توپولوژی ساختار دامین اتصال مولیبدوپترین در گزانتین اکسیداز انسانی

سابقه و هدف: دامین ها اساس واحدهای عملکردی پروتیین ها هستند. اطلاعات برهمکنش دامین-دامین برای فهم حزییات بر همکنش های پروتیین - پروتیین، عملکرد سلول و فرآیندهای بیولوژیکی مطلوب است. آنزیم های مولیبدوپترین در محدوده وسیعی از سیستم های حیاتی در دهه های مختلف شناسایی شده اند. این آنزیم ها نه تنها تسهیم کننده مشترک دورنمای ساختاری، بلکه آشکار کننده توپولوژی های تاخوردگی پلی پپتیدهای متفاوت می باشند.مواد و روش ها: بر اساس توالی های مترادف، 6 خانواده از آنزیمها مشمول کوفاکتور مولیبدنیم مشخص شده است. دامین های ساختاری متمرکز شده، شاخص روشنی را برای ارتباطات ساختاری فراهم می کنند که ناشی از نتایج درختچه های فیلوژنی به عنوان انعکاسی از عملکرد می باشد. اغلب این فرآیند از مقایسه پروفایل های توالی پروتیین یا مدل های مخفی مارکوف حاصل می شود. توانایی روش های پیشگویی را با استفاده از محل های برهمکنش به عنوان تداخل های هدف نشان می دهیم.نتایج: امکان پیش گویی محل های برهمکنش دامین با صحت و درستی زیاد با استفاده از اطلاعات توالی است. نتیجه گیری: این الگوریتم ها و آنالیزهای ارایه شده، پیشرفت شاخصی از توانایی مدل را برای تعیین دامین اتصال مولیبدوپترین و درک بیشتری از ارتباط بین تکامل توالی متمرکز شده و خواص ساختمان – عمل پروتیین ها فراهم می کند

کلیدواژه ها:

برهمکنش دامین- دامین ، مولیبدوپترین ، مدل های مخفی مارکوف