مطالعه روابط تکاملی و فیلوژنتیکی ژن گلوتاتیون پراکسیداز-1 در جمعیت های خزک و راس 308

سال انتشار: 1397
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 290

فایل این مقاله در 17 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

JR_JAP-20-2_003

تاریخ نمایه سازی: 11 تیر 1398

چکیده مقاله:

استرس گرمایی یکی از مهمترین عوامل استرس­زای محیطی است که تولید طیور در دنیا به خصوص در مناطق گرم همانند استان سیستان و بلوچستان در ایران را با چالش همراه کرده است. استرس گرمایی موجب افزایش تولید رادیکال­های آزاد در بدن پرندگان می­شود. گلوتاتیون پراکسیداز نقش مهمی به عنوان آنتی­اکسیدان سلولی در استرس گرمایی ایفا می­کند. هدف از انجام این پژوهش، تجزیه تکاملی و فیلوژنتیک توالی نوکلئوتیدی GPX-1 در دو جمعیت راس 308 و خزک بود. نمونه­های خون از 10 پرنده از دو جمعیت خزک و راس 308 به طور تصادفی جمع­آوری شد (پنج قطعه از خزک و پنج قطعه راس 308). DNA از خون کامل استخراج شد. تکثیر PCR قطعه 800 جفت بازی از GPX-1 با استفاده از یک جفت پرایمر اختصاصی انجام گرفت. سپس محصول تکثیر برای توالی­یابی DNA ارسال شد. همردیفی توالی قطعات GPX-1 در مجموع نه هاپلوتیپ و 13 ناحیه متغیر را نمایان ساخت. از 13 ناحیه چندشکل، پنج ناحیه جهش­های نقطه­ای بودند. ترسیم درخت فیلوژنتیک تشابه ژنتیکی بالایی را در بین دو جمعیت مورد مطالعه نشان داد، اما تفرق در درون جمعیت­ها نشان می­دهد که امکان بهبود، تغییرات ژنتیکی و افزایش مقاومت به استرس­های محیطی در نتیجه انتخاب وجود دارد. نتایج فاصله ژنتیکی و نواحی چند­شکل GPX-1 در گونه های مختلف درخت فیلوژنتیک را تایید نمودند. مطالعه فرآیندهای انتخاب مثبت نشان داد که انتخاب و تکامل نقش مهمی در فهم نقش زیستی این ژن دارند.

نویسندگان

رخساره نجم الدینی

گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه زابل، زابل، ایران

غلامرضا داشاب

هیات علمی دانشگاه زابل، تخصص: ژنتیک و اصلاح نژاد دام/ ژنتیک کمی/ ژنومیکس و انتخاب ژنومیک/ مکان یابی ژنی

مهدی وفای واله

گروه علوم دامی ، دانشکده کشاورزی، دانشگاه زابل

نصرالله مرادی کر

دانشگاه علوم پزشکی سمنان

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • بررسی اثر ریز ساختار آرد (میکرواکستراکچر) بر رنگ آن با استفاده از تکنیک پردازش تصویر [مقاله کنفرانسی]
  • Ahmadi Mazjin M, Salehi Z, and Bahadori M (2015) The ...
  • Aris-Brosou S, and Yang Z (2012) Effects of models of ...
  • Bjedov S, Ljubojević DB, Milošević N, Stanaćev V, Đukić-Stojčić M ...
  • Brigelius-Flohe R and Kipp A (2009) Glutathione peroxidases in different ...
  • Brigelius-Flohe R and Maiorino M (2013) Glutathione peroxidases. Biochimica et Biophysica Acta. ...
  • Cao XL, Zhao MF, Li DG, Xing Y, Zhang YC, ...
  • Cardoso BR, Busse AL, Hare DJ, Cominetti C, Horst MA, ...
  • Conrad M and Friedmann Angeli JP (2015) Glutathione peroxidase 4 ...
  • Conrad M, Moreno SG, Sinowatz F, Ursini F, Kolle S, Roveri A, Brielmeier M, Wurst W, Maiorino M ...
  • Conrad M, Schneider M, Seiler A and Bornkamm GW (2007) Physiological role of ...
  • Drummond AJ, Nicholls GK, Rodrigo AG and Solomon W (2011) ...
  • Foster CB, Aswath K, Chanock SJ, McKay HF and Peters ...
  • Fukuhara R and Kageyama T (2003) Tissue distribution, molecular cloning, ...
  • Gugliandolo A, Gangemi C, Calabro C, Vecchio M, Di Mauro ...
  • Hao S, Hu J, Song S, Huang D, Xu H, ...
  • Havenstein GB, Ferket PR and Qureshi MA (2003) Carcass composition ...
  • Ichimura Y, Habuchi T, Tsuchiya N, Wang L, Oyama C, ...
  • Jablonska E, Gromadzinska J, Peplonska B, Fendler W, Reszka E ...
  • Kalkan G, Seckin HY, Benli I, Akbaş A, Bas Y ...
  • Kidir V, Uz E, Yigit A, Altuntas A, Yigit B, ...
  • Korber B )2000( HIV Signature and Sequence Variation Analysis. Computational ...
  • Li GZ, Liang XF, Yao W, Liao WQ and Zhu ...
  • Librado PR and Rozas J (2009) DnaSP v5: software for ...
  • Mandal S, Yadav S, Yadav S and Nema RK (2009) ...
  • Mao J, Vanderlelie J, Perkins AV, Redman CW, Ahmadi KR ...
  • Margis R, Dunand C, Teixeira FK and Margis-Pinheiro M (2008) ...
  • Najafi M, Ghasemi H, Roustazadeh A and Farajollahi M (2014) ...
  • Namakparvar R, Shariatmadari F and Hossieni SH (2014) Strain and ...
  • Nei M and Kumar S (2000) Molecular evolution and phylogenetics. Oxford; New ...
  • Ngandu NK, Scheffler K, Moore P, Woodman Z, Martin D ...
  • Petersen G and Seberg O (2003) Phylogenetic analyses of the ...
  • Phuphuakrat A and Auewarakul P (2003) Heterogeneity of HIV-1 Rev ...
  • Sabet EE, Salehi Z, Khodayari S, Zarafshan SS and Zahiri ...
  • SattinG, Bakiu R, Tolomeo AM, Carraro A, Coppola D, Ferro D, Patarnello T and ...
  • Tamura K, Stecher G, Peterson D, Filipski A and Kumar ...
  • Tamura T, McMicken HW, Smith CV and Hansen TN (1997) ...
  • Vernet P, Rigaudiere N, Ghyselinck N, Dufaure JP, Drevet JR ...
  • Wingler K, Böcher M, Flohé L, Kollmus H, Brigelius-Flohé R (1999) mRNA stability and ...
  • Yamashita Y, Yabu T, Touhata K and Yamashita M (2012) ...
  • Zhang C, Fan X, Yu HQ, Zhang HQ, Wang XL ...
  • Zhang JX, Wang ZM, Zhang JJ, Zhu LL, Gao XF ...
  • نمایش کامل مراجع