Publisher of Iranian Journals and Conference Proceedings

Please waite ..
ناشر تخصصی کنفرانسهای ایران
ورود |عضویت رایگان |راهنمای سایت |عضویت کتابخانه ها
عنوان
مقاله

Reconstruction of selected microbiome-phage interaction network from human gut

هشتمین همایش بیوانفورماتیک ایران
سال انتشار: 1397
کد COI مقاله: IBIS08_066
زبان مقاله: انگلیسیمشاهده این مقاله: 524
نسخه کامل این مقاله ارائه نشده است و در دسترس نمی باشد

مشخصات نویسندگان مقاله Reconstruction of selected microbiome-phage interaction network from human gut

mohadese Naseri - ۱Department of Biophysica ,Tarbiat dares modares University . tehran . P.O. Box:۱۴۱۱۵-۱۱۱.Iran
Javad Zahiri - ۲Department of Biophysica ,Tarbiat dares modares University . tehran . P.O. Box:۱۴۱۱۵-۱۱۱.Iran
Bita Bakhshi
Shahriar Arab

چکیده مقاله:

Abstract: The Human Microbiome is the collection of all the microorganisms living in association with the human body. These communities consist of a variety of microorganisms including eukaryotes, archaea, bacteria and viruses1. Advances in DNA sequencing technologies have created a new field of research, called metagenomics, allowing comprehensive examination of microbial communities, without the need for cultivation. Particularly, microbial diversity can be determined using two different approaches: (1) Amplicon sequencing or (2) Shotgun metagenomics2. In the second approach, shotgun metagenomics can help to reconstruct large fragments or even complete genomes from organisms in a community without previous isolation3. Due to the important role that microbiome interaction may play in T2D and related diseases, we focused on it and implemented a network-based analytical approach to describe phage-bacteria network diversity throughout the human body. We built these community networks using a machine learning algorithm to predict which phages could infect which bacteria in a given microbiome. Accurate feature extraction and bacteria-phage interaction prediction is important for identifying new probable hosts. The main purpose of this study is to provide a network of phage-microbiome interactions based on metagenomics data.

کلیدواژه ها:

کد مقاله/لینک ثابت به این مقاله

کد یکتای اختصاصی (COI) این مقاله در پایگاه سیویلیکا IBIS08_066 میباشد و برای لینک دهی به این مقاله می توانید از لینک زیر استفاده نمایید. این لینک همیشه ثابت است و به عنوان سند ثبت مقاله در مرجع سیویلیکا مورد استفاده قرار میگیرد:

https://civilica.com/doc/908729/

نحوه استناد به مقاله:

در صورتی که می خواهید در اثر پژوهشی خود به این مقاله ارجاع دهید، به سادگی می توانید از عبارت زیر در بخش منابع و مراجع استفاده نمایید:
Naseri, mohadese and Zahiri, Javad and Bakhshi, Bita and Arab, Shahriar,1397,Reconstruction of selected microbiome-phage interaction network from human gut,Eighth Bioinformatics Conference of Iran,Zabol,https://civilica.com/doc/908729

در داخل متن نیز هر جا که به عبارت و یا دستاوردی از این مقاله اشاره شود پس از ذکر مطلب، در داخل پارانتز، مشخصات زیر نوشته می شود.
برای بار اول: (1397, Naseri, mohadese؛ Javad Zahiri and Bita Bakhshi and Shahriar Arab)
برای بار دوم به بعد: (1397, Naseri؛ Zahiri and Bakhshi and Arab)
برای آشنایی کامل با نحوه مرجع نویسی لطفا بخش راهنمای سیویلیکا (مرجع دهی) را ملاحظه نمایید.

مدیریت اطلاعات پژوهشی

صدور گواهی نمایه سازی | گزارش اشکال مقاله | من نویسنده این مقاله هستم

اطلاعات استنادی این مقاله را به نرم افزارهای مدیریت اطلاعات علمی و استنادی ارسال نمایید و در تحقیقات خود از آن استفاده نمایید.

مقالات مرتبط جدید

طرح های پژوهشی مرتبط جدید

به اشتراک گذاری این صفحه

اطلاعات بیشتر درباره COI

COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.

کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.

پشتیبانی