بررسی تنوع ژنتیکی و تجزیه ساختار جمعیت ژرم‌پلاسم انار شیرین ایران با استفاده از نشانگرهای SSR

سال انتشار: 1392
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: انگلیسی
مشاهده: 312

فایل این مقاله در 14 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

JR_JOAGK-5-4_010

تاریخ نمایه سازی: 15 آذر 1399

چکیده مقاله:

ایران یکی از بزرگترین تولید‌کنندگان و صادر‌کنندگان انار در دنیاست. هرچند تعداد گونه‌های جنس Punica بسیار کم است، تنوع مورفولوژیک بسیار بالایی در داخل ارقام و ژنوتیپ­های موجود در کشور مشاهده می‌شود. لذا بمنظور تفکیک ژرم­پلاسم غنی انار موجود در کشور، استفاده از نشانگرهای مناسب ضروری است. بهمین منظور در این مطالعه، 6 نشانگر چند شکل از میان 50 آغازگر ریزماهواره مورد بررسی، بر روی 194 نمونه موجود در ژرم­پلاسم انار شیرین مورد آزمایش قرار گرفتند. در مجموع تعداد 24 آلل­ مشاهده گردید که تعداد آن در هر مکان ژنی در دامنه­ای بین 2 تا 8 آلل قرار داشت. میانگین محتوای اطلاعات چندشکلی این آغازگرها 746/0 و میانگین ناخالصی 778/0 بدست آمد که ماهیت قوی نشانگرهای ریزماهواره را در بررسی روابط و تنوع ژنتیکی اثبات می­کند. تجزیه خوشه­بندیبا روش­های UPGMA و NJ٬ نرم افزار MEGA4 و تجزیه ساختار با روش Bayesian نرم افزار STRUCTURE2.3 و تجزیه به مختصات اصلی (PCoA) با نرم افزار NTSYS، بمنظور بررسی روابط ژنتیکی و ساختار جمعیت نمونه­ها انجام شد. بررسی نتایج تمامی روش­های ذکر شده نشان داد که طبقه­بندی ارقام و ژنوتیپ­های مورد مطالعه مستقل از منشا جغرافیایی و نام گذاری پیشنهادیشان می­باشد که این امر اختلاط شدید در ژرم­پلاسم انار شیرین موجود را اثبات می­نماید. بررسی مطالعه انجام شده وجود تنوع ژنتیکی بالایی را در ژرم­پلاسم انار شیرین ایران اثبات می­کند که می­تواند برای اهداف اصلاحی مورد توجه قرار گیرد.

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Behzadi Shahrbabaki H (1998). Genetic Diversity of Pomegranate Genotypes in ...
  • Currò S, Caruso M, Distefano G, Gentile A, La Malfa ...
  • Hasnaoui N, Buonamici A, Sebastiani F, Mars M, Trifi M, ...
  • Jbir R, Hasnaoui N, Mars M (2008). Characterization of Tunisian ...
  • Mars M, Marrakchi M (1999). Diversity of pomegranate (Punica granatum ...
  • Melchinger AE (1993). Use of RFLP markers for analyses of ...
  • Nei M (1972). Genetic distance between populations. American Naturalist. 106: ...
  • Pazouki L, Mardi M, Salehi Shanjani P, Hagidimitriou M, Pirseyedi ...
  • Pirseyedi S.M, Valizadegan S, Mardi M, Ghaffari M,  Mahmoodi P,  ...
  • Salehi Shanjani P, Mardi M, Pazouki L, Hagidimitriou M, Avanzato ...
  • Sarkhosh A, Zamani Z, Fatahi R, Ebadi A (2006). RAPD ...
  • Tamura K, Dudley J, Nei M, Kumar S (2007). MEGA4: ...
  • Zane L, Bargelloni L, Patarnello T (2002). Strategies for microsatellite ...
  • نمایش کامل مراجع