Dynamic Simulation and Mechanical Properties of Microtubules

سال انتشار: 1395
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: انگلیسی
مشاهده: 256

فایل این مقاله در 7 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

JR_JSMA-8-4_008

تاریخ نمایه سازی: 12 اسفند 1398

چکیده مقاله:

This work is conducted to obtain mechanical properties of microtubule. For this aim, interaction energy in alpha-beta, beta-alpha, alpha-alpha, and beta-beta dimers was calculated using the molecular dynamic simulation. Force-distance diagrams for these dimers were obtained using the relation between potential energy and force. Afterwards, instead of each tubulin, one sphere with 55 KDa weight connecting to another tubulin with a nonlinear connection such as nonlinear spring could be considered. The mechanical model of microtubule was used to calculate Young’s modulus based on finite element method. Obtained Young’s modulus has good agreement with previous works. Also, natural frequency of microtubules was calculated based on finite element method.

نویسندگان

M Motamedi

Faculty of Engineering, University of Shahreza, P. O. Box ۸۶۱۴۹-۵۶۸۴۱, Isfahan, Iran

M Mosavi Mashhadi

Department of Mechanical Engineering, University of Tehran, P.O. Box ۱۱۳۶۵-۴۵۶۳, Tehran, , Iran

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Yiting D., Zhiping X., 2011, Mechanics of microtubules from a ...
  • Downing K.H. , Nogales E., 1998, New insights into microtubule ...
  • David S., Nathan A., Andrew J., 2003, The physical basis ...
  • Lin Y., Gijsje H., Frederick C., David A., 2007, Viscoelastic ...
  • Chretien D., Fuller S.D., 2000, Microtubules switch occasionally into unfavorable ...
  • Iva M.T., 2008, Push-me-pull-you: how microtubules organize the cell interior, ...
  • Chrétien D., Wade R.H., 1991, New data on the microtubule ...
  • Nogales E., Wolf S. G., Downing K. H., 1998, Structure ...
  • Li H., DeRosier D.J., Nicholson W.V., Nogales E., Downing K.H., ...
  • Löwe J., Li H., Downing K. H., Nogales E., 2001, ...
  • De Pablo P.J., Schaap I. A.T., MacKintosh F.C., Schmidt C. ...
  • Ja´nosi M., Chre´tien D., Flyvbjerg H., 2002, Structural microtubule cap: ...
  • Ying X., Dong X., Jie L., 2007, Computational Methods for ...
  • Karplus M., McCammon J.A., 2002, Molecular dynamics simulations of biomolecules, ...
  • Zeiger A.S., Layton B.E., 2008, Molecular modeling of the axial ...
  • Bekir A., Ömer C., 2014, Mechanical analysis of isolated microtubules ...
  • Kis A., Kasas S., Babic B., Kulik A.J., Benoit W., ...
  • Kasas S., Kis A., Riederer B. M., Forro L., Dietler ...
  • Nogales E., Whittaker M., Milligan R. A., Downing K. H., ...
  • Howard J., 2001, Mechanics of Motor Proteins and the Cytoskeleton, ...
  • Dominguez C., Boelens R., Bonvin A.M.J.J., 2003, HADDOCK: a protein-protein ...
  • Pronk S., Páll S., Schulz R., Larsson P., Bjelkmar P., ...
  • Walter R.P., Philippe H. , Ilario G., Alan E., Salomon ...
  • Berendsen H.J.C., Postma J.P.M., DiNola A., Haak J.R., 1984, Molecular ...
  • Meriam J., Kraige L., 2012, Engineering Mechanics-Dynamic, Wiley, 7 edition. ...
  • Russell C., 2013, Mechanics of Materials, Prentice Hall, 9 edition. ...
  • Gitte F., Mickey B., Nettleton J., Howard J., 1993, Flexural ...
  • Mickey B., Howard J., 1995, Rigidity of microtubules is increased ...
  • نمایش کامل مراجع