بررسی ساختار ژنومی خانواده ژنهای mlo در گیاه هلو Prunus persica

خانواده ژنهای mlo گروهی از پروتئینهای گیاهی را کد میکنند که داری هفت دومین فراغشایی حفاظت شده هستند و همچنین در انتقال سیگنال وابسته به کلسیم و کالمودیوم نقش دارند. برخی اعضا خانواده ژنهای mlo باعث ایجاد حساسیت در برابر قارچهای عامل سفیدک پودری میشوند. برخی از ژنهای موتانت mlo میتوانند منجر به مقاومت در برابر قارچهای عامل سفیدک پودری شوند. با توجه به در دسترس بودن اطلاعات ژنومی تعداد زیادی از گیاهان و پیشرفت ابزارهای بیوانفورماتیکی میتوان راهکارهای مناسب جهت شناسایی و بررسی ژنهای mlo دخیل در مقاومت بهره جست. در این تحقیق با استفاده از ابزارهای بیوانفورماتیکی، 18 توالی پروتئینی در درخت هلو P. persica شناسایی شد. برای جستجو در پایگاه داده توالیهای mlo مربوط به Arabidopsis thaliana بهعنوان الگو جهت blastP استفاده شد، سپس توالیهای با یکسانی بیش از (e-value: 5e- %40 79) و همپوشانی بیش از %50 برای بررسیهای بیشتر انتخاب شدند. توالیهای انتخابشده برای وجود دومین mlo در نرم افزار تحت وب Pfam موردبررسی قرار گرفتند و اطلاعاتی از قبیل وزن مولکولی و نقطه ایزو الکتریک در نرم افزار تحت وب Proto Parm تعیین شد. همه توالیهای موردبررسی دارای دومین mlo بودند و طول آنها برابر با 378 تا 487 آمینواسید بود. دامنه بیشترین و کمترین وزن مولکولی 44/31-56/99 و نقطه ایزو الکتریک 8/06-9/61 بود. برای بررسی روابط فیلوژنتیکی توالیها، درخت فیلوژنتیکی مربوط به آنها با استفاده از نرم افزار MEGA7.0 با استفاده از روش اتصال همسایه و بوت استرپ 1000 رسم شد همچنین به منظور بررسی تنوع ساختار و پیشبینی کاربرد توالیهای موردبررسی، موتیفهای حفاظت شده با استفاده از نرم افزار تحت وب MEME ترسیم شد. نتایج حاکی از شباهت بالای توالیهای موردبررسی بود و تعداد موتیف های حفظ شده در توالیهای موردبررسی از 7 تا 9 موتیف در هر توالی بود. توالیهای نوکلئوتیدی به دست آمد و محل آنها روی هر کروموزوم مشخص شد. توزیع ژنهای موردبررسی رو کروموزومها نشان داد که توالیها به صورت تصادفی روی هر هشت کروموزوم پخش شده بودند و تعداد توالی به نسبت هر کروموزوم از 1 توالی (در کروموزوم های 3 و (8 تا 4 توالی (در کروموزوم های 4 و (6 مختلف بود.