Publisher of Iranian Journals and Conference Proceedings

Please waite ..
ناشر تخصصی کنفرانسهای ایران
ورود |عضویت رایگان |راهنمای سایت |عضویت کتابخانه ها
عنوان
مقاله

RNAseq Reveals Novel and Differentially Expressed Isoforms In Native and Commercial Poultry

مجله سلول و تحقیقات مولکولی، دوره: 9، شماره: 1
سال انتشار: 1396
کد COI مقاله: JR_JCMR-9-1_003
زبان مقاله: انگلیسیمشاهده این مقاله: 214
فایل این مقاله در 7 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

خرید و دانلود فایل مقاله

با استفاده از پرداخت اینترنتی بسیار سریع و ساده می توانید اصل این مقاله را که دارای 7 صفحه است به صورت فایل PDF در اختیار داشته باشید.
آدرس ایمیل خود را در کادر زیر وارد نمایید:

مشخصات نویسندگان مقاله RNAseq Reveals Novel and Differentially Expressed Isoforms In Native and Commercial Poultry

Ayeh Sadat Sadr - Department of Animal Sciences, Faculty of Agriculture, Ferdowsi University of Mashhad, Mashhad, Iran
Mohammadreza Nassiri - Department of Horticulture, Faculty of Agriculture, University of Tehran, Tehran, Iran
Seyed Alireza Salami - Department of Animal and Poultry Science, College of Aburaihan, University of Tehran, Pakdasht, Tehran, Iran
Mohammad Reza Bakhtiarizadeh - Department of Animal and Poultry Science, College of Aburaihan, University of Tehran, Pakdasht, Tehran, Iran
Mojtaba Tahmoorespur - Department of Animal Sciences, Faculty of Agriculture, Ferdowsi University of Mashhad, Mashhad, Iran

چکیده مقاله:

The poultry industry occupies an important position in the provision of animal protein. Recently, next generation sequencing technology (RNA-Seq) has become available as a powerful tool to investigate transcriptional profiles for gene expression analysis of many organisms. The main use of RNA-Seq in agriculture species are focusing on finding the immune related genes or pathways by comparison of the whole transcriptome following pathogen challenge. Alternative splicing (AS) is the major fundamental mechanism generating the protein diversity and regulating the gene expression in eukaryotic organism. Identifying genes that are differentially spliced between two groups of RNA-sequencing samples is interesting subject in transcriptome with next-generation sequencing technology in this study used RNA sequencing to comparison isoforms of two breeds. A total of 64,819 transcripts were identified by aligning sequence reads to genome among the evaluated isoforms for expression analysis, 310 were significantly differentially expressed between two breeds, including 251 up-regulated and 59 down-regulated. The KEGG results of up regulated isoforms showed that that no pathway was found significantly different (FDR ≤ 0.05). However, enrichment analysis suggested that seven were over-represented (P-value ≤ 0.05) within the up regulated isoforms. Only one of them functionally related to immune system, natural killer cell mediated cytotoxicity. The results showed genes which are breed-specific expression and the comparative transcriptome analysis help to understand the difference of genetic mechanism.

کلیدواژه ها:

کد مقاله/لینک ثابت به این مقاله

کد یکتای اختصاصی (COI) این مقاله در پایگاه سیویلیکا JR_JCMR-9-1_003 میباشد و برای لینک دهی به این مقاله می توانید از لینک زیر استفاده نمایید. این لینک همیشه ثابت است و به عنوان سند ثبت مقاله در مرجع سیویلیکا مورد استفاده قرار میگیرد:

https://civilica.com/doc/1004865/

نحوه استناد به مقاله:

در صورتی که می خواهید در اثر پژوهشی خود به این مقاله ارجاع دهید، به سادگی می توانید از عبارت زیر در بخش منابع و مراجع استفاده نمایید:
Sadr, Ayeh Sadat and Nassiri, Mohammadreza and Salami, Seyed Alireza and Bakhtiarizadeh, Mohammad Reza and Tahmoorespur, Mojtaba,1396,RNAseq Reveals Novel and Differentially Expressed Isoforms In Native and Commercial Poultry,https://civilica.com/doc/1004865

در داخل متن نیز هر جا که به عبارت و یا دستاوردی از این مقاله اشاره شود پس از ذکر مطلب، در داخل پارانتز، مشخصات زیر نوشته می شود.
برای بار اول: (1396, Sadr, Ayeh Sadat؛ Mohammadreza Nassiri and Seyed Alireza Salami and Mohammad Reza Bakhtiarizadeh and Mojtaba Tahmoorespur)
برای بار دوم به بعد: (1396, Sadr؛ Nassiri and Salami and Bakhtiarizadeh and Tahmoorespur)
برای آشنایی کامل با نحوه مرجع نویسی لطفا بخش راهنمای سیویلیکا (مرجع دهی) را ملاحظه نمایید.

مدیریت اطلاعات پژوهشی

صدور گواهی نمایه سازی | گزارش اشکال مقاله | من نویسنده این مقاله هستم

اطلاعات استنادی این مقاله را به نرم افزارهای مدیریت اطلاعات علمی و استنادی ارسال نمایید و در تحقیقات خود از آن استفاده نمایید.

علم سنجی و رتبه بندی مقاله

مشخصات مرکز تولید کننده این مقاله به صورت زیر است:
نوع مرکز: دانشگاه دولتی
تعداد مقالات: 32,968
در بخش علم سنجی پایگاه سیویلیکا می توانید رتبه بندی علمی مراکز دانشگاهی و پژوهشی کشور را بر اساس آمار مقالات نمایه شده مشاهده نمایید.

مقالات مرتبط جدید

به اشتراک گذاری این صفحه

اطلاعات بیشتر درباره COI

COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.

کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.

پشتیبانی