بررسی سه جدایه ویروس وای سیب زمینی جداشده از استان خوزستان بر پایه ژن پروتیین پوششی

ویروس وای سیب زمینی (Potato virus Y, PVY) یکی از ویروس های مهم زیانبار با دامنه میزبانی گسترده است. در این پژوهش باتوجه به شناسایی ویروس وای سیب زمینی و جداسازی آن از کشتزارهای شلغم استان خوزستان در سال زراعی 1392 ، ویژگیهای سهجدایه انتخابی از شهرستانهای دزفول، شوشتر و شوش (7Tu ، 9Tu و 10Tu) بررسی شد. در آزمون تعیین دامنه میزبانی، سه جدایهروی گیاهانی متعلق به سه خانواده Chenopodiaceae, Solanaceae و Amaranthaceae، به صورت مکانیکی مایه زنی شدند. هر سهجدایه روی سیب زمینی، گوجه فرنگی، فلفل، تاتوره و گل تکمه ای نشانه های موضعی و فراگیر )سیستمیک( ایجاد کردند ولی رویبوته های سلمه تره، نشانه هایی مشاهده نشد. در آزمون SDS-PAGE ، دو باند با اندازه حدود 33 و 31 کیلودالتونی در آموده خالص شدههر سه جدایه خالص سازی شده مشاهده شد. برای تعیین سویه جدایه های انتخابی از جفت آغازگرهای اختصاصی سویه PVY(CF/OR, NF/NR, OF/OR و PVY3TIM / PVNIBIP) که بر پایه ناحیه (CP) طراحی شده اند استفاده شد. در آزمون PCR باآغازگرهای اختصاصی سویه OR/OF)O) و سویه PVY3TIM) NTN و PVNIBIP) به ترتیب دو قطعه 608 و 1200 جفت بازی درهر سه جدایه افزایش شد. در ادامه، ناحیه CP هر سه جدایه ، افزایش، همسانه سازی و توالییابی شد. درنهایت با استفاده از مجموعنتایج به دست آمده از آزمونهای زیستی (بیولوژیکی) و بررسی توالی نوکلیوتیدی و آمینواسیدی مشخص شد که جدایه های 9Tu, 7Tuو 10Tu جداشده از کشتزارهای شلغم استان خوزستان بیشترین همسانی را با سویه های NTN و W ویروس PVY دارند. این نخستینگزارش از شناسایی ویروس وای سیب زمینی در کشتزارهای شلغم است.

کلیدواژه ها:

پروتیین پوششی ، شلغم ، ویروس وای سیب زمینی ، SDS-PAGE ، RT-PCR