استفاده از روشهای مبتنی بر هیبریداسیون جهت بررسی بیان ژن ها در بیماریهای گیاهی
- سال انتشار: 1396
- محل انتشار: اولین همایش ملی کشاورزی، منابع طبیعی و دامپزشکی
- کد COI اختصاصی: AGRONOMY01_526
- زبان مقاله: فارسی
- تعداد مشاهده: 556
نویسندگان
استادیار دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی، اردکان،
چکیده
بررسی نسخه های RNA در یک سلول و یا همان ترانسکریپتومیکس، یکی از علوم پیشرفته در زمینه علوم بعد از ژنومیک است. در واقع ترانسکریپتوم به مجموعه نسخه های RNA در نوع خاصی از یک سلول یا بافت در شرایط ویژهای از نمو یا تحت شرایط فیزیولوژیکی خاص اتلاق میشود و شامل RNA های پیامبر (mRNA)، RNA های انتقالدهنده (tRNA)، RNA ریبوزومی (rRNA) و دیگر RNA های غیر کدکننده (non-coding RNA) میشوند. علم ترانسکریپتومیکس بر روی میزان بیان ژنها با بررسی سطوح RNA تمرکز میکند. گیاهان میتوانند بعد از درک بیمارگر، سیستم دفاعی خود را فعال کنند. سرعت این فرآیند یکی از عوامل بسیار مهم در موفقیت وقوع مقاومت در گیاهان است. القای ژنهای دفاعی در گیاهان در پاسخ به بیمارگرها، در مرتبه اول در سطح رونویسی رخ میدهد و در مرتبه دوم تنظیم الگوهای بیان زمانی و مکانی ژنهای دفاعی مهمترین قسمت از دفاع گیاهی به شمار میرود. بررسی بیان ژن های دفاعی گیاهی در زمان تنش نسبت به بیمارگرها، بسیار ضروری است. نتایج این تحقیقات اطلاعات مرتبط به مکانیسم تحمل و مقاومت به بیمارگرها را افزایش داده و تولید ارقام متحمل از راه روشهای زیست فناوری را هموارتر میسازد. روشهای مختلفی جهت تجزیه پروفایل بیان ژن در گیاهان وجود دارد که در این مطالعه به بررسی دو روش که مبتنی بر هیبریداسیون قطعات نوکلئیک اسید هستند، پرداخته میشود. در روش نوردرن بلات mRNA از نمونه های بیولوژیکی استخراج و سپس این mRNA از بقیه مواد سلولی شامل DNA ، پروتئینها، لیپیدها و دیگر محتویات سلولی جداسازی خواهد شد و بعد از حرکت دادن بر روی ژل الکتروفورز و انتقال بر روی غشا، به کمک پروبهای مربوطه شناسایی میشوند. در روش ریزآرایه، هزاران پروفایل از ژنها به طور همزمان تهیه و بعد از بارگذاری بر روی چیپهای مخصوص، بهوسیله cDNA هایی که از سلولهای مورد مطالعه استخراج شده اند، مورد فرآیند هیبریداسیون قرار میگیرند.کلیدواژه ها
هیبریداسیون، نوردرن بلات، ریزآرایهمقالات مرتبط جدید
- بررسی اثر آنتی اکسیدانی عصاره گیاه دارچین بر روغن کلزا
- ساخت و بررسی عملکرد غشا زمینه آمیخته پلی ونیلاستات نانوکربنات کلسیم به منظورمقایسه میزان تراوایی گازهای دی ا کسیدکربن و نیتروژن
- بررسی بیوانفورماتیکی اثر ترکیبات سیتریک اسید ، رزوراترول ، کورکومین ، کاتچین وسیترال در مهار آنزیم ۶lu۷ به منظور درمان بیماری کرونا
- بررسی فعالیت آنزیم کاسپاز در سلول های بدون هسته خون (پلاکت) تحت تنش اسمزی
- بررسی نیمه عمر و پارامترهای ترمودینامیکی آنزیم دیافوراز ترموفیل
اطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.