چالش های ممکن در آنالیز های داده های ریزماهواره برای مطالعات ژنتیک جمعیت

سال انتشار: 1398
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 442

فایل این مقاله در 13 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

ICSDA04_0364

تاریخ نمایه سازی: 4 دی 1398

چکیده مقاله:

ریزماهواره ها یا توالی کوتاه تکراری (SSR) نوع بی نظیری از تکرارهای پشت سرهم توالی ژنومی هستند که به فراوانی در طول ژنوم پراکنده شده اند و همچنین میزان بالایی از پلی مورفیسم را نشان می دهند. ریزماهواره ها می توانند به عنوان یک ابزار قوی برای تشخیص الگوهای جمعیت و فرایندها در زیست شناسی انسانی و سیستم های غیرانسانی عمل کنند آنها نشانگرهای هم بارزی از اندازه ی نسبتا کوچکی هستند که به راحتی در PCR تکثیر می شوند. این ویژگی ها موجب شده است تا این نشانگرها به طور گسترده در زمینه های ژنتیک جمعیت و حفاظت مورد استفاده قرار گیرند. ویژگی کلیدی ریزماهواره ها به عنوان نشانگرهای مولکولی، بی ثباتی بالای آنها به علت میزان بالای جهش و در نتیجه تنوع زیاد آنها در گونه ها و جمعیت هاست. از محدودیت ها و مشکلات کار با ریزماهواره ها می توان به مواردی همچون تعیین توالی، اشتباهات آلل خوانی، ایجاد آلل های نول، هموپلاسی اندازه اشاره کرد. در این مطالعه به بررسی محدودیت های نشانگر ریزماهواره در مطالعات ژنتیک جمعیت پرداخته شده است.

نویسندگان

شیرین محمودی

دانشجوی دکتری مهندسی محیط زیست دانشگاه تهران

حمیدرضا کبیری بالاجاده

دانش آموخته مهندسی منابع طبیعی محیط زیست گرایش زیستگاه ها و توع زیستی