دانشگاه تبریز

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Bethony JM, Cole RN, Guo X, Kamhawi S, Lightowlers MWand ...
  • Bingham GM, Budke CM, Larrieu E, Del Carpio M, Mujica ...
  • Carmena D and Cardona GA, ۲۰۱۴. Echinococcosis in wild carnivorous ...
  • Cong H, Zhang M, Zhang Q, Gong J, Cong H, ...
  • Craig PS, McManus DP, Lightowlers MW, Chabalgoity JA, Garcia HH, ...
  • Dalbey R and Von Heijne G, ۲۰۰۲. Protein targeting, transport, ...
  • Deplazes P, Thompson RC, Constantine CC, and Penhale WJ, ۱۹۹۴. ...
  • Eckert J and Deplazes P, ۲۰۰۴. Biological, epidemiological, and clinical ...
  • Fiser A and Sali A, ۲۰۰۳. Modeller: generation and refinement ...
  • Funakoshi M and Hochstrasser M, ۲۰۰۹. Small epitope-linker modules for ...
  • Gan W, Zhao G, Xu H, Wu W, Du W, ...
  • Gori A, Longhi R, Peri C and Colombo G, ۲۰۱۳. ...
  • Janeway CA, Travers P, Walport M, and Shlomchik M, ۲۰۰۵. ...
  • Kern P, ۲۰۰۳. Echinococcus granulosus infection: clinical presentation, medical treatment ...
  • Kitchen DB, Decornez H, Furr JR and Bajorath J, ۲۰۰۴. ...
  • Laskowski RA and Swindells MB, ۲۰۱۱. LigPlot+: multiple ligand-protein interaction ...
  • Li YJ, Yang J, Zhao H, Jia HY, Zhang LN, ...
  • Li ZJ, Wang YN, Wang Q, and Zhao W, ۲۰۱۲. ...
  • Lu G, Lu Y, Li L, Wu L, Fan Z, ...
  • Ma X, Zhou X, Zhu Y, Li Y, Wang H, ...
  • Moro P and Schantz PM, ۲۰۰۹. Echinococcosis: a review. International ...
  • Otero-Abad B and Torgerson PR, ۲۰۱۳. A systematic review of ...
  • Parker JM, Guo D, and Hodges RS, ۱۹۸۶. New hydrophilicity ...
  • Parvizpour S, Pourseif MM, Razmara J, Rafi MA and Omidi ...
  • Patronov A and Doytchinova I, ۲۰۱۳. T-cell epitope vaccine design ...
  • Pettersen EF, Goddard TD, Huang CC, Couch GS, Greenblatt DM, ...
  • Poland GA, Ovsyannikova IG, and Kennedy RB, ۲۰۱۷. Personalized vaccinology: ...
  • Pourseif MM, Moghaddam Gh, Naghili B, Saeedi N, Parvizpour S, ...
  • Pourseif MM, Moghaddam Gh, Saeedi N, Barzegari A, Dehghani J, ...
  • Pourseif MM, Moghaddam Gh, Daghighkia H, Nematollahi A, Omidi Y, ...
  • Pourseif MM, Yousefpour M, Aminianfar M, Moghaddam Gh, Nematollahi A, ...
  • Pourseif MM, Moghaddam Gh, Nematollahi A, Khordadmehr M, Naghili B, ...
  • Ritchie DW, ۲۰۰۸. Recent progress and future directions in protein-protein ...
  • Reverberi R and Reverberi L, ۲۰۰۷. Factors affecting the antigen-antibody ...
  • Shao JJ, Wong CK, Lin T, Lee SK, Cong GZ, ...
  • Shi Z, Wang Y, Li Z, Li Z, Bo Y, ...
  • Toussaint NC and Kohlbacher O, ۲۰۰۹. Towards in silico design ...
  • Tsirigos KD, Peters C, Shu N, Kall L, and Elofsson ...
  • Vercruysse J, Knox DP, Schetters TP, and Willadsen P, ۲۰۰۴. ...
  • World Health Organization (WHO),۲۰۱۷.Echinococcosis. Available at: http://wwwwhoint/mediacentre/factsheets/fs۳۷۷/en/ ...
  • Wilkins MR, Gasteiger E, Bairoch A, Sanchez JC, Williams KL, ...
  • Woollard DJ, Gauci CG, Heath DD, and Lightowlers MW, ۱۹۹۸. ...
  • نمایش کامل مراجع