شناسایی ژن کلیدی SMT1 دخیل در مسیر بیوسنتزی دایوسجنین در شنبلیله Trigonella foenum-graecum L.

شنبلیله گیاهی یکساله متعلق به خانواده بقولات است. مهمترین ساپوژنینهای استروئیدی حاصل از ساپونین-های شنبلیله شامل دایوسجنین و یاموجنین میباشند. بذرهای شنبلیله دارای ویژگیهای ضددیابت، ضددرد و اثراتی از قبیل ضدسرطان، کاهش دهنده کلسترول و قند خون است. شنبلیله به عنوان منبع مهم اقتصادی برای تولید موسیلاژ )گالاکتومانان(، تریگونلین و دایوسجنین در صنایع داروسازی اهمیت دارد. یکی از ژنهای مهم در مسیر بیوسنتزی دایوسجنین ژن استرول متیل ترانسفراز )SMT1( میباشد. در این تحقیق ابتدا توالیهای مشابه در ژن مورد نظر از گیاهان دیگر جمعآوری شد سپس با انجام همردیفی بین آن ژنها و خوانشهای حاصل از پروژههای RNA-seq این گیاه در پایگاه SRA/NCBI با کمک برنامه Off line blast خوانشهای مشابه گردآوری و سرهمبندی آن خوانشها با کمک برنامه Codoncode Aligner انجام شد. پس از تایید توالی ژن مذکور دو جفت پرایمر بر اساس نواحی ORF پیش بینی شده و طراحی پرایمر صورت گرفت. در ادامه پس از استخراج RNA و سنتز cDNA و با انجام واکنش زنجیره ای پلیمراز به شناسایی ژن مورد نظر در شنبلیله پرداخته شد. پس از بررسی اولیه محصولات واکنش زنجیرهای پلیمراز با ژل الکتروفورز، برای تایید نهایی، توالی یابی صورت گرفت. پس از توالی یابی و همردیفی توالی به دست آمده با توالی های پایگاه NCBI مشخص شد که ژن مورد نظرSMT1 است.

کلیدواژه ها:

شنبلیله ، دایوسجنین ، شناسایی ژن