مطالعهی برهمکنشj 147 با پروتیینsirt1 توسط روش های محاسباتی

سال انتشار: 1396
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 328

فایل این مقاله در 11 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

DSCONF04_145

تاریخ نمایه سازی: 29 فروردین 1397

چکیده مقاله:

سیرتویین sirt1 در بافتهای مختلف انسان از جمله پوست وجود دارد. فعال کردن پروتیین sirt1 ، علاوه بر توقف روند پیری، باعث حفظ سلامت بدن و افزایش چشمگیر طول عمر میشود. پروتیین سیرتویین 1 یا sirt1 نقش مهمی در حفظ تعادل سوخت و ساز بدن در بافتهای مختلف ایفا کرده و فعال کردن آن باعث افزایش سطح سلامت کلی بدن میشود. در این مطالعه گیرنده به عنوان هدفی برای ترکیب j147 انتخاب گردید و با استفاده از روش محاسباتی برهمکنش sirt1 با j147 بررسی خواهیم شد. اگر این برهمکنش باعث فعال شدن sirt1 شود باعث توقف روند پیری و افزیش طول عمر میشود. مواد و روش ها ابتدا ساختار سه بعدی ترکیب j147 با استفاده از نرم افزار HyperChem بدست آورده شد و بعد این ساختار توسط Discovery Studio بهینه گردید و ساختار sirt از RCSB گرفته و با شبیه سازی شرایط سلولی sirt1 با ترکیب j147 واکنش داده شد. یافته ها ترکیب j147 که حاصل Docking توسط Discovery Studio دینامیک مولکولی بر اساس انرژی آزاد گیبس و نمودارهای RMSF و RMSD که در شرایط مختلف فشار، دما و تغییرات انرژی پتانسیل ، رفتار کمپلکس را نشان می دهد بررسی و تغییرات حاصل در sirt1 در اثر برهمکنش با j147 مشاهده و آنالیز گردید. نتیجه گیری اتصال j147 به پروتیین sirt1 موجب فعال نمودن sirt1 و افزایش پایداری بیان این آنزیم میشود و در کل میتواند باعث توقف روندپیری و افزیش طول عمر میشود.

کلیدواژه ها:

سیرتویین ، داکینگ مولکولی ، بانک ساختار سه بعدی پروتیین RCSB ، دینامیک مولکولی ، ترکیب j147

نویسندگان

احسان امینی

دانشجوی کارشناسی ارشد بیوشیمی دانشگاه آزاد سنندج

ساکو میرزایی

استادیار بیوشیمی دانشگاه آزاد سنندج