سیویلیکا را در شبکه های اجتماعی دنبال نمایید.

ارزیابی تنوع ژنتیکی و تعیین ساختار جمعیت ژنوتیپ های عدس با استفاده از نشانگر ریزماهواره

سال انتشار: 1399
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 570

فایل این مقاله در 18 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

JR_JOAGK-12-1_003

تاریخ نمایه سازی: 5 مرداد 1399

چکیده مقاله ارزیابی تنوع ژنتیکی و تعیین ساختار جمعیت ژنوتیپ های عدس با استفاده از نشانگر ریزماهواره

چکیده  هدف: عدس (Lens culinaris) سومین لگوم دانه­ای مهم در دنیا بعد از نخود و نخود فرنگی می­باشد. این مطالعه با اهداف (1) تعیین تنوع ژنتیکی و ساختار تغییرات مولکولی ژنوتیپ­ها و (2) شناسایی روابط بین ژنوتیپ­ها برای نگهداری، مدیریت و استفاده از این ژنوتیپ­ها در برنامه­های به­نژادی محصولات زراعی انجام شد. مواد و روش­ها: DNA ژنومی کل از برگ­های از هر ژنوتیپ با استفاده از پروتکل CTAB استخراج شد. پس از استخراج DNA ، نمونه­های DNA با استفاده از واکنش زنجیره­ای پلیمراز (PCR) تکثیر شدند. ارزیابی تنوع ژنتیکی 90 ژنوتیپ عدس با استفاده از 30 نشانگر SSR انجام شد. نتایج: در مجموع 145 آلل چندشکل با میانگین 83/4 آلل به ازای هر جفت آغازگر تکثیر شد. بالاترین تعداد آلل به نشانگر SSR80 با 8 آلل و کمترین آن به SSR96 ،  SSR204 ،215 SSR و SSR233 نشانگر با 3 آلل اختصاص داشت. میزان اطلاعات چندشکلی برای نشانگرها بین 83/0 تا 35/0 با میانگین 63/0 بود. بیشترین و کمترین میزان محتوای اطلاعات چندشکلی به نشانگر SSR80 و نشانگر SSR28 به ترتیب تعلق داشت. مقدار شاخص شانون از 94/1 (برای نشانگرSSR80 ) تا 829/0 (برای نشانگر SSR48) متغیر بود. هتروز یگو سیتی مور د انتظار  در ژنوتیپ­ها دامنه­ای از 845/0 ( SSR80) و کمترین آن 422/0 (SSR48) مشاهده شد. میانگین این شاخص 643/0 به دست آمد. تجزیه خوشه­ای با روش مبتنی بر فاصله Neihbour-Joining  و تجزیه ساختار جمعیت با روش مبتنی بر مدل Bayesian انجام شد. بهترین تعداد زیر جمعیت 3 عدد شناسایی شد، که در زیرجمعیتها افرد بر اساس مناطق جغرافیایی از یکدیگر تفکیک نشدند. نتیجه­گیری: نتایج این مطالعه نشان داد که نشانگر SSR کارایی بالایی برای ارزیابی ژنوتیپ­های مختلف دارد. این نشانگر توانست تمامی ژنوتیپ­ها را به خوبی از هم تفکیک کنند. 

کلیدواژه های ارزیابی تنوع ژنتیکی و تعیین ساختار جمعیت ژنوتیپ های عدس با استفاده از نشانگر ریزماهواره:

نویسندگان مقاله ارزیابی تنوع ژنتیکی و تعیین ساختار جمعیت ژنوتیپ های عدس با استفاده از نشانگر ریزماهواره

جواد سرومیلی

گروه علوم و بیوتکنولوژی گیاهی، دانشکده ی علوم و فناوری زیستی، دانشگاه شهید بهشتی تهران

عباس سعیدی

استاد بیوتکنولوژی گیاهی، دانشکده علوم و فناوری زیستی، دانشگاه شهید بهشتی، تهران، ایران.

ناصر فرخی

سرپرست گروه پژوهشی زیست فناوری

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
لاهوت فرزان، زین العابدینی مهرشاد، کریمی جابر، شهبازی مریم، صادق ...
Anderson A, Churchill GA, Autrique JE et al. (1993) Optimizing ...
Das B, Sengupta S, Parida SK et al. (2013) Genetic ...
Datta S, Kaashyap M, Gupta P (2015) Development of EST ...
Dikshit HK, Singh A, Singh D et al. (2015) Genetic ...
FAOSTAT, 2011 Agricultural Data on Primary Crops, FAO. ...
Ghaffari P, Talebi R, Keshavarz F (2014) Genetic diversity and ...
Hajibarat Z, Saidi A, Hajibarat Z, Talebi R (2014) Genetic ...
Hajibarat Z, Saidi A, Hajibarat Z, Talebi R (2015) Characterization ...
Jannatabadi AA, Talebi R, Armin M et al. (2014) Genetic ...
Jin LI, Jian-Ping GU, Dong-Xu XU et al. (2008) Genetic ...
Idrissi O, Udupa SM, Houasli C et al. (2015) Genetic ...
Khaidizar MI, Haliloglu K, Elkoca E et al. (2012) Genetic ...
Khazaei H, Caron CT, Fedoruk M et al. (2016) Genetic ...
Kumar S, Rajendran K, Kumar J et al. (2015) Current ...
Lahoot F, Zeinolabedini M, Karimi J et al. (2016) Assessment ...
Lombardi M, Materne M, Cogan NO et al. (2014) Assessment ...
Parida SK, Kumar KA, Dalal V et al. (2006) Unigene ...
Pritchard JK, Stephens M, Donnelly P (2000) Inference of population ...
Reddy MRK, Rathour R, Kumar N et al. (2010) Cross-genera ...
Saeed A, Hovsepyan H, Darvishzadeh R et al. (2011) Genetic ...
Saghai-Maroof MA, Soliman KM, Jorgensen, RA Allard RW (1984). Ribosomal ...
Saidi A, Eghbalnegad Y, Hajibarat Z (2017). Study of genetic ...
Sonnante G, Pignone D (2001). Assessment of genetic variation in ...
Verma P, Sharma TR, Srivastava PS et al. (2014) Exploring ...
Yeh FC, Boyle T (1997). POPGENE version 1.2, Microsoft Windows-based ...
Zhou G, Chen Y, Yao W et al. (2012) Genetic ...
نمایش کامل مراجع