ورود
مقالات فارسیISIکنفرانسهاژورنالها

فراتحلیل (متا-آنالیز) داده های بیان ژن بافت پستان آلوده شده با باکتری اشریشیاکلی در گاوهای شیری

محل انتشار: فصلنامه علوم دامی ایران، دوره: 48، شماره: 3
سال انتشار: 1396
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 367

فایل این مقاله در 10 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:
https://civilica.com/doc/1015766

شناسه ملی سند علمی:

JR_IJAS-48-3_004

تاریخ نمایه سازی: 6 خرداد 1399

چکیده مقاله:

تشخیص ژن های درگیر در صفات پیچیده مانند حساسیت به بیماری نه تنها می تواند موجب بهبود تشخیص و پیشگیری از بیماری مورد نظر می شود، بلکه در انتخاب راه های درمانی کارآمد و همچنین در انتخاب دام های مقاوم به اصلاحگران کمک خواهد کرد. در این تحقیق با هدف بالا بردن توان تجزیه آماری در شناسایی ژن ها و مسیرهای زیستی (بیولوژیکی) درگیر در بیماری ورم پستان، از فراتحلیل به روش Fisherبرای یکی کردن p-value های به دست آمده از تجزیه انفرادی داده های شش بررسی ریزآرایه که بیان ژن بافت پستان هنگام درگیری با باکتری اشریشیاکلی (E. coli) در گاوهای شیری را بررسی کرده بودند، استفاده شد. شناسایی ژن هایی که در هیچ یک از بررسی های انفرادی معنی­دار نشده بودند می­تواند تاییدکننده هدف بیان شده باشد که منجر به ارائه مجموعه کامل تری از مسیرهای زیستی مرتبط با سامانه ایمنی، التهاب، تجزیه پروتئین (پروتئولیز) و مسیرهای مرتبط با رشد و افزونش و مرگ یاخته ای شد. کنترل مثبت بیان پروموتور RNA پلیمراز II مسیر جدیدی در رابطه با این بیماری است که با وجود در بر گرفتن بیشترین شمار ژن در این بررسی ، در بررسی های گذشته مرتبط با ورم پستان گزارش نشده است.

کلیدواژه ها:

نویسندگان

سمیه شریفی

دانشجوی دکتری، دانشکده کشاورزی دانشگاه صنعتی اصفهان، اصفهان

عباس پاکدل

دانشیار، دانشکده کشاورزی، دانشگاه صنعتی اصفهان، اصفهان

اسماعیل ابراهیمی

دانشیار، گروه بیوتکنولوژی دانشگاه شیراز و عضو گروه تحقیقاتی دانشگاه آدلاید- استرالیا

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Abernethy, T. J. & Avery, O. T. (1941). The Occurrence ...
  • Bannerman, D. D. (2009). Pathogen-dependent induction of cytokines and other ...
  • Bannerman, D. D., Paape, M. J., Hare, W. R. & ...
  • Blum, J. W., Dosogne, H., Hoeben, D., Vangroenweghe, F., Hammon, ...
  • Borenstein, M., Hedges, L. V., Higgins, J. P. T. & ...
  • Brand, B., Hartmann, A., Repsilber, D., Griesbeck-Zilch, B., Wellnitz, O., ...
  • Buitenhuis, B., Rontved, C. M., Edwards, S. M., Ingvartsen, K. ...
  • Clark, D. P. & Pazdernik, N. J. (2012). Molecular Biology. ...
  • Elmore, S. (2007). Apoptosis: A Review of Programmed Cell Death. ...
  • Fierro, A. C., Vandenbussche, F., Engelen, K., de Peer, Y. ...
  • Fisher, R. A. (1950). Statistical methods for research workers. Edinburgh: ...
  • Fuda, N. J., Ardehali, M. B. & Lis, J. T. ...
  • Genini, S., Badaoui, B., Sclep, G., Bishop, S. C., Waddington, ...
  • Gentleman, R., Carey, V., Huber, W., Irizarry, R. & Dudoit, ...
  • Guenther, M. G., Levine, S. S., Boyer, L. A., Jaenisch, ...
  • Gunther, J., Esch, K., Poschadel, N., Petzl, W., Zerbe, H., ...
  • Gunther, J., Petzl, W., Zerbe, H., Schuberth, H. J., Koczan, ...
  • Hagiwara, S., Mori, K. & Nagahata, H. (2016). Predictors of ...
  • Halasa, T., Huijps, K., Osteras, O. & Hogeveen, H. (2007). ...
  • Hedges L. & Olkin I. (1980) Vote-counting methods in research ...
  • Hiss, S., Mielenz, M., Bruckmaier, R. M. & Sauerwein, H. ...
  • Hochberg, Y. & Benjamini, Y. (1990). More powerful procedures for ...
  • Hong, F., Breitling, R., McEntee, C. W., Wittner, B. S., ...
  • Huang, D. W., Sherman, B. T. & Lempicki, R. A. ...
  • Huang, D. W., Sherman, B. T. & Lempicki, R. A. ...
  • Imtiyaz, H. Z. & Simon, M. C. (2010). Hypoxia-inducible factors ...
  • Irizarry, R. A., Bolstad, B. M., Collin, F., Cope, L. ...
  • Jiang, L., Sorensen, P., Rontved, C., Vels, L. & Ingvartsen, ...
  • Johnson, W. E., Li, C. & Rabinovic, A. (2007). Adjusting ...
  • Jorgensen, H. B., Buitenhuis, B., Rontved, C. M., Jiang, L., ...
  • Mitterhuemer, S., Petzl, W., Krebs, S., Mehne, D., Klanner, A., ...
  • Moreau, Y., Aerts, S., De Moor, B., De Strooper, B. ...
  • Mysorekar, I. U., Mulvey, M. A., Hultgren, S. J. & ...
  • Ramasamy, A., Mondry, A., Holmes, C. C. & Altman, D. ...
  • Rhodes, D. R., Barrette, T. R., Rubin, M. A., Ghosh, ...
  • Riollet, C., Rainard, P. & Poutrel, B. (2000). Differential induction ...
  • Schukken, Y. H., Gunther, J., Fitzpatrick, J., Fontaine, M. C., ...
  • Sipka, A., Klaessig, S., Duhamel, G. E., Swinkels, J., Rainard, ...
  • Thulasiraman, P., Mukherjee, J., Banerjee, D., Pandiyan, G. D. V., ...
  • Uthaisangsook, S., Day, N. K., Bahna, S. L., Good, R. ...
  • Wang, X., Kang, D. D., Shen, K., Song, C., Lu, ...
  • Xia, J., Fjell, C. D., Mayer, M. L., Pena, O. ...
  • Yin, L., Coelho, S. G., Valencia, J. C., Ebsen, D., ...
    • نمایش کامل مراجع