ناشر تخصصی کنفرانس های ایران

لطفا کمی صبر نمایید

Publisher of Iranian Journals and Conference Proceedings

Please waite ..
CIVILICAWe Respect the Science
ناشر تخصصی کنفرانسهای ایران
عنوان
مقاله

Enterobacterial Repetitive Intergenic Consensus Polymerase Chain Reaction (ERIC-PCR) Genotyping of Escherichia coli Strains Isolated from Different Animal Stool Specimens

سال انتشار: 1396
کد COI مقاله: JR_IJP-12-1_004
زبان مقاله: انگلیسیمشاهد این مقاله: 192
فایل این مقاله در 10 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

خرید و دانلود فایل مقاله

با استفاده از پرداخت اینترنتی بسیار سریع و ساده می توانید اصل این مقاله را که دارای 10 صفحه است به صورت فایل PDF در اختیار داشته باشید.
آدرس ایمیل خود را در کادر زیر وارد نمایید:

مشخصات نویسندگان مقاله Enterobacterial Repetitive Intergenic Consensus Polymerase Chain Reaction (ERIC-PCR) Genotyping of Escherichia coli Strains Isolated from Different Animal Stool Specimens

Reza Ranjbar - Molecular Biology Research Center, Baqiyatallah University of Medical Sciences, Tehran, Iran
Afsar Tabatabaee - Dept. of Microbiology, Zanjan Branch, Islamic Azad University, Zanjan, Iran
Payam Behzadi - Dept. of Microbiology, College of Basic Sciences, Shahr Qods Branch, Islamic Azad University, Tehran, Iran
Rohollah Kheiri - Water Quality Control Office, Alborz Province Water and Wastewater Company, Karaj, Iran

چکیده مقاله:

Background: Escherichia coli is a commensal-pathogenic organism, which includes a wide range of strains. Despite several advanced molecular-genomic technologies for detecting and identifying different strains of E. coli, Enterobacterial Repetitive Intergenic Consensus Polymerase Chain Reaction (ERIC-PCR) technique is a quick, sharp and cost effective fingerprint method. The major purpose of the present study was to determine the distribution of ERICs within E. coli strains isolated from different healthy animal stool specimens including hens, sheep, and cows, as an appropriate and quick molecular-genomic tool. Methods: The animal stool samples were obtained during 1 year (October 2012 to October 2013), from animal husbandries around Tehran and Alborz provinces, Iran. After screening processes, the E. coli bacteria were isolated and cultured via standard microbiological methods. The DNA molecules of E. coli bacteria were harvested and Enterobacterial Repetitive Intergenic Consensus Polymerase Chain Reaction (ERIC-PCR) was applied for bacterial molecular genotyping. The ERIC-PCR products were run on 1% gel electrophoresis. The final images regarding gel electrophoresis banding patterns were used for dendrogram generation via the GelClust software. Results: Of 120 isolated samples, 115 different strains were recognized as E. coli. The fingerprint patterns involved 380 to 3280 bp bands. The predominant bands included 2900 bp, 1200 bp, and 1200 bp in stool samples of hens, sheep, and cows, respectively. The highest frequencies and diversities were seen among E. coli strains isolated from hens and sheep stool samples. Conclusion: The DNA profiles were clearly detectable via specific fingerprint patterns. The ERIC-PCR seemed to be a good approach for molecular typing of E. coli strains isolated from different animal sources.

کلیدواژه ها:

Escherichia coli, Consensus Sequence, Polymerase chain reaction, DNA Fingerprinting

کد مقاله/لینک ثابت به این مقاله

برای لینک دهی به این مقاله می توانید از لینک زیر استفاده نمایید. این لینک همیشه ثابت است و به عنوان سند ثبت مقاله در مرجع سیویلیکا مورد استفاده قرار میگیرد:

https://civilica.com/doc/930281/

نحوه استناد به مقاله:

در صورتی که می خواهید در اثر پژوهشی خود به این مقاله ارجاع دهید، به سادگی می توانید از عبارت زیر در بخش منابع و مراجع استفاده نمایید:
Ranjbar, Reza and Tabatabaee, Afsar and Behzadi, Payam and Kheiri, Rohollah,1396,Enterobacterial Repetitive Intergenic Consensus Polymerase Chain Reaction (ERIC-PCR) Genotyping of Escherichia coli Strains Isolated from Different Animal Stool Specimens,,,,,https://civilica.com/doc/930281

در داخل متن نیز هر جا که به عبارت و یا دستاوردی از این مقاله اشاره شود پس از ذکر مطلب، در داخل پارانتز، مشخصات زیر نوشته می شود.
برای بار اول: (1396, Ranjbar, Reza؛ Afsar Tabatabaee and Payam Behzadi and Rohollah Kheiri)
برای بار دوم به بعد: (1396, Ranjbar؛ Tabatabaee and Behzadi and Kheiri)
برای آشنایی کامل با نحوه مرجع نویسی لطفا بخش راهنمای سیویلیکا (مرجع دهی) را ملاحظه نمایید.

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود ممقالهقاله لینک شده اند :

  • Clermont O, Olier M, Hoede C, Diancourt L, Brisse S, ...
  • Rasko DA, Rosovitz M, Myers GS, Mongodin EF, Fricke WF, ...
  • Wan L, Wang Z-B, Yan Q, Wang X, Lei Y, ...
  • Touchon M, Hoede C, Tenaillon O, Barbe V, Baeriswyl S, ...
  • Momtaz H, Karimian A, Madani M, Safarpoor Dehkordi F, Ranjbar ...
  • Anvarinejad M, Farshad S, Ranjbar R, Giammanco G, Alborzi A, ...
  • Behzadi P, Behzadi E, Ranjbar R. IL-12 Family Cytokines: General ...
  • Farshad S, Ranjbar R, Japoni A, Hosseini M, Anvarinejad M, ...
  • Behzadi P, Behzadi E. The microbial agents of urinary tract ...
  • Laboratory of Dr. Shariati Hospital, Tehran, Iran. Turk Klin Tip ...
  • Jahandeh N, Ranjbar R, Behzadi P, Behzadi E. Uropathogenic Escherichia ...
  • Behzadi P, Najafi A, Behzadi E, Ranjbar R. Microarray long ...
  • Escherichia coli: an in-silico DNA marker extraction. CEJU 2016;69:105-11. ...
  • Behzadi P, Behzadi E. Environmental Microbiology. 1st ed. Tehran: Niktab ...
  • Meacham KJ, Zhang L, Foxman B, Bauer RJ, Marrs CF. ...
  • Behzadi P, Behzadi E, Ranjbar R. Basic Modern Molecular Biology. ...
  • Behzadi P, Ranjbar R, Alavian SM. Nucleic Acid-Based Approaches for ...
  • De Gregorio E, Silvestro G, Petrillo M, Carlomagno MS, Di ...
  • J Bacteriol 2005;187(23):7945-54. ...
  • Ramazanzadeh R, Zamani S, Zamani S. Genetic diversity in clinical ...
  • Ranjbar R, Naghoni A, Yousefi S, Ahmadi A, Jonaidi N, ...
  • Ranjbar R, Torabi R, Mirzaie A. Molecular typing of Salmonella ...
  • Ranjbar R, Karami A, Farshad S, Giammanco GM, Mammina C. ...
  • Leung KT, Mackereth R, Tien Y-C, Topp E. A comparison ...
  • Dalla-Costa LM, Irino K, Rodrigues J, Rivera IN, Trabulsi L. ...
  • Wilson LA, Sharp PM. Enterobacterial repetitive intergenic consensus (ERIC) sequences ...
  • Hulton C, Higgins C, Sharp P. ERIC sequences: a novel ...
  • Hosseini MJ, Kaffashian AR. An outbreak of shigellosis due to ...
  • Soltani M, Peighambari SM, AskariBadouei M, Sadrzadeh A. Molecular typing ...
  • Fox JT, Renter DG, Sanderson MW, Thomson DU, Lechtenberg KF, ...
  • Versalovic J, Koeuth T, Lupski R. Distribution of repetitive DNA ...
  • Versalovic J, Schneider M, De Bruijn FJ, Lupski JR. Genomic ...
  • Szczuka E, Kaznowski A. Typing of clinical and environmental Aeromonas ...
  • MuniRA, Al–Alak SK, Hassan AS, Atia IM. Antibiogram Typing and ...
  • Khakabimamaghani S, Najafi A, Ranjbar R, Raam M. GelClust: a ...
  • Pavlopoulos GA, Soldatos TG, Barbosa-Silva A, Schneider R. A reference ...
  • Simona E-S, Diana P, Robertina I, Ionela A, Ileana S, ...
  • Adzitey F, Huda N, Ali GRR. Molecular techniques for detecting ...
  • Wassenaar TM, Newell DG. Genotyping of Campylobacter spp. Appl Environ ...
  • Elboutahiri N, Thami-Alami I, Zaïd E, Udupa SM. Genotypic characterization ...
  • Wei G, Pan L, Du H, Chen J, Zhao L. ...
  • Laciar A, Vaca L, Lopresti R, Vega A, Mattana C, ...
  • Sankarasubramanian J, Vishnu US, Sridhar J, Gunasekaran P, Rajendhran J. ...
  • Davis J, Akella S, Waddell P, editors. Accelerating phylogenetics computing ...
  • Ranjbar R, Ghazi FM. Antibiotic sensitivity patterns and molecular typing ...
  • Casarez EA, Pillai SD, Di Giovanni GD. Genotype diversity of ...
  • Casarez EA, Pillai SD, Mott JB, Vargas M, Dean KE, ...
  • Lipman LJ, de Nijs A, Lam TJ, Gaastra W. Identification ...
  • مدیریت اطلاعات پژوهشی

    صدور گواهی نمایه سازی | گزارش اشکال مقاله | من نویسنده این مقاله هستم

    اطلاعات استنادی این مقاله را به نرم افزارهای مدیریت اطلاعات علمی و استنادی ارسال نمایید و در تحقیقات خود از آن استفاده نمایید.

    علم سنجی و رتبه بندی مقاله

    مشخصات مرکز تولید کننده این مقاله به صورت زیر است:
    نوع مرکز: علوم پزشکی
    تعداد مقالات: 1,246
    در بخش علم سنجی پایگاه سیویلیکا می توانید رتبه بندی علمی مراکز دانشگاهی و پژوهشی کشور را بر اساس آمار مقالات نمایه شده مشاهده نمایید.

    به اشتراک گذاری این صفحه

    اطلاعات بیشتر درباره COI

    COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.

    کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.

    پشتیبانی