ناشر تخصصی کنفرانس های ایران

لطفا کمی صبر نمایید

Publisher of Iranian Journals and Conference Proceedings

Please waite ..
CIVILICAWe Respect the Science
ناشر تخصصی کنفرانسهای ایران
عنوان
مقاله

In silico analysis of the miR-200 family target genes as diagnostic biomarkers in prostate cancer

سال انتشار: 1396
کد COI مقاله: IBIS07_197
زبان مقاله: انگلیسیمشاهد این مقاله: 203
متن کامل این مقاله منتشر نشده است و فقط به صورت چکیده یا چکیده مبسوط در پایگاه موجود می باشد.
توضیح: معمولا کلیه مقالاتی که کمتر از ۵ صفحه باشند در پایگاه سیویلیکا اصل مقاله (فول تکست) محسوب نمی شوند و فقط کاربران عضو بدون کسر اعتبار می توانند فایل آنها را دریافت نمایند.

مشخصات نویسندگان مقاله In silico analysis of the miR-200 family target genes as diagnostic biomarkers in prostate cancer

Maryam Khorasani - Department of Molecular Medicine, School of Medicine,Qazvin University of Medical Sciences, Qazvin, Iran
Shirin Shahbazi - Department of Medical Genetics, Faculty of Medical Sciences, Tarbiat Modares‎ University, Tehran, Iran
Maryam Abolhasani - Department of Pathology, Hasheminejad kidney Center, Tehran, Iran
Reza Mahdian - Molecular Medicine Department, Pasteur Institute of Iran, Tehran, Iran.

چکیده مقاله:

Prostate cancer is one of the common cancers in men worldwide [1]. Because of the diagnostic limitations of serum prostate-specific antigen (PSA) for the screening of prostate cancer, the use of alternative biomarkers with higher specificity and sensitivity is desired [2]. Recent molecular biology advances have revealed the signaling pathways involved in the initiation and progression of prostate cancer [3]. The epithelial-to-mesenchymal transition (EMT) is a key process in transformation of local tumors into metastatic cancer [4]. microRNAs are non-coding small RNAs that play regulatory role in the post-transcriptional level. They affect several biological processes via simultaneous regulation of multiple target genes [5]. The miR-200 family, including miR-200a, miR-200b, miR-200c, miR-141, and miR-429 regulates the EMT process [6]. Hence, the miR-200 family and their target genes can be candidates for diagnostic biomarkers in prostate cancer. On the other hand, bioinformatics computational tools with the ability to predict microRNAs target genes in silico have been widely developed [7-9]. Aim and Methods: The aim of this study was to predict miR-200 family target genes in prostate cancer. This study was based on binding affinity of miRNAs to the 3 UTR of target gene and overall scores determined by various online prediction tools. To predict the most relevant gene as potential targets for miR-200 family in silico, we investigated the has-miR-141-3p, has-miR-200a, has-miR-200b, has-miR-200c, has-miR-429 target genes by online prediction tools, including the miRWalk2.0, miRanda, TargetScan and RNA22[9,10]. Result: Among the genes that were suggested by the prediction tools, prostate cancer relevant genes with higher affinity scores were selected. Then, the genes which were targets of more than two miRNAs of the miR-200 family were picked up. The study of interaction between the selected genes and the signaling pathways involved in prostate cancer revealed E2F3, DLC1, CTBP2 and EP300 genes for further in vitro analysis.Conclusions: According to bioinformatics studies, miR-200 family members and their specific target genes can be potential diagnostic biomarkers in prostate cancer. However, more experimental investigation is needed to validate their specificity and sensitivity for clinical applications.

کلیدواژه ها:

Bioinformatics, miR-200 Family; Target Prediction; Prostate Cancer

کد مقاله/لینک ثابت به این مقاله

برای لینک دهی به این مقاله می توانید از لینک زیر استفاده نمایید. این لینک همیشه ثابت است و به عنوان سند ثبت مقاله در مرجع سیویلیکا مورد استفاده قرار میگیرد:

https://civilica.com/doc/712591/

نحوه استناد به مقاله:

در صورتی که می خواهید در اثر پژوهشی خود به این مقاله ارجاع دهید، به سادگی می توانید از عبارت زیر در بخش منابع و مراجع استفاده نمایید:
Khorasani, Maryam و Shahbazi, Shirin و Abolhasani, Maryam و Mahdian, Reza,1396,In silico analysis of the miR-200 family target genes as diagnostic biomarkers in prostate cancer,هفتمین همایش بیوانفورماتیک ایران,تهران,,,https://civilica.com/doc/712591

در داخل متن نیز هر جا که به عبارت و یا دستاوردی از این مقاله اشاره شود پس از ذکر مطلب، در داخل پارانتز، مشخصات زیر نوشته می شود.
برای بار اول: (1396, Khorasani, Maryam؛ Shirin Shahbazi و Maryam Abolhasani و Reza Mahdian)
برای بار دوم به بعد: (1396, Khorasani؛ Shahbazi و Abolhasani و Mahdian)
برای آشنایی کامل با نحوه مرجع نویسی لطفا بخش راهنمای سیویلیکا (مرجع دهی) را ملاحظه نمایید.

مدیریت اطلاعات پژوهشی

صدور گواهی نمایه سازی | گزارش اشکال مقاله | من نویسنده این مقاله هستم
این مقاله در بخشهای موضوعی زیر دسته بندی شده است:

اطلاعات استنادی این مقاله را به نرم افزارهای مدیریت اطلاعات علمی و استنادی ارسال نمایید و در تحقیقات خود از آن استفاده نمایید.

علم سنجی و رتبه بندی مقاله

مشخصات مرکز تولید کننده این مقاله به صورت زیر است:
نوع مرکز: علوم پزشکی
تعداد مقالات: 727
در بخش علم سنجی پایگاه سیویلیکا می توانید رتبه بندی علمی مراکز دانشگاهی و پژوهشی کشور را بر اساس آمار مقالات نمایه شده مشاهده نمایید.

به اشتراک گذاری این صفحه

اطلاعات بیشتر درباره COI

COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.

کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.

پشتیبانی