ارزیابی تنوع ژنتیکی و تعیین ساختار جمعیت ژنوتیپ های عدس با استفاده از نشانگر ریزماهواره
محل انتشار: فصلنامه بیوتکنولوژی کشاورزی، دوره: 12، شماره: 1
سال انتشار: 1399
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 570
فایل این مقاله در 18 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد
- صدور گواهی نمایه سازی
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
JR_JOAGK-12-1_003
تاریخ نمایه سازی: 5 مرداد 1399
چکیده مقاله ارزیابی تنوع ژنتیکی و تعیین ساختار جمعیت ژنوتیپ های عدس با استفاده از نشانگر ریزماهواره
چکیده هدف: عدس (Lens culinaris) سومین لگوم دانهای مهم در دنیا بعد از نخود و نخود فرنگی میباشد. این مطالعه با اهداف (1) تعیین تنوع ژنتیکی و ساختار تغییرات مولکولی ژنوتیپها و (2) شناسایی روابط بین ژنوتیپها برای نگهداری، مدیریت و استفاده از این ژنوتیپها در برنامههای بهنژادی محصولات زراعی انجام شد. مواد و روشها: DNA ژنومی کل از برگهای از هر ژنوتیپ با استفاده از پروتکل CTAB استخراج شد. پس از استخراج DNA ، نمونههای DNA با استفاده از واکنش زنجیرهای پلیمراز (PCR) تکثیر شدند. ارزیابی تنوع ژنتیکی 90 ژنوتیپ عدس با استفاده از 30 نشانگر SSR انجام شد. نتایج: در مجموع 145 آلل چندشکل با میانگین 83/4 آلل به ازای هر جفت آغازگر تکثیر شد. بالاترین تعداد آلل به نشانگر SSR80 با 8 آلل و کمترین آن به SSR96 ، SSR204 ،215 SSR و SSR233 نشانگر با 3 آلل اختصاص داشت. میزان اطلاعات چندشکلی برای نشانگرها بین 83/0 تا 35/0 با میانگین 63/0 بود. بیشترین و کمترین میزان محتوای اطلاعات چندشکلی به نشانگر SSR80 و نشانگر SSR28 به ترتیب تعلق داشت. مقدار شاخص شانون از 94/1 (برای نشانگرSSR80 ) تا 829/0 (برای نشانگر SSR48) متغیر بود. هتروز یگو سیتی مور د انتظار در ژنوتیپها دامنهای از 845/0 ( SSR80) و کمترین آن 422/0 (SSR48) مشاهده شد. میانگین این شاخص 643/0 به دست آمد. تجزیه خوشهای با روش مبتنی بر فاصله Neihbour-Joining و تجزیه ساختار جمعیت با روش مبتنی بر مدل Bayesian انجام شد. بهترین تعداد زیر جمعیت 3 عدد شناسایی شد، که در زیرجمعیتها افرد بر اساس مناطق جغرافیایی از یکدیگر تفکیک نشدند. نتیجهگیری: نتایج این مطالعه نشان داد که نشانگر SSR کارایی بالایی برای ارزیابی ژنوتیپهای مختلف دارد. این نشانگر توانست تمامی ژنوتیپها را به خوبی از هم تفکیک کنند.
کلیدواژه های ارزیابی تنوع ژنتیکی و تعیین ساختار جمعیت ژنوتیپ های عدس با استفاده از نشانگر ریزماهواره:
نویسندگان مقاله ارزیابی تنوع ژنتیکی و تعیین ساختار جمعیت ژنوتیپ های عدس با استفاده از نشانگر ریزماهواره
جواد سرومیلی
گروه علوم و بیوتکنولوژی گیاهی، دانشکده ی علوم و فناوری زیستی، دانشگاه شهید بهشتی تهران
عباس سعیدی
استاد بیوتکنولوژی گیاهی، دانشکده علوم و فناوری زیستی، دانشگاه شهید بهشتی، تهران، ایران.
ناصر فرخی
سرپرست گروه پژوهشی زیست فناوری
مراجع و منابع این مقاله:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :