بررسی تنوع جدایه های Pseudomonas syringae درختان میوه هسته دار شمال غرب و شرق کشور

شانکر باکتریایی که توسط باکتری Pseudomonas syringae pv. syringae ایجاد میشود از جمله مهمترین بیماریهای درختان میوه هسته دار در سراسر جهان است. در بهار سال 1395، 15 منطقه در استان آذربایجان غربی از سه شهر (ارومیه، سلماس، مهاباد) انتخاب شدند. در هر منطقه چهارباغ و از هر باغ به طور تصادفی از شش درخت نمونه برداری انجام شد. 203 جدایه از بافتهای آلوده شامل: برگ، جوانه و سرشاخه جدا گردید و خصوصیات فنوتیپی و ژنوتیپی آنها موردبررسی قرار گرفت. عامل بیماری، بر اساس آزمونهای لوپات شناسایی شد. طبق نتایج به دست آمده 60 جدایه، به عنوان Pss جهت بررسی فاکتورهایی مانند آزمون اثبات بیماریزایی، توانایی تولید توکسین، تحرک، هسته یخ، کاتالاز و بررسیهای ژنتیکی، انتخاب شدند. بیماریزایی انجام شده بر روی برگ یاس نشان داد که از بین 60 جدایه، 42 جدایه دارای قدرت بیماری زایی و مقدار کاتالاز زیاد و 18 جدایه دارای قدرت بیماریزایی و کاتالاز کم بودند. همچنین سایر فاکتورهای بررسی شده نیز با بیماریزایی ارتباط داشتند ولی گاهی برخی فاکتورها قدرت کمتری نسبت به سایرین داشتند که از میان آنها کاتالاز به عنوان مهمترین و موثرترین فاکتور در شدت بیماریزایی باکتری مشخص شد. جهت شناسایی ارتباط ژنتیکی بین جدایه ها، DNA ژنومی آنها استخراج و در واکنش زنجیره ای پلیمراز (PCR) از روش Rep-PCR و آغازگرهای BOX-A1R استفاده شد که از ضریب تشابه Jacard برای تعیین تشابه جدایه ها و همچنین روش UPGMA و نرم افزار NTYSYS-pc 2.02 نسخه جهت ترسیم درخت تبارزایی استفاده شد. این پژوهش، ارتباط بین شدت بیماریزایی جدایه های عامل شانکر درختان میوه هسته دار را با میزان تولید کاتالاز نشان داد که اکثر جدایه هایی که دارای میزان کاتالاز زیاد و قدرت بیماریزایی بالا بودند در یک گروه ژنوتیپی قرار گرفتند.