ناشر تخصصی کنفرانس های ایران

لطفا کمی صبر نمایید

Publisher of Iranian Journals and Conference Proceedings

Please waite ..
ناشر تخصصی کنفرانسهای ایران
ورود |عضویت رایگان |راهنمای سایت |عضویت کتابخانه ها
عنوان
مقاله

بررسی پروفایل ترنسکریپتوم بافت تخمدان در میشهای نژاد شال با استفاده از دادههای RNA-Seq

بررسی پروفایل ترنسکریپتوم بافت تخمدان در میشهای نژاد شال با استفاده از دادههای RNA-Seq
سال انتشار: 1399
کد COI مقاله: JR_JAP-22-2_002
زبان مقاله: فارسیمشاهده این مقاله: 104
فایل این مقاله در 11 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

خرید و دانلود فایل مقاله

با استفاده از پرداخت اینترنتی بسیار سریع و ساده می توانید اصل این مقاله را که دارای 11 صفحه است به صورت فایل PDF در اختیار داشته باشید.
آدرس ایمیل خود را در کادر زیر وارد نمایید:

مشخصات نویسندگان مقاله بررسی پروفایل ترنسکریپتوم بافت تخمدان در میشهای نژاد شال با استفاده از دادههای RNA-Seq

پروین شریعتی گزگزاره - دانشجوی دکتری، گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تربیت مدرس، تهران، ایران.
علی اکبر مسعودی - دانشیار، گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تربیت مدرس، تهران، ایران.
رسول واعظ ترشیزی - دانشیار، گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تربیت مدرس، تهران، ایران.
علی رضا احسانی - استادیار، گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تربیت مدرس، تهران، ایران.
زینب موسویان - استادیار، گروه علوم کامپیوتر، دانشکده ریاضی، آمار و علوم کامپیوتر، پردیس علوم، دانشگاه تهران، تهران، ایران.

چکیده مقاله:

هدف از این مطالعه بررسی پروفایل بیان ژن در بافت تخمدان گوسفندان شال با استفاده از دادههای توالییابی RNA بود. برای این منظور، تخمدانهای پنج راس گوسفند شال بعد از همزمانسازی فحلی جداسازی و RNA آنها با استفاده از فناوری Illumina Hiseq ۴۰۰۰ توالییابی شد. بهطور میانگین، دادههای بهدست آمده از توالییابی شامل ۲۶۶۳۸۳۱۱ جفت خوانش با نرخ نقشهیابی منحصر به فرد ۸۱/۰۸ بود. نتایج حاصل از آنالیزهای بیوانفورماتیکی، بیان ۲۱۰۸۵ ژن را در بافت تخمدان گوسفندان شال نشان داد که از این تعداد ۱۵۰۸۷ ژن دارای میانگین بیان بالاتر از ۱۰ بودند. تجزیه و تحلیل عملکردی ژنها، معنیداری (p<۰/۰۵) بود ۱۶۲ عبارت GO شامل ۴۱ فرایند بیولوژیکی، ۴۶ عملکرد مولکولی و ۷۵ جز سلولی را نشان داد. همچنین آنالیز مسیرهای KEGG ، ۱۴۹ مسیر معنی دار ( p <۰/۰۵) را شناسایی کرد که مهم ترین آن ها مسیر پیام رسانی استروژن، مسیر پیام رسانی TGF-beta و تقسیم میوز اووسیت بود. بررسی بیان ژن های عمده برای دوقلوزایی و تولیدمثل، بیان بالایی برای ژن های INHA, INHBA,BMPR۱B را نشان داد و ژن INHA یک فاکتور پاراکرین مهم در فولیکول های تخمدان جز ۱۰ ژن با بالاترین میانگین بود. همچنین ژن های  FSHR, ESR۱ و ESR۲ بیان متوسط و ژن های GDF۹, BMP۱۵ و PRLR بیان پایینی در نمونه ها نشان دادند. در این مطالعه برای اولین بار ترنسکریپتوم بافت تخمدان میش های شال با استفاده از فناوری  RNA-seq بطور جامع بررسی شد و این مطالعه می تواند پایه ژنتیکی مفیدی برای شناخت بهتر ژن ها و فرایندهای درگیر در تولیدمثل گوسفندان شال فراهم کند.

کلیدواژه ها:

کد مقاله/لینک ثابت به این مقاله

کد یکتای اختصاصی (COI) این مقاله در پایگاه سیویلیکا JR_JAP-22-2_002 میباشد و برای لینک دهی به این مقاله می توانید از لینک زیر استفاده نمایید. این لینک همیشه ثابت است و به عنوان سند ثبت مقاله در مرجع سیویلیکا مورد استفاده قرار میگیرد:

https://civilica.com/doc/1189541/

نحوه استناد به مقاله:

در صورتی که می خواهید در اثر پژوهشی خود به این مقاله ارجاع دهید، به سادگی می توانید از عبارت زیر در بخش منابع و مراجع استفاده نمایید:
شریعتی گزگزاره، پروین و مسعودی، علی اکبر و واعظ ترشیزی، رسول و احسانی، علی رضا و موسویان، زینب،1399،بررسی پروفایل ترنسکریپتوم بافت تخمدان در میشهای نژاد شال با استفاده از دادههای RNA-Seq،https://civilica.com/doc/1189541

در داخل متن نیز هر جا که به عبارت و یا دستاوردی از این مقاله اشاره شود پس از ذکر مطلب، در داخل پارانتز، مشخصات زیر نوشته می شود.
برای بار اول: (1399، شریعتی گزگزاره، پروین؛ علی اکبر مسعودی و رسول واعظ ترشیزی و علی رضا احسانی و زینب موسویان)
برای بار دوم به بعد: (1399، شریعتی گزگزاره؛ مسعودی و واعظ ترشیزی و احسانی و موسویان)
برای آشنایی کامل با نحوه مرجع نویسی لطفا بخش راهنمای سیویلیکا (مرجع دهی) را ملاحظه نمایید.

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :

  • 1. Andrade JC, Sobral LA, Ares G and Deliza R (2016) ...
  • 2. Dunning KR, Cashman K, Russell DL, Thompson JG and Norman ...
  • 3. Eghbalsaied S, Amini H, Shahmoradi S and Farahi M (2014) ...
  • 4. Ghaffari M, Nejati-Javaremi A and Rahimi- Mianji G (2009) Lack ...
  • 5. Gottfredson R (2001) Hormonal control of ewe reproduction. Department of ...
  • 6. Hedayat-Evrigh N, Miraei-Ashtiani SR and Nejati-Javaremi A (2012) Investigate the possibility ...
  • 8. Jafari-Darehdor AH, Mohammadabadi MR, Esmailizadeh-Koshkoieh A and Riahi-Madvar A (2016) Investigating ...
  • 9. Khodabakhshzadeh R, Mohammadabadi MR, Esmailizadeh-Koshkoieh A, Moradi- Shahrebabak H, Bordbar F ...
  • 10. Kristensen SG, Andersen K, Clement CA, Franks S, Hardy K ...
  • 11. Liu Q, Pan Zh, Wang X, Hu W, Di ...
  • 12. Miao X and Luo Q (2013) Genome-wide transcriptome analysis between ...
  • 13. Miao X, Luo Q and Qin X (2015) Genome-wide transcriptome ...
  • 14. Miao YL and Williams CJ (2012) Calcium signaling in mammalian ...
  • 15. Mohammadabadi MR, Jafari-Darehdor AH and Bordbar F (2017) Molecular analysis ...
  • 16. Mohammadabadi MR and Sattayi-Mokhtari R (2013) Estimation of (co) variance ...
  • 17. Notter DR (2008) Genetic aspects of reproduction in sheep. Reproduction ...
  • 18. Pezeshki Najafabadi S, Masoudi AA, Shirazi A and Shariati P ...
  • 20. Pokharel K, Peippo J, Honkatukia M, Seppala A, Rautiainen J, ...
  • 21. Rossetti R, Ferrari I, Bonomi M and Persani L (2017) ...
  • 22. Sun QY, Fuchimoto D and Nagai T (2004) Regulatory roles ...
  • 23. Wang Z, Gerstein M and Snyder M (2009) RNASeq: a ...
  • 25. Zamani P, Akhondi M and Mohammadabadi MR (2015) Associations of ...
  • مدیریت اطلاعات پژوهشی

    صدور گواهی نمایه سازی | گزارش اشکال مقاله | من نویسنده این مقاله هستم

    اطلاعات استنادی این مقاله را به نرم افزارهای مدیریت اطلاعات علمی و استنادی ارسال نمایید و در تحقیقات خود از آن استفاده نمایید.

    علم سنجی و رتبه بندی مقاله

    مشخصات مرکز تولید کننده این مقاله به صورت زیر است:
    نوع مرکز: دانشگاه دولتی
    تعداد مقالات: 34,378
    در بخش علم سنجی پایگاه سیویلیکا می توانید رتبه بندی علمی مراکز دانشگاهی و پژوهشی کشور را بر اساس آمار مقالات نمایه شده مشاهده نمایید.

    به اشتراک گذاری این صفحه

    اطلاعات بیشتر درباره COI

    COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.

    کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.

    پشتیبانی