تمییز آلل های MHC سگ (DLA-DRB1) با روش تحلیل دقیق دمای شکافت DNA

زمینه مطالعه: نقش مهم مولکول های مجتمع عمده پذیرش بافتی (MHC) اتصال به پپتید های پادگنی و عرضه آن ها به لنفوسیت های T است. از اینرو تنوع MHC با حساسیت و یا مقاومت در برابر بسیاری از بیماری های عفونی و بیماری های خودایمن مرتبط است. یک روش نوین بررسی تنوع ژنتیکی، تحلیل دقیق دمای شکافت (HRM-High Resolution Melting) DNA است که می توان آنرا برای بررسی تنوع MHC به کار برد. هدف: تمییز آلل های MHC سگ (DLA-DRB1) با روش تحلیل دقیق دمای شکافت DNA روش کار: تعداد 40 نمونه خون از سگ های ارجاعی به بیمارستان دام های کوچک دانشکده دامپزشکی دانشگاه تهران جمع آوری گردید. پس از استخراج DNA و افزوده سازی اگزون دوم ژن DLA-DRB1، تحلیل HRM و منحنی ذوب صورت گرفت. برای تطبیق الگوهای HRM با توالی نوکلئوتیدی آلل ها، از روش تعیین توالی مستقیم استفاده شد. نتایج: بر اساس تنوع مشاهده شده در نتایج HRM و منحنی ذوب، 40 نمونه به 8 ژنوتیپ (A تا H) قابل تقسیم بندی بودند. بیشترین فراوانی مربوط به تیپ A (00/25 %) و سپس تیپ C و E (هر کدام 00/15 %) بود. در مجموع 5/82 % نمونه ها هتروزیگوت و 5/17 % نمونه ها هوموزیگوت بودند. نتیجه گیری: مطالعه حاضر اولین مطالعه ای است که برای تایپیگ آلل های ژن DLA-DRB1 از تکنیک HRM استفاده شده است. تطبیق نتایج HRM با توالی آلل ها نشان داد که این روش می تواند برای تفکیک آلل های DLA-DRB1 به کار رود.

کلیدواژه ها:

مجتمع عمده پذیرش بافتی ، سگ ، DLA-DRB1 ، تحلیل دقیق دمای شکافت